seq1 = pF1KE5644.tfa, 1431 bp
seq2 = pF1KE5644/gi568815591r_100301017.tfa (gi568815591r:100301017_100517181), 216165 bp

>pF1KE5644 1431
>gi568815591r:100301017_100517181 (Chr7)

(complement)

1-116  (100001-100116)   99% ->
117-268  (100726-100877)   100% ->
269-391  (101085-101207)   100% ->
392-508  (107638-107754)   100% ->
509-629  (108523-108643)   100% ->
630-705  (109879-109954)   100% ->
706-810  (110384-110488)   100% ->
811-891  (112089-112169)   100% ->
892-958  (112938-113004)   100% ->
959-1050  (113397-113488)   100% ->
1051-1111  (114606-114666)   100% ->
1112-1431  (115846-116165)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGATCTGGCCTTGATTTTGCAGAGACTTCTTGTGCCCAGCCCGTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGATCTGGCCTTGATTTTGCAGAGACTTCTTGTGCCCAGCCCGTAGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCTACCCAATCAGACAAGGAGCCAGGAATTACTGCTTCTGCTGCTGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100051 ATCTACCCAATCAGACAAGGAGCCAGGAATTACTGCTTCTGCTACTGATA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGATAATGCTAATGG         AGAGGAGGTACCACATACTCAAGAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGATAATGCTAATGGGTA...CAGAGAGGAGGTACCACATACTCAAGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATTTCAGTGTCTTGGGAAGGTGAAGCTGCCCCTGAGATAAGGACATCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATTTCAGTGTCTTGGGAAGGTGAAGCTGCCCCTGAGATAAGGACATCTAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTTAGGCCAGCCAGATCCTGCACCCTCTAAGAAGAAATCCAATAGACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTTAGGCCAGCCAGATCCTGCACCCTCTAAGAAGAAATCCAATAGACTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTTAAGCAAAAGAAAGAAGGAAGCTC         AAGATGAGAAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100851 CCTTAAGCAAAAGAAAGAAGGAAGCTCGTA...CAGAAGATGAGAAGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGAAAACTCAAGGTGGACATGAGCACAGACAGGAAGACCGACTAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101099 GAGAAAACTCAAGGTGGACATGAGCACAGACAGGAAGACCGACTAAAGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACAGTTCAGGATCATTCTCAGATCAGGGACCAGCAAAAAGGAGAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101149 AACAGTTCAGGATCATTCTCAGATCAGGGACCAGCAAAAAGGAGAGATAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGGTTTTG         GTCAATGTCTGGTCTGGGTCCAGTGTTCCTTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 101199 GTGGTTTTGGTG...CAGGTCAATGTCTGGTCTGGGTCCAGTGTTCCTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CCAAACTGTGGGAAATGGAGGCGGCTGTGTGGGAACATTGACCCCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107670 CCAAACTGTGGGAAATGGAGGCGGCTGTGTGGGAACATTGACCCCTCAGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TCTCCCAGATAATTGGTCCTGTGATCAGAACACAG         ATGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 107720 TCTCCCAGATAATTGGTCCTGTGATCAGAACACAGGTA...CAGATGTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGTATAATCGCTGTGATATTCCTGAGGAGACCTGGACAGGGCTTGAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108529 AGTATAATCGCTGTGATATTCCTGAGGAGACCTGGACAGGGCTTGAGAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGTGGCCTATGCCTCCTACATCCCAGGATCCATCATCTGGGCCAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108579 GATGTGGCCTATGCCTCCTACATCCCAGGATCCATCATCTGGGCCAAGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ATACGGTTACCCCTG         GTGGCCAGGCATGATAGAATCTGATC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 108629 ATACGGTTACCCCTGGTA...CAGGTGGCCAGGCATGATAGAATCTGATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CTGACTTAGGGGAATATTTTCTTTTTACTTCCCATCTTGATTCCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109905 CTGACTTAGGGGAATATTTTCTTTTTACTTCCCATCTTGATTCCCTGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706          TCTAAGTACCATGTGACGTTTTTTGGAGAAACAGTTTCTCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109955 GTG...CAGTCTAAGTACCATGTGACGTTTTTTGGAGAAACAGTTTCTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGCATGGATCCCAGTCAACATGCTAAAGAACTTCCAGGAGCTGTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110425 TGCATGGATCCCAGTCAACATGCTAAAGAACTTCCAGGAGCTGTCCCTGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 AGCTATCAGTCATG         AAAAAGCGCAGAAATGACTGCAGCCAG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 110475 AGCTATCAGTCATGGTG...CAGAAAAAGCGCAGAAATGACTGCAGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAACTGGGGGTGGCCCTGATGATGGCTCAAGAGGCAGAACAGATCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112116 AAACTGGGGGTGGCCCTGATGATGGCTCAAGAGGCAGAACAGATCAGCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TCAG         GAACGGGTTAACTTGTTTGGTTTCTGGAGCCGATTCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112166 TCAGGTG...TAGGAACGGGTTAACTTGTTTGGTTTCTGGAGCCGATTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACGGATCTAACAGTAATGGGGAAAGAAAAG         ACTTACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 112975 ACGGATCTAACAGTAATGGGGAAAGAAAAGGTA...TAGACTTACAGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCTGGTTTGAACAGCCCAGGATCCTGCTTAGAGAAAAAGGAGAAAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113408 TCTGGTTTGAACAGCCCAGGATCCTGCTTAGAGAAAAAGGAGAAAGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGAGTTGGAAAAGGAGGAAGGAGAGAAAACA         GACCCAATTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 113458 AGAGTTGGAAAAGGAGGAAGGAGAGAAAACAGTA...CAGGACCCAATTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 TGCCCATTCGTAAGCGAGTCAAAATACAGACCCAAAAAACCAAGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114616 TGCCCATTCGTAAGCGAGTCAAAATACAGACCCAAAAAACCAAGCCAAGA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 G         GCCCTAAGAAAAAATTTAAAGCTCCCCAGAGCAAGGCCTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114666 GGTA...TAGGCCCTAAGAAAAAATTTAAAGCTCCCCAGAGCAAGGCCTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 GGCAGCCAGCTTTTCAGAGGGAAAAGAAGTTAGAACAGTGCCAAAGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115886 GGCAGCCAGCTTTTCAGAGGGAAAAGAAGTTAGAACAGTGCCAAAGAACC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGGGCCTATCAGCGTGTAAGGGGGCCTGCCCCTCATCTGCGAAAGAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115936 TGGGCCTATCAGCGTGTAAGGGGGCCTGCCCCTCATCTGCGAAAGAAGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 CCCAGACACCGGGAACCCCTGACCCAGGAGGCTGGAAGTGTCCCCCTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115986 CCCAGACACCGGGAACCCCTGACCCAGGAGGCTGGAAGTGTCCCCCTTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GGACGAAGCCTCCAGTGACCTGGACCTGGAGCAACTCATGGAAGATGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116036 GGACGAAGCCTCCAGTGACCTGGACCTGGAGCAACTCATGGAAGATGTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 GGAGAGAGCTGGGGCAGAGCGGGGAGCTGCAGCACAGCAACAGTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116086 GGAGAGAGCTGGGGCAGAGCGGGGAGCTGCAGCACAGCAACAGTGATGGC

   1500     .    :    .    :    .    :
   1402 GAGGACTTCCCCGTGGCGCTGTTTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 116136 GAGGACTTCCCCGTGGCGCTGTTTGGGAAG