seq1 = pF1KE5721.tfa, 2070 bp
seq2 = pF1KE5721/gi568815594r_47836424.tfa (gi568815594r:47836424_48052701), 216278 bp

>pF1KE5721 2070
>gi568815594r:47836424_48052701 (Chr4)

(complement)

1-119  (100001-100119)   100% ->
120-236  (101233-101349)   100% ->
237-299  (102807-102869)   100% ->
300-341  (109290-109331)   100% ->
342-449  (109414-109521)   100% ->
450-557  (110554-110661)   100% ->
558-664  (111833-111939)   100% ->
665-2070  (114873-116278)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAACTATCCATGAAGAACAATATTATCAATACACAGCAGTCTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAACTATCCATGAAGAACAATATTATCAATACACAGCAGTCTTTTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACCATGCCCAATGTGATTGTACCAGATATTGAAAAGGAAATACGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACCATGCCCAATGTGATTGTACCAGATATTGAAAAGGAAATACGAAGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAAAATGGAGCATGCAG         CTCCTTTTCTGAGGATGATGAC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100101 TGGAAAATGGAGCATGCAGGTA...TAGCTCCTTTTCTGAGGATGATGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTGCCTCTACATCTGAAGAATCAGAGAATGAAAACCCTCATGCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101255 AGTGCCTCTACATCTGAAGAATCAGAGAATGAAAACCCTCATGCAAGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCCTTTAGTTATAAGTCACTCAGAAAGGGAGGACCATCACAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101305 TTCCTTTAGTTATAAGTCACTCAGAAAGGGAGGACCATCACAGAGGTG..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237     GGAGCAGTACCTGCCTGGTGCCATTGCACTTTTTAATGTGAACAAC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101355 .CAGGGAGCAGTACCTGCCTGGTGCCATTGCACTTTTTAATGTGAACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCAGCAATAAGGACCA         GGAACCAGAAGAAAAAAAGAAAAA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102853 AGCAGCAATAAGGACCAGTA...TAGGGAACCAGAAGAAAAAAAGAAAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GAAAAAAGAAAAGAAGAG         CAAGTCAGATGATAAAAACGAAA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 109314 GAAAAAAGAAAAGAAGAGGTA...CAGCAAGTCAGATGATAAAAACGAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATAAAAACGACCCAGAGAAGAAAAAGAAGAAAAAGGACAAAGAGAAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109437 ATAAAAACGACCCAGAGAAGAAAAAGAAGAAAAAGGACAAAGAGAAGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGAAAGAGGAGAAAAGCAAAGATAAGAAAGAAGA         GGAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 109487 AAGAAAGAGGAGAAAAGCAAAGATAAGAAAGAAGAGTA...TAGGGAGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GAAAGAAGTTGTGGTTATTGATCCCTCGGGAAACACATATTACAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110560 GAAAGAAGTTGTGGTTATTGATCCCTCGGGAAACACATATTACAACTGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGTTTTGCATCACATTACCTGTTATGTACAACTGGACAATGGTTATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110610 TGTTTTGCATCACATTACCTGTTATGTACAACTGGACAATGGTTATTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AG         AGCATGTTTTGATGAACTTCAATCTGATTACCTAGAATA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110660 AGGTG...TAGAGCATGTTTTGATGAACTTCAATCTGATTACCTAGAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TTGGCTCATTTTGGATTACGTATCAGACATAGTCTATTTAATCGATATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111872 TTGGCTCATTTTGGATTACGTATCAGACATAGTCTATTTAATCGATATGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TTGTACGAACAAGGACAG         GTTACCTAGAACAAGGACTGCTG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 111922 TTGTACGAACAAGGACAGGTA...TAGGTTACCTAGAACAAGGACTGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 GTAAAGGAAGAACTTAAACTCATAAATAAATATAAATCCAACTTGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114896 GTAAAGGAAGAACTTAAACTCATAAATAAATATAAATCCAACTTGCAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TAAACTTGATGTTCTGTCACTGATACCAACTGATTTGCTGTATTTTAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114946 TAAACTTGATGTTCTGTCACTGATACCAACTGATTTGCTGTATTTTAAGT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TAGGGTGGAACTATCCAGAAATTAGATTAAACAGGTTGTTACGGTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114996 TAGGGTGGAACTATCCAGAAATTAGATTAAACAGGTTGTTACGGTTCTCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CGTATGTTTGAGTTCTTCCAGAGAACAGAAACAAGGACAAACTATCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115046 CGTATGTTTGAGTTCTTCCAGAGAACAGAAACAAGGACAAACTATCCAAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CATCTTCAGGATTTCCAACCTTGTTATGTATATCGTCATCATTATCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115096 CATCTTCAGGATTTCCAACCTTGTTATGTATATCGTCATCATTATCCACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGAATGCATGTGTGTTCTACTCTATTTCTAAAGCTATTGGATTTGGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115146 GGAATGCATGTGTGTTCTACTCTATTTCTAAAGCTATTGGATTTGGAAAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GATACATGGGTCTACCCTGATATTAATGATCCTGAATTTGGCCGTTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115196 GATACATGGGTCTACCCTGATATTAATGATCCTGAATTTGGCCGTTTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TAGAAAATACGTATACAGCCTTTACTGGTCTACACTGACTTTGACTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115246 TAGAAAATACGTATACAGCCTTTACTGGTCTACACTGACTTTGACTACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TTGGTGAAACACCCCCTCCCGTGAGGGATTCTGAGTATGTCTTTGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115296 TTGGTGAAACACCCCCTCCCGTGAGGGATTCTGAGTATGTCTTTGTGGTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GTTGATTTCCTAATTGGAGTGTTAATTTTTGCTACCATCGTTGGTAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115346 GTTGATTTCCTAATTGGAGTGTTAATTTTTGCTACCATCGTTGGTAACAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 AGGTTCTATGATTTCCAACATGAATGCAGCCAGAGCAGAATTTCAAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115396 AGGTTCTATGATTTCCAACATGAATGCAGCCAGAGCAGAATTTCAAGCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 GAATTGATGCTATCAAGCAATATATGCATTTTCGAAATGTAAGCAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115446 GAATTGATGCTATCAAGCAATATATGCATTTTCGAAATGTAAGCAAAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 ATGGAAAAGAGGGTTATTAAATGGTTTGACTACCTGTGGACCAACAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115496 ATGGAAAAGAGGGTTATTAAATGGTTTGACTACCTGTGGACCAACAAAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AACAGTTGATGAGAAAGAAGTCTTAAAGTATCTACCTGATAAACTAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115546 AACAGTTGATGAGAAAGAAGTCTTAAAGTATCTACCTGATAAACTAAGAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 CAGAAATTGCCATCAACGTTCACTTAGACACATTAAAAAAGGTACGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115596 CAGAAATTGCCATCAACGTTCACTTAGACACATTAAAAAAGGTACGCATT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTTGCTGATTGTGAAGCTGGTCTGTTGGTGGAGTTGGTCTTGAAATTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115646 TTTGCTGATTGTGAAGCTGGTCTGTTGGTGGAGTTGGTCTTGAAATTGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 ACCCCAAGTCTACAGTCCTGGAGATTATATTTGCAAGAAAGGGGATATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115696 ACCCCAAGTCTACAGTCCTGGAGATTATATTTGCAAGAAAGGGGATATCG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 GACGAGAGATGTACATTATCAAGGAAGGCAAACTCGCTGTGGTGGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115746 GACGAGAGATGTACATTATCAAGGAAGGCAAACTCGCTGTGGTGGCAGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GATGGAGTCACTCAGTTTGTGGTATTGAGCGATGGCAGCTACTTCGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115796 GATGGAGTCACTCAGTTTGTGGTATTGAGCGATGGCAGCTACTTCGGTGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 GATCAGCATTCTTAACATTAAAGGGAGCAAAGCTGGCAATCGAAGAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115846 GATCAGCATTCTTAACATTAAAGGGAGCAAAGCTGGCAATCGAAGAACGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CCAATATTAAAAGTATTGGCTACTCAGACCTGTTCTGTCTCTCAAAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115896 CCAATATTAAAAGTATTGGCTACTCAGACCTGTTCTGTCTCTCAAAAGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 GACCTCATGGAAGCTCTAACTGAGTACCCAGATGCCAAAACTATGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115946 GACCTCATGGAAGCTCTAACTGAGTACCCAGATGCCAAAACTATGCTGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 AGAGAAAGGGAAGCAGATTTTAATGAAAGATGGTCTACTGGATCTAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115996 AGAGAAAGGGAAGCAGATTTTAATGAAAGATGGTCTACTGGATCTAAACA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1838 TTGCAAATGCTGGCAGTGATCCTAAAGATCTTGAAGAGAAGGTTACTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116046 TTGCAAATGCTGGCAGTGATCCTAAAGATCTTGAAGAGAAGGTTACTCGA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1888 ATGGAGGGGTCAGTAGACCTCCTGCAAACCAGGTTTGCCCGAATCTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116096 ATGGAGGGGTCAGTAGACCTCCTGCAAACCAGGTTTGCCCGAATCTTGGC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1938 TGAGTATGAGTCCATGCAGCAGAAACTGAAACAAAGATTAACCAAGGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116146 TGAGTATGAGTCCATGCAGCAGAAACTGAAACAAAGATTAACCAAGGTTG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1988 AGAAATTTCTGAAACCGCTTATTGACACAGAATTTTCAAGTATTGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116196 AGAAATTTCTGAAACCGCTTATTGACACAGAATTTTCAAGTATTGAGGGA

   2100     .    :    .    :    .    :
   2038 CCTGGAGCGGAAAGTGGGCCCATCGACTCTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 116246 CCTGGAGCGGAAAGTGGGCCCATCGACTCTACA