seq1 = pF1KE5676.tfa, 1737 bp
seq2 = pF1KE5676/gi568815590r_39646471.tfa (gi568815590r:39646471_39938185), 291715 bp

>pF1KE5676 1737
>gi568815590r:39646471_39938185 (Chr8)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-132  (100974-101050)   100% ->
133-188  (104187-104242)   100% ->
189-267  (113289-113367)   100% ->
268-344  (116524-116600)   100% ->
345-513  (117016-117184)   100% ->
514-650  (161025-161161)   100% ->
651-834  (168611-168794)   100% ->
835-933  (170935-171033)   100% ->
934-1129  (171143-171338)   100% ->
1130-1235  (176905-177010)   100% ->
1236-1329  (182365-182458)   100% ->
1330-1407  (188442-188519)   100% ->
1408-1546  (188736-188874)   100% ->
1547-1706  (191555-191714)   100% ->
1707-1737  (193293-193323)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGCGCGTCTTGTTTCTGCTCAGCGGGCTCGGCGGGCTGCGGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGCGCGTCTTGTTTCTGCTCAGCGGGCTCGGCGGGCTGCGGATGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGTA         ATTTTGATAGTTTACCTGTGCAAATTACAGTTCCGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGTAGTA...CAGATTTTGATAGTTTACCTGTGCAAATTACAGTTCCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAAATACGGTCAATAATAAAGGAAGGAATTGAATCGCAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 101010 AGAAAATACGGTCAATAATAAAGGAAGGAATTGAATCGCAGGTA...CAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GCATCCTACAAAATTGTAATTGAAGGGAAACCATATACTGTGAATTTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104187 GCATCCTACAAAATTGTAATTGAAGGGAAACCATATACTGTGAATTTAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCAAAA         AAACTTTTTACCCCATAATTTTAGAGTTTACAGTT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104237 GCAAAAGTA...CAGAAACTTTTTACCCCATAATTTTAGAGTTTACAGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 ATAGTGGCACAGGAATTATGAAACCACTTGACCAAGATTTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113324 ATAGTGGCACAGGAATTATGAAACCACTTGACCAAGATTTTCAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    268    AATTTCTGCCACTACCAAGGGTATATTGAAGGTTATCCAAAATCTGT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116521 CAGAATTTCTGCCACTACCAAGGGTATATTGAAGGTTATCCAAAATCTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 GGTGATGGTTAGCACATGTACTGGACTCAG         GGGCGTACTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 116571 GGTGATGGTTAGCACATGTACTGGACTCAGGTT...TAGGGGCGTACTAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 AGTTTGAAAATGTTAGTTATGGAATAGAACCCCTGGAGTCTTCAGTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117027 AGTTTGAAAATGTTAGTTATGGAATAGAACCCCTGGAGTCTTCAGTTGGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TTTGAACATGTAATTTACCAAGTAAAACATAAGAAAGCAGATGTTTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117077 TTTGAACATGTAATTTACCAAGTAAAACATAAGAAAGCAGATGTTTCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 ATATAATGAGAAGGATATTGAATCAAGAGATCTGTCCTTTAAATTACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117127 ATATAATGAGAAGGATATTGAATCAAGAGATCTGTCCTTTAAATTACAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCGTAGAG         CACCCCAGAACCATAAGTCTGGAATCACTTGCA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 117177 GCGTAGAGGTA...CAGCACCCCAGAACCATAAGTCTGGAATCACTTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTTATTTTAGCTCAATTATTGAGCCTTAGTATGGGGATCACTTATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161058 GTTATTTTAGCTCAATTATTGAGCCTTAGTATGGGGATCACTTATGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CATTAACAAATGCCAGTGCTCAGGAGCTGTCTGCATTATGAATCCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161108 CATTAACAAATGCCAGTGCTCAGGAGCTGTCTGCATTATGAATCCAGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CAAT         TCATTTCAGTGGTGTGAAGATCTTTAGTAACTGCAGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 161158 CAATGTA...TAGTCATTTCAGTGGTGTGAAGATCTTTAGTAACTGCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TTCGAAGACTTTGCACATTTTATTTCAAAGCAGAAGTCCCAGTGTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168648 TTCGAAGACTTTGCACATTTTATTTCAAAGCAGAAGTCCCAGTGTCTTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CAATCAGCCTCGCTTAGATCCTTTTTTCAAACAGCAAGCAGTGTGTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168698 CAATCAGCCTCGCTTAGATCCTTTTTTCAAACAGCAAGCAGTGTGTGGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATGCAAAGCTGGAAGCAGGAGAGGAGTGTGACTGTGGGACTGAACAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 168748 ATGCAAAGCTGGAAGCAGGAGAGGAGTGTGACTGTGGGACTGAACAGGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    835       GATTGTGCCCTTATTGGAGAAACATGCTGTGATATTGCCACATG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 168798 ...CAGGATTGTGCCCTTATTGGAGAAACATGCTGTGATATTGCCACATG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TAGATTTAAAGCCGGTTCAAACTGTGCTGAAGGACCATGCTGCGAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 170979 TAGATTTAAAGCCGGTTCAAACTGTGCTGAAGGACCATGCTGCGAAAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GTCTA         TTTATGTCAAAAGAAAGAATGTGTAGGCCTTCCTTT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171029 GTCTAGTA...CAGTTTATGTCAAAAGAAAGAATGTGTAGGCCTTCCTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAAGAATGCGACCTCCCTGAATATTGCAATGGATCATCTGCATCATGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171179 GAAGAATGCGACCTCCCTGAATATTGCAATGGATCATCTGCATCATGCCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGAAAACCACTATGTTCAGACTGGGCATCCGTGTGGACTGAATCAATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171229 AGAAAACCACTATGTTCAGACTGGGCATCCGTGTGGACTGAATCAATGGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 TCTGTATAGATGGAGTTTGTATGAGTGGGGATAAACAATGTACAGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 171279 TCTGTATAGATGGAGTTTGTATGAGTGGGGATAAACAATGTACAGACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TTTGGCAAAG         AAGTAGAGTTTGGCCCTTCAGAATGTTATTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 171329 TTTGGCAAAGGTA...CAGAAGTAGAGTTTGGCCCTTCAGAATGTTATTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 TCACCTTAATTCAAAGACTGATGTATCTGGAAACTGTGGTATAAGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 176936 TCACCTTAATTCAAAGACTGATGTATCTGGAAACTGTGGTATAAGTGATT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 CAGGATACACACAGTGTGAAGCTGA         TGGACATCTCTGCATT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 176986 CAGGATACACACAGTGTGAAGCTGAGTA...AAGTGGACATCTCTGCATT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 GCTGTGGAATTTGCCAGTGATCATGCAGACAGCCAAAAGATGTGGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182381 GCTGTGGAATTTGCCAGTGATCATGCAGACAGCCAAAAGATGTGGATAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 AGATGGAACTTCTTGTGGTTCAAATAAG         GTTTGCAGGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 182431 AGATGGAACTTCTTGTGGTTCAAATAAGGTA...TAGGTTTGCAGGAATC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 AAAGATGTGTGAGTTCTTCATACTTGGGTTATGATTGTACTACTGACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188455 AAAGATGTGTGAGTTCTTCATACTTGGGTTATGATTGTACTACTGACAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 TGCAATGATAGAGGT         GTATGCAATAACAAAAAGCACTGTCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 188505 TGCAATGATAGAGGTGTA...TAGGTATGCAATAACAAAAAGCACTGTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434 CTGTAGTGCTTCATATTTACCTCCAGATTGCTCAGTTCAATCAGATCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188762 CTGTAGTGCTTCATATTTACCTCCAGATTGCTCAGTTCAATCAGATCTAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1484 GGCCTGGTGGGAGTATTGACAGTGGCAATTTTCCACCTGTAGCTATACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 188812 GGCCTGGTGGGAGTATTGACAGTGGCAATTTTCCACCTGTAGCTATACCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1534 GCCAGACTCCCTG         AAAGGCGCTACATTGAGAACATTTACCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 188862 GCCAGACTCCCTGGTA...TAGAAAGGCGCTACATTGAGAACATTTACCA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1575 TTCCAAACCAATGAGATGGCCATTTTTCTTATTCATTCCTTTCTTTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191583 TTCCAAACCAATGAGATGGCCATTTTTCTTATTCATTCCTTTCTTTATTA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1625 TTTTCTGTGTACTGATTGCTATAATGGTGAAAGTTAATTTCCAAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 191633 TTTTCTGTGTACTGATTGCTATAATGGTGAAAGTTAATTTCCAAAGGAAA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1675 AAATGGAGAACTGAGGACTATTCAAGCGATGA         GCAACCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 191683 AAATGGAGAACTGAGGACTATTCAAGCGATGAGTA...CAGGCAACCTGA

   1850     .    :    .    :
   1716 AAGTGAGAGTGAACCTAAAGGG
        ||||||||||||||||||||||
 193302 AAGTGAGAGTGAACCTAAAGGG