seq1 = pF1KE5616.tfa, 1506 bp
seq2 = pF1KE5616/gi568815582r_75500219.tfa (gi568815582r:75500219_75720799), 220581 bp

>pF1KE5616 1506
>gi568815582r:75500219_75720799 (Chr16)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-238  (100466-100534)   100% ->
239-293  (102160-102214)   100% ->
294-424  (103528-103658)   100% ->
425-1043  (107939-108557)   100% ->
1044-1189  (111812-111957)   100% ->
1190-1289  (112477-112576)   100% ->
1290-1376  (117629-117715)   100% ->
1377-1506  (120452-120581)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTGGACCGCGGATGAGATTGCTCAGCTATGCTATGAACACTATGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTGGACCGCGGATGAGATTGCTCAGCTATGCTATGAACACTATGGGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGGCTGCCCAAGAAGGGGAAGCCTGAGCCAAACCATGAGTGGACATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGGCTGCCCAAGAAGGGGAAGCCTGAGCCAAACCATGAGTGGACATTAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCAGCGGTGGTGAAGATACAATCTCCAGCTGACAAGGCCTGCGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCAGCGGTGGTGAAGATACAATCTCCAGCTGACAAGGCCTGCGACACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTGATAAGCCGGTGCAAG         TGACAAAGGAAGTTGTGTCAAT
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 CCTGATAAGCCGGTGCAAGGTG...CAGTGACAAAGGAAGTTGTGTCAAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGGAACAGGAACAAAATGCATAGGACAGTCCAAAATGAGGAAGAACG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100488 GGGAACAGGAACAAAATGCATAGGACAGTCCAAAATGAGGAAGAACGGTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    239       GAGACATCCTCAATGATAGCCATGCTGAGGTCATAGCCAGAAGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100538 ...CAGGAGACATCCTCAATGATAGCCATGCTGAGGTCATAGCCAGAAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTTTCCAAAG         GTACCTTCTCCACCAACTCCAGTTGGCAGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 102204 AGTTTCCAAAGGTA...TAGGTACCTTCTCCACCAACTCCAGTTGGCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CACCCTGAAAGAGGATAGCATCTTTGTCCCAGGAACTCAAAAAGGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103558 CACCCTGAAAGAGGATAGCATCTTTGTCCCAGGAACTCAAAAAGGAGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGAAACTTAGACGAGACCTCATTTTTGTGTTTTTCTCCAGCCATACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103608 GGAAACTTAGACGAGACCTCATTTTTGTGTTTTTCTCCAGCCATACACCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 T         GTGGGGATGCCTCCATCATTCCGATGCTTGAGTTTGAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103658 TGTA...CAGGTGGGGATGCCTCCATCATTCCGATGCTTGAGTTTGAAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TCAGCCTTGCTGTCCTGTCTTCAGAAATTGGGCCCACAACTCATCAGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107979 TCAGCCTTGCTGTCCTGTCTTCAGAAATTGGGCCCACAACTCATCAGTAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGCCAGTAGTAACCTGGAAGCTCCTGGAAATGAAAGAAAATGTGAAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108029 AAGCCAGTAGTAACCTGGAAGCTCCTGGAAATGAAAGAAAATGTGAAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTGACAGTCCTGTAACCAAAAAGATGAGGCTTGAGCCTGGGACTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108079 CCTGACAGTCCTGTAACCAAAAAGATGAGGCTTGAGCCTGGGACTGCAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CAGGGAGGTCACCAACGGAGCAGCTCACCATCAGAGTTTTGGCAAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108129 CAGGGAGGTCACCAACGGAGCAGCTCACCATCAGAGTTTTGGCAAGCAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAAGTGGCCCAATCTCACCAGGCATCCACAGCTGTGATCTCACTGTAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108179 AAAGTGGCCCAATCTCACCAGGCATCCACAGCTGTGATCTCACTGTAGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GGACTGGCTACTGTCACCAGAATAGCCCCTGGTAGTGCCAAAGTGATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108229 GGACTGGCTACTGTCACCAGAATAGCCCCTGGTAGTGCCAAAGTGATAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CGTTTATAGAACTGGAGCCAAGTGTGTACCTGGAGAAGCTGGAGACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108279 CGTTTATAGAACTGGAGCCAAGTGTGTACCTGGAGAAGCTGGAGACTCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GAAAGCCGGGTGCTGCGTTTCACCAGGTGGGGCTGCTCCGAGTGAAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108329 GAAAGCCGGGTGCTGCGTTTCACCAGGTGGGGCTGCTCCGAGTGAAGCCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 GGCCGTGGAGACAGAACACGCTCCATGTCCTGTAGTGACAAGATGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108379 GGCCGTGGAGACAGAACACGCTCCATGTCCTGTAGTGACAAGATGGCCCG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 ATGGAACGTCCTCGGATGCCAAGGGGCACTGTTGATGCACTTGCTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108429 ATGGAACGTCCTCGGATGCCAAGGGGCACTGTTGATGCACTTGCTGGAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 AGCCCATCTACCTGTCAGCTGTGGTCATTGGGAAGTGCCCATACAGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108479 AGCCCATCTACCTGTCAGCTGTGGTCATTGGGAAGTGCCCATACAGCCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 GAAGCCATGCAGAGAGCACTGATTGGAAG         GTGTCAGAATGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 108529 GAAGCCATGCAGAGAGCACTGATTGGAAGGTG...TAGGTGTCAGAATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 GTCTGCTTTACCAAAAGGCTTCGGAGTTCAAGAATTAAAAATACTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111824 GTCTGCTTTACCAAAAGGCTTCGGAGTTCAAGAATTAAAAATACTGCAGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CAGATTTACTATTTGAACAGAGCCGCAGTGCGGTGCAGGCAAAAAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111874 CAGATTTACTATTTGAACAGAGCCGCAGTGCGGTGCAGGCAAAAAGGGCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 GATAGCCCAGGTCGACTTGTTCCTTGTGGGGCAG         CCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 111924 GATAGCCCAGGTCGACTTGTTCCTTGTGGGGCAGGTA...TAGCCATCAG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1197 CTGGAGTGCAGTTCCTGAGCAGCCTTTGGATGTTACTGCCAATGGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112484 CTGGAGTGCAGTTCCTGAGCAGCCTTTGGATGTTACTGCCAATGGCTTTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1247 CACAGGGAACAACAAAGAAAACAATTGGAAGCCTTCAGGCAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 112534 CACAGGGAACAACAAAGAAAACAATTGGAAGCCTTCAGGCAAGGTA...C

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1290   ATCCCAAATCAGCAAAGTGGAACTCTTCAGATCATTCCAGAAGCTGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117627 AGATCCCAAATCAGCAAAGTGGAACTCTTCAGATCATTCCAGAAGCTGCT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1338 AAGCAGAATTGCAAGGGACAAGTGGCCACACTCCCTCAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 117677 AAGCAGAATTGCAAGGGACAAGTGGCCACACTCCCTCAGGTG...TAGGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TGCAGAAGCTGGATACCTACCAGGAGTACAAGGAGGCTGCGTCCTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120454 TGCAGAAGCTGGATACCTACCAGGAGTACAAGGAGGCTGCGTCCTCTTAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 CAGGAAGCCTGGAGCACACTCCGGAAGCAGGTGTTTGGATCCTGGATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120504 CAGGAAGCCTGGAGCACACTCCGGAAGCAGGTGTTTGGATCCTGGATCAG

   1550     .    :    .    :    .
   1479 AAACCCACCGGATTATCACCAGTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 120554 AAACCCACCGGATTATCACCAGTTCAAG