seq1 = pF1KE5683.tfa, 1656 bp
seq2 = pF1KE5683/gi568815590r_121514112.tfa (gi568815590r:121514112_121729340), 215229 bp

>pF1KE5683 1656
>gi568815590r:121514112_121729340 (Chr8)

(complement)

1-627  (100001-100627)   100% ->
628-729  (112135-112236)   100% ->
730-1656  (114303-115229)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCATTGTGAGAGGTTTCTATGTATCCTGAGAATAATTGGAACCACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCATTGTGAGAGGTTTCTATGTATCCTGAGAATAATTGGAACCACACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTTGGAGTCTCTCTCCTCCTTGGAATCACAGCTGCTTATATTGTTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTTGGAGTCTCTCTCCTCCTTGGAATCACAGCTGCTTATATTGTTGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACCAGTTTATCCAAACGGATAATTACTATTTCTCTTTTGGACTGTATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACCAGTTTATCCAAACGGATAATTACTATTTCTCTTTTGGACTGTATGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCTTTTTGGCATCACACCTCATCATCCAAAGCCTGTTTGCCTTTTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTTTTTGGCATCACACCTCATCATCCAAAGCCTGTTTGCCTTTTTGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACCGAAAAATGAAAAAATCCCTAGAAACCCCCATAAAGTTGAACAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACCGAAAAATGAAAAAATCCCTAGAAACCCCCATAAAGTTGAACAAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAGTTGCCCTTTGCATCGCTGCCTATCAAGAAGATCCAGACTACTTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAGTTGCCCTTTGCATCGCTGCCTATCAAGAAGATCCAGACTACTTAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAATGTTTGCAATCTGTGAAAAGGCTAACCTACCCTGGGATTAAAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAATGTTTGCAATCTGTGAAAAGGCTAACCTACCCTGGGATTAAAGTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGTCATAGATGGGAACTCAGAAGATGACCTTTACATGATGGACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGTCATAGATGGGAACTCAGAAGATGACCTTTACATGATGGACATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCAGTGAAGTCATGGGCAGAGACAAATCAGCCACTTATATCTGGAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCAGTGAAGTCATGGGCAGAGACAAATCAGCCACTTATATCTGGAAGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACTTCCACGAAAAGGGTCCCGGTGAGACAGATGAGTCACATAAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACTTCCACGAAAAGGGTCCCGGTGAGACAGATGAGTCACATAAAGAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTCGCAACACGTAACGCAATTGGTCTTGTCCAACAAAAGTATCTGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTCGCAACACGTAACGCAATTGGTCTTGTCCAACAAAAGTATCTGCATCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCAAAAATGGGGTGGAAAAAGAGAAGTCATGTACACAGCCTTCAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCAAAAATGGGGTGGAAAAAGAGAAGTCATGTACACAGCCTTCAGAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGGACGAAGTGTGGATTATGTACAG         GTTTGTGATTCAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100601 CTGGGACGAAGTGTGGATTATGTACAGGTA...CAGGTTTGTGATTCAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CACTATGCTTGACCCAGCCTCATCTGTGGAGATGGTAAAAGTTTTAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112149 CACTATGCTTGACCCAGCCTCATCTGTGGAGATGGTAAAAGTTTTAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAGATCCCATGGTTGGAGGTGTTGGGGGAGATGTCCAG         ATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 112199 AAGATCCCATGGTTGGAGGTGTTGGGGGAGATGTCCAGGTA...CAGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TTAAACAAGTACGATTCCTGGATCTCATTCCTCAGCAGTGTAAGATATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114306 TTAAACAAGTACGATTCCTGGATCTCATTCCTCAGCAGTGTAAGATATTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GATGGCTTTTAATATAGAAAGGGCCTGTCAGTCTTATTTTGGGTGTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114356 GATGGCTTTTAATATAGAAAGGGCCTGTCAGTCTTATTTTGGGTGTGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 AGTGCATTAGTGGACCTCTGGGAATGTACAGAAACTCCTTGTTGCATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114406 AGTGCATTAGTGGACCTCTGGGAATGTACAGAAACTCCTTGTTGCATGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TTTGTGGAAGATTGGTACAATCAAGAATTTATGGGCAACCAATGTAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114456 TTTGTGGAAGATTGGTACAATCAAGAATTTATGGGCAACCAATGTAGCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 TGGTGATGACAGGCATCTCACGAACCGGGTGCTGAGCCTGGGCTATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114506 TGGTGATGACAGGCATCTCACGAACCGGGTGCTGAGCCTGGGCTATGCAA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 CAAAATACACAGCTCGATCTAAGTGCCTTACTGAAACACCTATAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114556 CAAAATACACAGCTCGATCTAAGTGCCTTACTGAAACACCTATAGAATAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 CTCAGATGGCTAAACCAGCAGACCCGTTGGAGCAAGTCCTACTTCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114606 CTCAGATGGCTAAACCAGCAGACCCGTTGGAGCAAGTCCTACTTCCGAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 ATGGCTGTACAATGCAATGTGGTTTCACAAACATCACTTGTGGATGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114656 ATGGCTGTACAATGCAATGTGGTTTCACAAACATCACTTGTGGATGACCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 ACGAAGCGATTATCACTGGATTCTTTCCTTTCTTTCTCATTGCCACAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114706 ACGAAGCGATTATCACTGGATTCTTTCCTTTCTTTCTCATTGCCACAGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 ATCCAGCTCTTCTACCGGGGTAAAATTTGGAACATTCTCCTCTTCTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114756 ATCCAGCTCTTCTACCGGGGTAAAATTTGGAACATTCTCCTCTTCTTGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 AACTGTCCAGCTAGTAGGTCTCATAAAATCATCTTTTGCCAGCTGCCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114806 AACTGTCCAGCTAGTAGGTCTCATAAAATCATCTTTTGCCAGCTGCCTTA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 GAGGAAATATCGTCATGGTCTTCATGTCTCTCTACTCAGTGTTATACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114856 GAGGAAATATCGTCATGGTCTTCATGTCTCTCTACTCAGTGTTATACATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TCGAGTTTACTTCCCGCCAAGATGTTTGCAATTGCAACAATAAACAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114906 TCGAGTTTACTTCCCGCCAAGATGTTTGCAATTGCAACAATAAACAAAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 TGGGTGGGGCACATCAGGAAGGAAAACCATTGTTGTTAATTTCATAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114956 TGGGTGGGGCACATCAGGAAGGAAAACCATTGTTGTTAATTTCATAGGAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 TCATTCCAGTATCAGTTTGGTTTACAATCCTCCTGGGTGGTGTGATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115006 TCATTCCAGTATCAGTTTGGTTTACAATCCTCCTGGGTGGTGTGATTTTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 ACCATTTATAAGGAGTCTAAAAGGCCATTTTCAGAATCCAAACAGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115056 ACCATTTATAAGGAGTCTAAAAGGCCATTTTCAGAATCCAAACAGACAGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 TCTAATTGTTGGAACGTTGCTCTATGCATGCTATTGGGTCATGCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115106 TCTAATTGTTGGAACGTTGCTCTATGCATGCTATTGGGTCATGCTTTTGA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 CGCTGTATGTAGTTCTCATCAATAAGTGTGGCAGGCGGAAGAAGGGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115156 CGCTGTATGTAGTTCTCATCAATAAGTGTGGCAGGCGGAAGAAGGGACAA

   1650     .    :    .    :
   1633 CAATATGACATGGTGCTTGATGTA
        ||||||||||||||||||||||||
 115206 CAATATGACATGGTGCTTGATGTA