seq1 = pF1KE5652.tfa, 1515 bp
seq2 = pF1KE5652/gi568815583r_78496607.tfa (gi568815583r:78496607_78718918), 222312 bp

>pF1KE5652 1515
>gi568815583r:78496607_78718918 (Chr15)

(complement)

1-82  (98125-98206)   100% ->
83-222  (100004-100143)   100% ->
223-267  (100258-100302)   100% ->
268-377  (101786-101895)   99% ->
378-1389  (116655-117666)   100% ->
1390-1515  (122187-122312)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCTCTGGCCCGCTCTCGCTGCCCCTGGCGCTGTCGCCGCCGCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  98125 ATGGGCTCTGGCCCGCTCTCGCTGCCCCTGGCGCTGTCGCCGCCGCGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCTCTGCTGCCAG         TGGCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  98175 GCTGCTGCTGCTGCTGCTGTCTCTGCTGCCAGGTA...CAGTGGCCAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCTCAGAGGCTGAGCACCGTCTATTTGAGCGGCTGTTTGAAGATTACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 CCTCAGAGGCTGAGCACCGTCTATTTGAGCGGCTGTTTGAAGATTACAAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGATCATCCGGCCTGTAGCCAACGTGTCTGACCCAGTCATCATCCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 GAGATCATCCGGCCTGTAGCCAACGTGTCTGACCCAGTCATCATCCATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGAGGTGTCCATGTCTCAGCTGGTGAAGGTG         GATGAAGTAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 100113 CGAGGTGTCCATGTCTCAGCTGGTGAAGGTGGTG...TAGGATGAAGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACCAGATCATGGAGACCAACCTGTGGCTCAAGCAA         ATCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100268 ACCAGATCATGGAGACCAACCTGTGGCTCAAGCAAGTA...GAGATCTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AATGACTACAAGCTGAAGTGGAACCCCTCTGACTATGGTGGGGCAGAGTT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 101792 AATGACTACAAGCTGAAATGGAACCCCTCTGACTATGGTGGGGCAGAGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CATGCGTGTCCCTGCACAGAAGATCTGGAAGCCAGACATTGTGCTGTATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101842 CATGCGTGTCCCTGCACAGAAGATCTGGAAGCCAGACATTGTGCTGTATA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ACAA         TGCTGTTGGGGATTTCCAGGTGGACGACAAGACCAAA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101892 ACAAGTA...CAGTGCTGTTGGGGATTTCCAGGTGGACGACAAGACCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 GCCTTACTCAAGTACACTGGGGAGGTGACTTGGATACCTCCGGCCATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116692 GCCTTACTCAAGTACACTGGGGAGGTGACTTGGATACCTCCGGCCATCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TAAGAGCTCCTGTAAAATCGACGTGACCTACTTCCCGTTTGATTACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116742 TAAGAGCTCCTGTAAAATCGACGTGACCTACTTCCCGTTTGATTACCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTGTACCATGAAGTTCGGTTCCTGGTCCTACGATAAGGCGAAAATCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116792 ACTGTACCATGAAGTTCGGTTCCTGGTCCTACGATAAGGCGAAAATCGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGTCCTGATCGGCTCTTCCATGAACCTCAAGGACTATTGGGAGAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116842 CTGGTCCTGATCGGCTCTTCCATGAACCTCAAGGACTATTGGGAGAGCGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGAGTGGGCCATCATCAAAGCCCCAGGCTACAAACACGACATCAAGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116892 CGAGTGGGCCATCATCAAAGCCCCAGGCTACAAACACGACATCAAGTACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTGCTGCGAGGAGATCTACCCCGACATCACATACTCGCTGTACATCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116942 ACTGCTGCGAGGAGATCTACCCCGACATCACATACTCGCTGTACATCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CGCCTGCCCTTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCCTGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116992 CGCCTGCCCTTGTTCTACACCATCAACCTCATCATCCCCTGCCTGCTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCCTTCCTCACTGTGCTCGTCTTCTACCTGCCCTCCGACTGCGGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117042 CTCCTTCCTCACTGTGCTCGTCTTCTACCTGCCCTCCGACTGCGGTGAGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 AGGTGACCCTGTGCATTTCTGTCCTCCTCTCCCTGACGGTGTTTCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117092 AGGTGACCCTGTGCATTTCTGTCCTCCTCTCCCTGACGGTGTTTCTCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GTGATCACTGAGACCATCCCTTCCACCTCGCTGGTCATCCCCCTGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117142 GTGATCACTGAGACCATCCCTTCCACCTCGCTGGTCATCCCCCTGATTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGAGTACCTCCTGTTCACCATGATTTTTGTAACCTTGTCCATCGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117192 AGAGTACCTCCTGTTCACCATGATTTTTGTAACCTTGTCCATCGTCATCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCGTCTTCGTGCTCAACGTGCACTACAGAACCCCGACGACACACACAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117242 CCGTCTTCGTGCTCAACGTGCACTACAGAACCCCGACGACACACACAATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 CCCTCATGGGTGAAGACTGTATTCTTGAACCTGCTCCCCAGGGTCATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117292 CCCTCATGGGTGAAGACTGTATTCTTGAACCTGCTCCCCAGGGTCATGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CATGACCAGGCCAACAAGCAACGAGGGCAACGCTCAGAAGCCGAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117342 CATGACCAGGCCAACAAGCAACGAGGGCAACGCTCAGAAGCCGAGGCCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TCTACGGTGCCGAGCTCTCAAATCTGAATTGCTTCAGCCGCGCAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117392 TCTACGGTGCCGAGCTCTCAAATCTGAATTGCTTCAGCCGCGCAGAGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 AAAGGCTGCAAGGAGGGCTACCCCTGCCAGGACGGGATGTGTGGTTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117442 AAAGGCTGCAAGGAGGGCTACCCCTGCCAGGACGGGATGTGTGGTTACTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 CCACCACCGCAGGATAAAAATCTCCAATTTCAGTGCTAACCTCACGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117492 CCACCACCGCAGGATAAAAATCTCCAATTTCAGTGCTAACCTCACGAGAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GCTCTAGTTCTGAATCTGTTGATGCTGTGCTGTCCCTCTCTGCTTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117542 GCTCTAGTTCTGAATCTGTTGATGCTGTGCTGTCCCTCTCTGCTTTGTCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 CCAGAAATCAAAGAAGCCATCCAAAGTGTCAAGTATATTGCTGAAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117592 CCAGAAATCAAAGAAGCCATCCAAAGTGTCAAGTATATTGCTGAAAATAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1365 GAAAGCACAAAATGAAGCCAAAGAG         ATTCAAGATGATTGGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 117642 GAAAGCACAAAATGAAGCCAAAGAGGTA...CAGATTCAAGATGATTGGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AGTATGTTGCCATGGTGATTGATCGTATTTTTCTGTGGGTTTTCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122203 AGTATGTTGCCATGGTGATTGATCGTATTTTTCTGTGGGTTTTCACCCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 GTGTGCATTCTAGGGACAGCAGGATTGTTTCTGCAACCCCTGATGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122253 GTGTGCATTCTAGGGACAGCAGGATTGTTTCTGCAACCCCTGATGGCCAG

   1550     .    :
   1506 GGAAGATGCA
        ||||||||||
 122303 GGAAGATGCA