seq1 = pF1KE5632.tfa, 1470 bp
seq2 = pF1KE5632/gi568815582r_11737848.tfa (gi568815582r:11737848_11951512), 213665 bp

>pF1KE5632 1470
>gi568815582r:11737848_11951512 (Chr16)

(complement)

1-105  (100001-100105)   100% ->
106-245  (101095-101234)   100% ->
246-384  (103707-103845)   100% ->
385-533  (104670-104818)   100% ->
534-635  (104911-105012)   99% ->
636-729  (109513-109606)   100% ->
730-855  (109693-109818)   100% ->
856-1146  (111528-111818)   100% ->
1147-1470  (113400-113723)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGATTCGGCCTCGGCCTCGCTGTCTTCTGCAGCCGCTACTGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGATTCGGCCTCGGCCTCGCTGTCTTCTGCAGCCGCTACTGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCCACCTCGACTCCAGCGGCCCCGACAGCACGGAAGCAGCTGGATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCCACCTCGACTCCAGCGGCCCCGACAGCACGGAAGCAGCTGGATAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AACAG         GTTAGAAAGGCAGTGGACGCTCTCTTGACGCATTGC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AACAGGTG...CAGGTTAGAAAGGCAGTGGACGCTCTCTTGACGCATTGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGTCCAGGAAAAACAATTATGGGTTGCTTTTGAATGAGAATGAAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101131 AAGTCCAGGAAAAACAATTATGGGTTGCTTTTGAATGAGAATGAAAGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTTTTAATGGTGGTATTATGGAAAATTCCAAGTAAAGAACTGAGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101181 ATTTTTAATGGTGGTATTATGGAAAATTCCAAGTAAAGAACTGAGGGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATT         GACCTTGCCTCATAGTATTCGATCAGATTCAGAAGAT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101231 GATTGTA...TAGGACCTTGCCTCATAGTATTCGATCAGATTCAGAAGAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATCTGTTTATTTACGAAGGATGAACCCAATTCAACTCCTGAAAAGACAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103744 ATCTGTTTATTTACGAAGGATGAACCCAATTCAACTCCTGAAAAGACAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACAGTTTTATAGAAAGCTTTTAAACAAGCATGGAATTAAAACCGTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103794 ACAGTTTTATAGAAAGCTTTTAAACAAGCATGGAATTAAAACCGTTTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AG         ATTATCTCCCTCCAAACTCTAAAGAAGGAATATAAATCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103844 AGGTA...TAGATTATCTCCCTCCAAACTCTAAAGAAGGAATATAAATCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TATGAAGCCAAGCTCCGCCTTCTGAGCAGTTTTGATTTCTTCCTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104709 TATGAAGCCAAGCTCCGCCTTCTGAGCAGTTTTGATTTCTTCCTTACTGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGCCAGAATTAGGCGGCTCTTACCCTCACTCATTGGGAGACATTTCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104759 TGCCAGAATTAGGCGGCTCTTACCCTCACTCATTGGGAGACATTTCTATC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAGAAAGAA         AGTTCCAGTATCTGTAAACCTTCTGTCCAAG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 104809 AAAGAAAGAAGTA...TAGAGTTCCAGTATCTGTAAACCTTCTGTCCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AATTTATCAAGAGAGATCAATGACTGTATAGGTGGAACGGTCTTAAACAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 104942 AATTTATCAAGAGAGATCAATGACTGTATAGGTGGAACAGTCTTAAACAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTCTAAAAGTGGTTCTTGCAG         TGCTATACGTATTGGTCACG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 104992 TTCTAAAAGTGGTTCTTGCAGGTA...CAGTGCTATACGTATTGGTCACG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTGGAATGCAAATTGAGCACATCATTGAAAACATTGTTGCTGTCACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109533 TTGGAATGCAAATTGAGCACATCATTGAAAACATTGTTGCTGTCACCAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GGACTTTCAGAAAAATTGCCAGAG         AAGTGGGAGAGCGTGAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 109583 GGACTTTCAGAAAAATTGCCAGAGGTA...CAGAAGTGGGAGAGCGTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 ACTCCTGTTTGTGAAAACTGAGAAATCGGCTGCACTTCCCATCTTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109710 ACTCCTGTTTGTGAAAACTGAGAAATCGGCTGCACTTCCCATCTTTTCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CGTTTGTCAGCAATTGGGATGAAGCCACCAAAAGATCTTTGCTTAATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109760 CGTTTGTCAGCAATTGGGATGAAGCCACCAAAAGATCTTTGCTTAATAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AAGAAAAAA         GAGGCAAGGAGAAAACGAAGAGAAAGAAATTT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109810 AAGAAAAAAGTT...TAGGAGGCAAGGAGAAAACGAAGAGAAAGAAATTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 TGAAAAACAAAAGGAGAGGAAGAAGAAGAGGCAGCAGGCTAGGAAGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111560 TGAAAAACAAAAGGAGAGGAAGAAGAAGAGGCAGCAGGCTAGGAAGACTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CATCAGTTCTTAGTAAAGATGATGTGGCACCTGAAAGTGGTGATACTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111610 CATCAGTTCTTAGTAAAGATGATGTGGCACCTGAAAGTGGTGATACTACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTGAAGAAACCTGAATCAAAGAAGGAACAGACCCCAGAGCATGGGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111660 GTGAAGAAACCTGAATCAAAGAAGGAACAGACCCCAGAGCATGGGAAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 AAAACGTGGCAGAGGAAAAGCCCAAGTTAAAGCAACAAATGAATCCGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111710 AAAACGTGGCAGAGGAAAAGCCCAAGTTAAAGCAACAAATGAATCCGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 ACGAAATCCCACAGCTGGTACCAATAGGAAAGAAGACTCCAGCTAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111760 ACGAAATCCCACAGCTGGTACCAATAGGAAAGAAGACTCCAGCTAATGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 AAAGTAGAG         ATTCAAAAACATGCCACAGGAAAGAAGTCTCC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111810 AAAGTAGAGGTA...TAGATTCAAAAACATGCCACAGGAAAGAAGTCTCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AGCAAAGAGTCCTAATCCCAGCACACCTCGTGGGAAGAAAAGAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113432 AGCAAAGAGTCCTAATCCCAGCACACCTCGTGGGAAGAAAAGAAAGGCTT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 TGCCAGCATCTGAGACCCCAAAAGCTGCAGAGTCTGAGACCCCAGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113482 TGCCAGCATCTGAGACCCCAAAAGCTGCAGAGTCTGAGACCCCAGGGAAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 AGCCCAGAGAAGAAGCCAAAAATCAAAGAAGAGGCAGTGAAGGAAAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113532 AGCCCAGAGAAGAAGCCAAAAATCAAAGAAGAGGCAGTGAAGGAAAAAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 TCCTTCGCTGGGGAAAAAAGATGCGAGACAGACTCCAAAAAAGCCAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113582 TCCTTCGCTGGGGAAAAAAGATGCGAGACAGACTCCAAAAAAGCCAGAGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 CCAAGTTTTTCACCACTCCTAGTAAATCTGTGAGAAAAGCTTCCCACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113632 CCAAGTTTTTCACCACTCCTAGTAAATCTGTGAGAAAAGCTTCCCACACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CCCAAAAAATGGCCCAAAAAACCCAAAGTACCCCAGTCGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113682 CCCAAAAAATGGCCCAAAAAACCCAAAGTACCCCAGTCGACC