seq1 = pF1KE5711.tfa, 2415 bp
seq2 = pF1KE5711/gi568815588r_100188399.tfa (gi568815588r:100188399_100430103), 241705 bp

>pF1KE5711 2415
>gi568815588r:100188399_100430103 (Chr10)

(complement)

1-235  (100001-100235)   100% ->
236-349  (100780-100893)   100% ->
350-477  (130386-130513)   100% ->
478-731  (131289-131542)   100% ->
732-956  (132498-132722)   100% ->
957-1185  (132896-133124)   100% ->
1186-1356  (133812-133982)   100% ->
1357-1538  (134981-135162)   100% ->
1539-1659  (135449-135569)   100% ->
1660-1758  (136725-136823)   100% ->
1759-1880  (137035-137156)   100% ->
1881-2007  (138677-138803)   100% ->
2008-2126  (139585-139703)   100% ->
2127-2250  (139966-140089)   100% ->
2251-2335  (141048-141132)   100% ->
2336-2415  (141626-141705)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGCTGTGGGAAGTCCTGAGGGGCAGGAGCTGCAAAAGCTGGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGCTGTGGGAAGTCCTGAGGGGCAGGAGCTGCAAAAGCTGGGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGCCTGGGACAACCCCGCCTACAGTGGTCCCCCTTCCCCACACGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGCCTGGGACAACCCCGCCTACAGTGGTCCCCCTTCCCCACACGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGAGAGTCTGCACCATCTCCAGCACGGGGCCTCTCCAGCCCCAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTGAGAGTCTGCACCATCTCCAGCACGGGGCCTCTCCAGCCCCAACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAGAAGCCTGAAGATGAACCCCAGGAGACGGCATACAGGACCCAGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAGAAGCCTGAAGATGAACCCCAGGAGACGGCATACAGGACCCAGGTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CAGCTGCTGCCTCCATATCTGTCAAGGCATCAGAG         GACTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100201 CAGCTGCTGCCTCCATATCTGTCAAGGCATCAGAGGTA...TAGGACTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGGGAACAACCCTGACTGAGAACACAGCTGAGAACCGGGAACTTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100786 GGGGAACAACCCTGACTGAGAACACAGCTGAGAACCGGGAACTTTATATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGACCACCCTGAGGGAGCTGTTGGTATATATTGTGTTCCTGGTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100836 AAGACCACCCTGAGGGAGCTGTTGGTATATATTGTGTTCCTGGTGGACAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTGTCTAC         TGACCTATGGAATGACAAGCTCCAGTGCTTATT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100886 CTGTCTACGTG...TAGTGACCTATGGAATGACAAGCTCCAGTGCTTATT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACTACACCAAAGTGATGTCTGAGCTCTTCTTACATACTCCATCAGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130419 ACTACACCAAAGTGATGTCTGAGCTCTTCTTACATACTCCATCAGACACT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGAGTCTCCTTTCAGGCCATCAGCAGCATGGCGGACTTCTGGGAT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 130469 GGAGTCTCCTTTCAGGCCATCAGCAGCATGGCGGACTTCTGGGATGTG..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478     TTTGCCCAGGGCCCACTACTGGACAGTTTGTATTGGACCAAATGGT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130519 .CAGTTTGCCCAGGGCCCACTACTGGACAGTTTGTATTGGACCAAATGGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ACAACAACCAGAGCCTGGGCCATGGCTCCCACTCCTTCATCTACTATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131335 ACAACAACCAGAGCCTGGGCCATGGCTCCCACTCCTTCATCTACTATGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 AACATGCTGCTGGGGGTTCCGAGGCTGCGGCAGCTAAAGGTCCGCAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131385 AACATGCTGCTGGGGGTTCCGAGGCTGCGGCAGCTAAAGGTCCGCAATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTCCTGTGTGGTGCATGAAGACTTCCGGGAGGACATTCTGAGCTGCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131435 CTCCTGTGTGGTGCATGAAGACTTCCGGGAGGACATTCTGAGCTGCTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 ATGTCTACTCTCCAGACAAAGAAGAACAACTCCCCTTTGGGCCCTTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131485 ATGTCTACTCTCCAGACAAAGAAGAACAACTCCCCTTTGGGCCCTTCAAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GGCACAGC         GTGGACATACCACTCGCAGGATGAGTTGGGGGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 131535 GGCACAGCGTG...CAGGTGGACATACCACTCGCAGGATGAGTTGGGGGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTTCTCCCACTGGGGCAGGCTCACAAGCTACAGCGGAGGTGGCTACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132531 CTTCTCCCACTGGGGCAGGCTCACAAGCTACAGCGGAGGTGGCTACTACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGGACCTTCCAGGATCCCGACAGGGTAGTGCAGAGGCTCTCCGGGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132581 TGGACCTTCCAGGATCCCGACAGGGTAGTGCAGAGGCTCTCCGGGCCCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 CAGGAGGGGCTGTGGCTGGACAGGGGCACTCGAGTGGTGTTCATCGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132631 CAGGAGGGGCTGTGGCTGGACAGGGGCACTCGAGTGGTGTTCATCGACTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTCAGTCTACAATGCCAATATCAATCTTTTCTGTGTCCTGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 132681 CTCAGTCTACAATGCCAATATCAATCTTTTCTGTGTCCTGAGGTG...TA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    957  GCTGGTGGTGGAGTTTCCAGCTACAGGAGGTGCCATCCCATCCTGGCAA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132895 GGCTGGTGGTGGAGTTTCCAGCTACAGGAGGTGCCATCCCATCCTGGCAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 ATCCGCACAGTCAAGCTGATCCGCTATGTCAGCAACTGGGACTTCTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132945 ATCCGCACAGTCAAGCTGATCCGCTATGTCAGCAACTGGGACTTCTTTAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 CGTTGGCTGTGAGGTCATCTTCTGCGTCTTCATCTTCTACTATGTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132995 CGTTGGCTGTGAGGTCATCTTCTGCGTCTTCATCTTCTACTATGTGGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 AAGAGATCCTGGAGCTCCACATTCACCGGCTTCGCTACCTCAGCAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133045 AAGAGATCCTGGAGCTCCACATTCACCGGCTTCGCTACCTCAGCAGCATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TGGAACATACTGGACCTGGTGGTCATCTTG         CTCTCCATTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 133095 TGGAACATACTGGACCTGGTGGTCATCTTGGTG...CAGCTCTCCATTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 GGCTGTGGGCTTCCACATATTCCGAACCCTCGAGGTGAATCGGCTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133823 GGCTGTGGGCTTCCACATATTCCGAACCCTCGAGGTGAATCGGCTCATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 GGAAGCTCCTGCAGCAGCCAAACACGTATGCAGACTTTGAGTTCCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133873 GGAAGCTCCTGCAGCAGCCAAACACGTATGCAGACTTTGAGTTCCTCGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 TTCTGGCAGACACAGTACAACAACATGAATGCTGTCAACCTCTTCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133923 TTCTGGCAGACACAGTACAACAACATGAATGCTGTCAACCTCTTCTTCGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 CTGGATCAAG         ATATTCAAGTACATCAGCTTCAACAAAACCA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 133973 CTGGATCAAGGTA...CAGATATTCAAGTACATCAGCTTCAACAAAACCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 TGACCCAGCTCTCCTCCACGCTGGCCCGCTGTGCCAAGGACATCCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135012 TGACCCAGCTCTCCTCCACGCTGGCCCGCTGTGCCAAGGACATCCTGGGC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 TTCGCCGTCATGTTCTTCATTGTTTTCTTCGCCTATGCCCAACTCGGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135062 TTCGCCGTCATGTTCTTCATTGTTTTCTTCGCCTATGCCCAACTCGGCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 CCTGCTTTTCGGGACCCAAGTGGAAAACTTTAGCACTTTCATCAAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135112 CCTGCTTTTCGGGACCCAAGTGGAAAACTTTAGCACTTTCATCAAGTGCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1538 T         TTTCACTCAGTTCCGGATAATCCTCGGGGACTTTGACTAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135162 TGTG...CAGTTTCACTCAGTTCCGGATAATCCTCGGGGACTTTGACTAC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1579 AATGCTATCGACAATGCCAACCGCATCCTGGGCCCTGCCTACTTTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135489 AATGCTATCGACAATGCCAACCGCATCCTGGGCCCTGCCTACTTTGTCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1629 CTATGTCTTCTTCGTCTTCTTCGTGCTCCTG         AACATGTTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 135539 CTATGTCTTCTTCGTCTTCTTCGTGCTCCTGGTG...CAGAACATGTTCC

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1670 TGGCCATCATCAATGACACATATTCAGAGGTCAAGGAGGAGCTGGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136735 TGGCCATCATCAATGACACATATTCAGAGGTCAAGGAGGAGCTGGCTGGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1720 CAGAAGGATGAGCTGCAACTTTCTGACCTCCTGAAACAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 136785 CAGAAGGATGAGCTGCAACTTTCTGACCTCCTGAAACAGGTG...CAGGG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1761 CTACAACAAGACCCTACTAAGACTGCGTCTGAGGAAGGAGAGGGTTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137037 CTACAACAAGACCCTACTAAGACTGCGTCTGAGGAAGGAGAGGGTTTCGG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1811 ATGTGCAGAAGGTCCTGCAGGGTGGGGAGCAGGAGATCCAGTTTGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137087 ATGTGCAGAAGGTCCTGCAGGGTGGGGAGCAGGAGATCCAGTTTGAGGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1861 TTCACCAACACCTTAAGGGA         ACTGGGACACGCAGAGCATGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 137137 TTCACCAACACCTTAAGGGAGTG...CAGACTGGGACACGCAGAGCATGA

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 AATCACTGAGCTCACGGCCACCTTCACCAAGTTTGACAGAGATGGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138698 AATCACTGAGCTCACGGCCACCTTCACCAAGTTTGACAGAGATGGGAATC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 GTATTCTGGATGAGAAGGAACAGGAAAAAATGCGACAGGACCTGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138748 GTATTCTGGATGAGAAGGAACAGGAAAAAATGCGACAGGACCTGGAGGAA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 GAGAGG         GTGGCCCTCAACACTGAGATTGAGAAACTAGGCCG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138798 GAGAGGGTG...CAGGTGGCCCTCAACACTGAGATTGAGAAACTAGGCCG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 ATCTATTGTGAGCAGCCCACAAGGCAAATCGGGTCCAGAGGCTGCCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139620 ATCTATTGTGAGCAGCCCACAAGGCAAATCGGGTCCAGAGGCTGCCAGAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 CAGGAGGCTGGGTTTCAGGAGAAGAATTCTACAT         GCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 139670 CAGGAGGCTGGGTTTCAGGAGAAGAATTCTACATGTA...CAGGCTCACA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 AGGAGAGTTCTGCAGCTGGAGACTGTCCTGGAAGGAGTAGTGTCCCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139973 AGGAGAGTTCTGCAGCTGGAGACTGTCCTGGAAGGAGTAGTGTCCCAGAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 TGATGCTGTAGGCTCAAAGCTGAAAATGCTGGAGAGGAAGGGGTGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140023 TGATGCTGTAGGCTCAAAGCTGAAAATGCTGGAGAGGAAGGGGTGGCTGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 CTCCCTCCCCAGGCGTG         AAGGAACAAGCTATTTGGAAGCAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 140073 CTCCCTCCCCAGGCGTGGTG...CAGAAGGAACAAGCTATTTGGAAGCAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 CCGCAGCCAGCCCCAGCTGTGACCCCAGACCCCTGGGGAGTCCAGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141072 CCGCAGCCAGCCCCAGCTGTGACCCCAGACCCCTGGGGAGTCCAGGGTGG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 GCAGGAGAGTG         AGGTTCCCTATAAAAGAGAAGAGGAAGCCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 141122 GCAGGAGAGTGGTG...CAGAGGTTCCCTATAAAAGAGAAGAGGAAGCCT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2366 TAGAGGAGAGGAGACTCTCCCGTGGTGAGATTCCAACGTTGCAGAGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141656 TAGAGGAGAGGAGACTCTCCCGTGGTGAGATTCCAACGTTGCAGAGGAGT