seq1 = pF1KE5716.tfa, 1821 bp
seq2 = pF1KE5716/gi568815592r_30446075.tfa (gi568815592r:30446075_30656203), 210129 bp

>pF1KE5716 1821
>gi568815592r:30446075_30656203 (Chr6)

(complement)

1-73  (100001-100073)   100% ->
74-239  (100484-100649)   100% ->
240-376  (101013-101149)   100% ->
377-528  (101289-101440)   100% ->
529-600  (101558-101629)   100% ->
601-808  (102647-102854)   99% ->
809-904  (103025-103120)   100% ->
905-1099  (103543-103737)   100% ->
1100-1278  (108674-108852)   100% ->
1279-1441  (108930-109092)   100% ->
1442-1582  (109368-109508)   100% ->
1583-1821  (109891-110129)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGAGGAAGAAGCCATTCAGCGTGAAGCAGAAGAAGAAGCAGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGAGGAAGAAGCCATTCAGCGTGAAGCAGAAGAAGAAGCAGTTGCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACAAACGGGAGCGGAAGAGAG         GGCTTCAAGATGGGCTGC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100051 GGACAAACGGGAGCGGAAGAGAGGTC...CAGGGCTTCAAGATGGGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCTCCAGTTCCAACAGCCGCAGCGGGAGCCGGGAGCGGCGAGAGGAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100502 GCTCCAGTTCCAACAGCCGCAGCGGGAGCCGGGAGCGGCGAGAGGAACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACCGACACCTCGGACGGGGAGTCTGTGACCCATCATATCCGCAGGCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100552 ACCGACACCTCGGACGGGGAGTCTGTGACCCATCATATCCGCAGGCTTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCAGCAGCCTTCTCAGGGGCTGGGTCCACGAGGCTACGACCCAAATCG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100602 CCAGCAGCCTTCTCAGGGGCTGGGTCCACGAGGCTACGACCCAAATCGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240        ATACCGACTGCATTTTGAGAGAGACAGCAGGGAGGAGGTAGAG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100652 G...TAGATACCGACTGCATTTTGAGAGAGACAGCAGGGAGGAGGTAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGAGAAAGAGAGCAGCCCGGGAGCAAGTTCTACAGCCGGTCAGTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101056 AGGAGAAAGAGAGCAGCCCGGGAGCAAGTTCTACAGCCGGTCAGTGCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTTGTTGGAGCTGGACATCCGGGAGGTGTATCAGCCTGGCTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 101106 GTTGTTGGAGCTGGACATCCGGGAGGTGTATCAGCCTGGCTCAGGTG...

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    377    TTCTGGACTTTCCTCGACGTCCTCCTTGGAGCTATGAGATGTCCAAG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 CAGTTCTGGACTTTCCTCGACGTCCTCCTTGGAGCTATGAGATGTCCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAGCAACTAATGAGCCAAGAGGAACGGAGCTTCCAAGACTATCTTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 GAGCAACTAATGAGCCAAGAGGAACGGAGCTTCCAAGACTATCTTGGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GATTCATGGGGCTTACTCCTCTGAGAAACTCAGCTACTTTGAGCACAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 GATTCATGGGGCTTACTCCTCTGAGAAACTCAGCTACTTTGAGCACAATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAG         ACATGGAGGCAGCTGTGGCGGGTGTTAGAGATGTCT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101436 TGGAGGTG...TAGACATGGAGGCAGCTGTGGCGGGTGTTAGAGATGTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GACATCGTCCTGCTTATCACTGATATCCGACATCCA         GTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101594 GACATCGTCCTGCTTATCACTGATATCCGACATCCAGTG...TAGGTTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GAATTTCCCGCCAGCACTTTATGAGTATGTGACTGGAGAACTTGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102652 GAATTTCCCGCCAGCACTTTATGAGTATGTGACTGGAGAACTTGGACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CCCTGGTGCTGGTTTTGAACAAGGTGGATCTGGCCCCGCCAGCTCTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102702 CCCTGGTGCTGGTTTTGAACAAGGTGGATCTGGCCCCGCCAGCTCTTGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTTGCCTGGAAGCATTATTTCCATCAACACTATCCCCAGCTCCACGTCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102752 GTTGCCTGGAAGCATTATTTCCATCAACACTATCCCCAGCTCCACGTCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTTTTCACCTCTTTTCCTCGGGACCCCCGCACCCCACAGGATCCTAGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
 102802 CCTTTTCACCTCTTTTCCTCGGGACCCCCGCACCCCACAGGACCCTAGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTG         TCTTGAAGAAGAGTCGGAGGCGGGGGAGAGGATGGACT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102852 GTGGTG...CAGTCTTGAAGAAGAGTCGGAGGCGGGGGAGAGGATGGACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CGGGCCCTGGGGCCAGAGCAGTTGCTGAGAGCCTGTGAAGCCATCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103063 CGGGCCCTGGGGCCAGAGCAGTTGCTGAGAGCCTGTGAAGCCATCACTGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGGGAAAG         TGGACTTGAGCAGCTGGCGGGAGAAGATTGCTC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 103113 GGGGAAAGGTA...CAGTGGACTTGAGCAGCTGGCGGGAGAAGATTGCTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GGGATGTGGCTGGGGCCACCTGGGGTAATGGCTCTGGGGAGGAGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103576 GGGATGTGGCTGGGGCCACCTGGGGTAATGGCTCTGGGGAGGAGGAGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGGAGGATGGCCCAGCAGTCCTGGTGGAGCAGCAGACTGATTCAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103626 GAGGAGGATGGCCCAGCAGTCCTGGTGGAGCAGCAGACTGATTCAGCAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAGCCAACTGGCCCAACCCAAGAGCGCTACAAGGATGGGGTGGTGACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103676 GGAGCCAACTGGCCCAACCCAAGAGCGCTACAAGGATGGGGTGGTGACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCGGCTGTGTGG         GTTTCCCTAATGTGGGAAAGTCCTCGCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103726 TCGGCTGTGTGGGTA...CAGGTTTCCCTAATGTGGGAAAGTCCTCGCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 ATCAATGGGCTGGTGGGGCGGAAAGTCGTGAGTGTCTCCAGAACCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108703 ATCAATGGGCTGGTGGGGCGGAAAGTCGTGAGTGTCTCCAGAACCCCGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 CCATACCCGATACTTTCAGACCTACTTTCTTACCCCCTCTGTGAAGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108753 CCATACCCGATACTTTCAGACCTACTTTCTTACCCCCTCTGTGAAGCTCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 GTGACTGCCCAGGCCTCATCTTCCCATCTCTTCTGCCTAGGCAGTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108803 GTGACTGCCCAGGCCTCATCTTCCCATCTCTTCTGCCTAGGCAGTTGCAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279          GTTCTGGCAGGGATCTACCCTATCGCCCAGATCCAGGAGCC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108853 GTA...CAGGTTCTGGCAGGGATCTACCCTATCGCCCAGATCCAGGAGCC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 CTACACTGCTGTGGGCTACCTGGCCTCCCGAATTCCCGTGCAGGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108971 CTACACTGCTGTGGGCTACCTGGCCTCCCGAATTCCCGTGCAGGCCCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCCACCTGCGCCACCCAGAGGCTGAGGACCCCTCAGCGGAACACCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109021 TCCACCTGCGCCACCCAGAGGCTGAGGACCCCTCAGCGGAACACCCCTGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 TGTGCCTGGGACATCTGTGAAG         CCTGGGCAGAGAAACGTGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109071 TGTGCCTGGGACATCTGTGAAGGTG...CAGCCTGGGCAGAGAAACGTGG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 TTACAAGACAGCCAAGGCGGCTCGGAATGATGTGTACAGAGCAGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109387 TTACAAGACAGCCAAGGCGGCTCGGAATGATGTGTACAGAGCAGCCAACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 GTCTCTTGCGGCTGGCAGTGGACGGCCGCCTCAGCCTGTGTTTTCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109437 GTCTCTTGCGGCTGGCAGTGGACGGCCGCCTCAGCCTGTGTTTTCATCCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 CCAGGCTACAGTGAACAGAAAG         GCACCTGGGAGTCCCATCC
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 109487 CCAGGCTACAGTGAACAGAAAGGTC...CAGGCACCTGGGAGTCCCATCC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 AGAGACCACGGAGCTGGTGGTTTTGCAGGGCAGGGTGGGGCCAGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109910 AGAGACCACGGAGCTGGTGGTTTTGCAGGGCAGGGTGGGGCCAGCAGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 ACGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGCTGAGCAGCTCCTGTGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109960 ACGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAAGAGCTGAGCAGCTCCTGTGAGGAGGAG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GGAGAGGAGGACCGGGATGCGGATGAGGAGGGAGAAGGGGATGAGGAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110010 GGAGAGGAGGACCGGGATGCGGATGAGGAGGGAGAAGGGGATGAGGAGAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 CCCAACCTCGGCTCCAGGGTCCAGCCTGGCTGGCCGAAACCCTTATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110060 CCCAACCTCGGCTCCAGGGTCCAGCCTGGCTGGCCGAAACCCTTATGCCC

   1900     .    :    .    :
   1802 TGCTGGGTGAGGATGAGTGC
        ||||||||||||||||||||
 110110 TGCTGGGTGAGGATGAGTGC