seq1 = pF1KE5664.tfa, 1572 bp
seq2 = pF1KE5664/gi568815597r_58380968.tfa (gi568815597r:58380968_58639294), 258327 bp

>pF1KE5664 1572
>gi568815597r:58380968_58639294 (Chr1)

(complement)

1-500  (100001-100500)   100% ->
501-729  (102554-102782)   100% ->
730-903  (104964-105137)   100% ->
904-1011  (105235-105342)   100% ->
1012-1140  (108566-108694)   100% ->
1141-1215  (111960-112034)   100% ->
1216-1365  (133086-133235)   100% ->
1366-1572  (158121-158327)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCTTCATCTGTGGATTGCAGTCTGCTGCTAGAAACCATGTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCTTCATCTGTGGATTGCAGTCTGCTGCTAGAAACCATGTTTTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGATTTAATTCACTGTCTAACTGGAGAAAATGTAACACATTAGCATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGATTTAATTCACTGTCTAACTGGAGAAAATGTAACACATTAGCATCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCACGGGGCTGTCATCAAGTACAAGTTAACCATATAGTAAATAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCACGGGGCTGTCATCAAGTACAAGTTAACCATATAGTAAATAAGTAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGGGACTGGGAGTAAATCAGTGTGACAGGTGGAGTTTTCTGCCTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGGGACTGGGAGTAAATCAGTGTGACAGGTGGAGTTTTCTGCCTGGAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTCATTTTTATAGTACTTTTAACAACAAAAGAACAGGAGGCCTCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTCATTTTTATAGTACTTTTAACAACAAAAGAACAGGAGGCCTCTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTACCAAAAGTAAGGAAATTTGGAGGATTACCAGCAAATGTACTGTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTACCAAAAGTAAGGAAATTTGGAGGATTACCAGCAAATGTACTGTATGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AATGATGCTTTTTCAAGACAGCTGCTAATAAAAGAAGTTACAGCAGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AATGATGCTTTTTCAAGACAGCTGCTAATAAAAGAAGTTACAGCAGTCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TAGTCTGTCAGTATTGCATCCTCTAAGCCCTGCTTCCATAAGAGCTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TAGTCTGTCAGTATTGCATCCTCTAAGCCCTGCTTCCATAAGAGCTATTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GGAATTTCCATACTTCTCCACGGTTTCAAGCTGCTCCGGTTCCTCTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GGAATTTCCATACTTCTCCACGGTTTCAAGCTGCTCCGGTTCCTCTCTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGATGATTCTTAAACCAGTACAGAAGTTATTTGCAATCATTGTAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGATGATTCTTAAACCAGTACAGAAGTTATTTGCAATCATTGTAGGCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501          GGGCATAAGGAAATGGTGGCAGGCACTTCCTCCTAACAAGA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTA...TAGGGGCATAAGGAAATGGTGGCAGGCACTTCCTCCTAACAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGGAAGTAGTTAAAGAAAATATAAGGAAGAATAAATGGAAGCTATTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102595 AGGAAGTAGTTAAAGAAAATATAAGGAAGAATAAATGGAAGCTATTCCTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGTTTGAGTAGTTTTGGATTGCTCTTTGTGGTGTTTTATTTTACTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102645 GGTTTGAGTAGTTTTGGATTGCTCTTTGTGGTGTTTTATTTTACTCACCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 GGAAGTAAGTCCAATCACAGGAAGGAGCAAGCTACTATTATTGGGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102695 GGAAGTAAGTCCAATCACAGGAAGGAGCAAGCTACTATTATTGGGGAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AACAGTTCAGACTTTTATCGGAACTGGAATATGAAGCA         TGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 102745 AACAGTTCAGACTTTTATCGGAACTGGAATATGAAGCAGTA...CAGTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATGGAAGAATTTAAAAATGATATGCTAACTGAGAAAGATGCCCGATACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104967 ATGGAAGAATTTAAAAATGATATGCTAACTGAGAAAGATGCCCGATACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GGCTGTTAAAGAAGTGCTTTGTCATCTAATTGAATGCAATAAAGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105017 GGCTGTTAAAGAAGTGCTTTGTCATCTAATTGAATGCAATAAAGATGTTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CAGGGATCTCTCAGATCAATTGGGTTATTCATGTGGTTGATTCCCCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105067 CAGGGATCTCTCAGATCAATTGGGTTATTCATGTGGTTGATTCCCCAATT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATTAATGCCTTCGTGCTTCCA         AATGGACAAATGTTTGTTTT
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 105117 ATTAATGCCTTCGTGCTTCCAGTA...CAGAATGGACAAATGTTTGTTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CACTGGATTTTTAAATAGTGTAACCGATATTCATCAACTTTCTTTCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105255 CACTGGATTTTTAAATAGTGTAACCGATATTCATCAACTTTCTTTCCTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 TGGGCCATGAAATAGCACATGCAGTACTTGGGCATGCT         GCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 105305 TGGGCCATGAAATAGCACATGCAGTACTTGGGCATGCTGTA...TAGGCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAAAAGGCTGGCATGGTTCATTTGTTGGATTTCCTAGGTATGATTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108569 GAAAAGGCTGGCATGGTTCATTTGTTGGATTTCCTAGGTATGATTTTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CACAATGATTTGGGCCATTTGTCCTCGAGATAGCTTGGCACTTTTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108619 CACAATGATTTGGGCCATTTGTCCTCGAGATAGCTTGGCACTTTTGTGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 AGTGGATACAGTCTAAATTGCAGGAG         TATATGTTTAATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 108669 AGTGGATACAGTCTAAATTGCAGGAGGTA...TAGTATATGTTTAATAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 CCATACAGCAGAAAATTGGAGGCCGAAGCTGACAAAATTGGACTACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111975 CCATACAGCAGAAAATTGGAGGCCGAAGCTGACAAAATTGGACTACTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 TGCTGCAAAG         GCTTGTGCAGACATAAGAGCCAGTTCAGTGT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 112025 TGCTGCAAAGGTA...TAGGCTTGTGCAGACATAAGAGCCAGTTCAGTGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 TTTGGCAGCAAATGGAGTTCGTTGATAGCCTGCATGGCCAACCCAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133117 TTTGGCAGCAAATGGAGTTCGTTGATAGCCTGCATGGCCAACCCAAGATG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1297 CCAGAATGGTTATCTACACACCCTTCTCATGGCAATCGAGTTGAGTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133167 CCAGAATGGTTATCTACACACCCTTCTCATGGCAATCGAGTTGAGTACTT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1347 GGATAGACTTATACCTCAG         GCTCTCAAAATTAGAGAGATGT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 133217 GGATAGACTTATACCTCAGGTG...TAGGCTCTCAAAATTAGAGAGATGT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1388 GTAATTGTCCACCACTGTCTAATCCAGACCCTCGATTACTATTCAAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158143 GTAATTGTCCACCACTGTCTAATCCAGACCCTCGATTACTATTCAAACTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1438 AGCACGAAGCATTTTCTTGAAGAATCAGAGAAAGAAGACCTAAATATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158193 AGCACGAAGCATTTTCTTGAAGAATCAGAGAAAGAAGACCTAAATATCAC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1488 GAAGAAACAGAAAATGGATACTCTTCCTATTCAAAAACAGGAGCAAATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158243 GAAGAAACAGAAAATGGATACTCTTCCTATTCAAAAACAGGAGCAAATAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .
   1538 CATTAACATACATAGTTGAGAAAAGAACGGGCAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158293 CATTAACATACATAGTTGAGAAAAGAACGGGCAGT