seq1 = pF1KE5633.tfa, 1476 bp
seq2 = pF1KE5633/gi568815576r_19777114.tfa (gi568815576r:19777114_20031100), 253987 bp

>pF1KE5633 1476
>gi568815576r:19777114_20031100 (Chr22)

(complement)

12-82  (100001-100071)   100% ->
83-139  (111502-111558)   100% ->
140-284  (112097-112241)   99% ->
285-359  (112884-112958)   100% ->
360-438  (115258-115336)   100% ->
439-501  (115825-115887)   100% ->
502-572  (119654-119724)   100% ->
573-592  (132033-132052)   100% ->
593-684  (132971-133062)   100% ->
685-859  (135520-135694)   100% ->
860-996  (147640-147776)   100% ->
997-1092  (150384-150479)   98% ->
1093-1185  (150830-150922)   98% ->
1186-1257  (152664-152735)   100% ->
1258-1355  (152914-153011)   100% ->
1356-1476  (153867-153987)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     12 AGCAGGTCAGCGGGACTATGATCTCCTGGTGGTCGGCGGGGGATCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 AGCAGGTCAGCGGGACTATGATCTCCTGGTGGTCGGCGGGGGATCTGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     62 GCCTGGCTTGTGCCAAGGAGG         CCGCCCAGCTGGGAAGGAAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100051 GCCTGGCTTGTGCCAAGGAGGGTA...CAGCCGCCCAGCTGGGAAGGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    103 GTGGCCGTGGTGGACTACGTGGAACCTTCTCCCCAAG         GCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 111522 GTGGCCGTGGTGGACTACGTGGAACCTTCTCCCCAAGGTA...CAGGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    144 CCGGTGGGGCCTCGGCGGCACCTGCGTCAACGTGGGCTGCATCCCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112101 CCGGTGGGGCCTCGGCGGCACCTGCGTCAACGTGGGCTGCATCCCCAAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    194 AGCTGATGCACCAGGCGGCACTACTGGGAGGCCTGATCCAAGATGCCCCC
        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
 112151 AGCTGATGCACCAGGCGGCACTGCTGGGAGGCCTGATCCAAGATGCCCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    244 AACTATGGCTGGGAGGTGGCCCAGCCCGTGCCGCATGACTG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 112201 AACTATGGCTGGGAGGTGGCCCAGCCCGTGCCGCATGACTGGTA...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    285 GAGGAAGATGGCAGAAGCTGTTCAAAATCACGTGAAATCCTTGAACTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112884 GAGGAAGATGGCAGAAGCTGTTCAAAATCACGTGAAATCCTTGAACTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    335 GCCACCGTGTCCAGCTTCAGGACAG         AAAAGTCAAGTACTTT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 112934 GCCACCGTGTCCAGCTTCAGGACAGGTA...CAGAAAAGTCAAGTACTTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    376 AACATCAAAGCCAGCTTTGTTGACGAGCACACGGTTTGCGGCGTTGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115274 AACATCAAAGCCAGCTTTGTTGACGAGCACACGGTTTGCGGCGTTGCCAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    426 AGGTGGGAAAGAG         ATTCTGCTGTCAGCCGATCACATCATCA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 115324 AGGTGGGAAAGAGGTG...CAGATTCTGCTGTCAGCCGATCACATCATCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    467 TTGCTACTGGAGGGCGGCCGAGATACCCCACGCAC         ATCGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 115853 TTGCTACTGGAGGGCGGCCGAGATACCCCACGCACGTG...CAGATCGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    508 GGTGCCTTGGAATATGGAATCACAAGTGATGACATCTTCTGGCTGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119660 GGTGCCTTGGAATATGGAATCACAAGTGATGACATCTTCTGGCTGAAGGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    558 ATCCCCTGGAAAAAC         GTTGGTGGTCGGGGCCAGCT      
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||>>>...
 119710 ATCCCCTGGAAAAACGTA...CAGGTTGGTGGTCGGGGCCAGCTGTA...

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    593    ATGTGGCCCTGGAGTGTGCTGGCTTCCTCACCGGGATTGGGCTGGAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132968 CAGATGTGGCCCTGGAGTGTGCTGGCTTCCTCACCGGGATTGGGCTGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    640 ACCACCATCATGATGCGCAGCATCCCCCTCCGCGGCTTCGACCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 133018 ACCACCATCATGATGCGCAGCATCCCCCTCCGCGGCTTCGACCAGGTA..

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    685     CAAATGTCCTCCATGGTCATAGAGCACATGGCATCTCATGGCACCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133068 .CAGCAAATGTCCTCCATGGTCATAGAGCACATGGCATCTCATGGCACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    731 GGTTCCTGAGGGGCTGTGCCCCCTCGCGGGTCAGGAGGCTCCCTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135566 GGTTCCTGAGGGGCTGTGCCCCCTCGCGGGTCAGGAGGCTCCCTGATGGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    781 CAGCTGCAGGTCACCTGGGAGGACAGCACCACCGGCAAGGAGGACACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135616 CAGCTGCAGGTCACCTGGGAGGACAGCACCACCGGCAAGGAGGACACGGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    831 CACCTTTGACACCGTCCTGTGGGCCATAG         GTCGAGTCCCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 135666 CACCTTTGACACCGTCCTGTGGGCCATAGGTA...CAGGTCGAGTCCCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    872 ACACCAGAAGTCTGAATTTGGAGAAGGCTGGGGTAGATACTAGCCCCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147652 ACACCAGAAGTCTGAATTTGGAGAAGGCTGGGGTAGATACTAGCCCCGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    922 ACTCAGAAGATCCTGGTGGACTCCCGGGAAGCCACCTCTGTGCCCCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147702 ACTCAGAAGATCCTGGTGGACTCCCGGGAAGCCACCTCTGTGCCCCACAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    972 CTACGCCATTGGTGACGTGGTGGAG         GGGCGGCCTGAGCTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 147752 CTACGCCATTGGTGACGTGGTGGAGGTA...AAGGGGCGGCCTGAGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1013 CACCCACAGCGATCATGGCCGGGAGGCTCCTGGTGCAGCGGCTCTTCGGC
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150400 CACCCATAGCGATCATGGCCGGGAGGCTCCTGGTGCAGCGGCTCTTCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1063 GGGTCCTCAGATCTGATGGACTACGACAAT         GTTCCCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 150450 GGGTCCTCAGATCTGATGGACTACGACAATGTG...CAGGTTCCCACGAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1104 CGTCTTCACCCCACTGGAGTATGGCTGTGTGGGGCTGTCCGAGGAGGAGG
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150841 CGTCTTCACCCCGCTGGAGTATGGCTGTGTGGGGCTGTCCGAGGAGGAGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1154 CAGTGGCTCGCCACGGGCAGGAGCATGTTGAG         GTCTATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 150891 CAGTGGCTCGCCACGGGCAGGAGCATGTTGAGGTG...CAGGTCTATCAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1195 GCCCATTATAAACCACTGGAGTTCACGGTGGCTGGACGAGATGCATCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152673 GCCCATTATAAACCACTGGAGTTCACGGTGGCTGGACGAGATGCATCCCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1245 GTGTTATGTAAAG         ATGGTGTGCCTGAGGGAGCCCCCACAGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 152723 GTGTTATGTAAAGGTG...CAGATGGTGTGCCTGAGGGAGCCCCCACAGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1286 TGGTGCTGGGCCTGCATTTCCTTGGCCCCAACGCAGGCGAAGTTACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152942 TGGTGCTGGGCCTGCATTTCCTTGGCCCCAACGCAGGCGAAGTTACTCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1336 GGATTTGCTCTGGGGATCAA         GTGTGGGGCTTCCTATGCGCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 152992 GGATTTGCTCTGGGGATCAAGTA...CAGGTGTGGGGCTTCCTATGCGCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1377 GGTGATGCGGACCGTGGGTATCCATCCCACATGCTCTGAGGAGGTAGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153888 GGTGATGCGGACCGTGGGTATCCATCCCACATGCTCTGAGGAGGTAGTCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1427 AGCTGCGCATCTCCAAGCGCTCAGGCCTGGACCCCACGGTGACAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153938 AGCTGCGCATCTCCAAGCGCTCAGGCCTGGACCCCACGGTGACAGGCTGC