seq1 = pF1KE5582.tfa, 1077 bp
seq2 = pF1KE5582/gi568815587r_56132109.tfa (gi568815587r:56132109_56333185), 201077 bp

>pF1KE5582 1077
>gi568815587r:56132109_56333185 (Chr11)

(complement)

1-1077  (100001-101077)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGTACAGTATATACAAGAGCACAGTTAACATCCCCTTGAGTCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGTACAGTATATACAAGAGCACAGTTAACATCCCCTTGAGTCATGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTGTTCATTCTTTTTGTCATAATATGAACTGTAACTTTATGCATATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTGTTCATTCTTTTTGTCATAATATGAACTGTAACTTTATGCATATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCAAGTTTGTTCTAGATTTCAACATGAAGAATGTCACTGAAGTTACCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCAAGTTTGTTCTAGATTTCAACATGAAGAATGTCACTGAAGTTACCTTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGTACTGAAGGGCTTCACAGACAATCTTGAACTGCAGATTATCTTCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100151 TTTGTACTGAAGGGCTTCACAGACAATCTTGAACTGCAGACTATCTTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCCTGTTTTTAGCAATCTACCTCTTCACTCTCATGGGAAATTTAGGAC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCCTGTTTCTAGCAATCTACCTCTTCACTCTCATGGGAAATTTAGGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGATTTTACTGGTCATTAGGGATTCCCAGCTCCACAAACCCATGTACTAT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGATTTTAGTGGTCATTAGGGATTCCCAGCTCCACAAACCCATGTACTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTCTGAGTATGTTGTCTTCTGTGGATGCCTGCTATTCCTCAGTTATTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTCTGAGTATGTTGTCTTCTGTGGATGCCTGCTATTCCTCAGTTATTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCAAATATGTTAGTAGATTTTACGACAAAGAATAAAGTCATTTCATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCAAATATGTTAGTAGATTTTACGACAAAGAATAAAGTCATTTCATTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTGGATGTGTAGCACAGGTGTTTCTTGCTTGTAGTTTTGGAACCACAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTGGATGTGTAGCACAGGTGTTTCTTGCTTGTAGTTTTGGAACCACAGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGCTTTCTCTTGGCTGCAATGGCTTATGATCGCTATGTAGCCATCTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGCTTTCTCTTGGCTGCAATGGCTTATGATCGCTATGTAGCCATCTACAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCCTCTCCTGTATTCAGTGAGCATGTCACCCAGAGTCTACATGCCACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCCTCTCCTGTATTCAGTGAGCATGTCACCCAGAGTCTACATGCCACTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCAATGCTTCCTATGTTGCTGGCATTTTACATGCTACTATACATACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCAATGCTTCCTATGTTGCTGGCATTTTACATGCTACTATACATACAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTACATTTAGCCTATCCTTCTGTGGAGCCAATGAAATTAGGCGTGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTACATTTAGCCTATCCTTCTGTGGAGCCAATGAAATTAGGCGTGTCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTGTGATATCCCTCCTCTCCTTGCTATTTCTTATTCTGACACTCACACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTGTGATATCCCTCCTCTCCTTGCTATTTCTTATTCTGACACTCACACAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACCAGCTTCTAGTCTTCTACTTTGTGGGCTCTATCGAGCTGGTCACTATC
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACCAGCTTCTACTCTTCTACTTTGTGGGCTCTATCGAGCTGGTCACTATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGATTGTTCTGATCTCCTATGGTTTGATTCTGTTGGCCATTCTGAAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGATTGTTCTGATCTCCTATGGTTTGATTCTGTTGGCCATTCTGAAGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTATTCTGCTGAAGGGAGGAGAAAAGTCTTCTCCACATGTGGAGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
 100801 GTATTCTGCTGAAGGGAGGAGAAAAGTCTTCTCCACATGTGGAGCTCACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAACTGGAGTGTCAATTTATTATGGGACAATCCTCTTCATGTATGTGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAACTGGAGTGTCAATTTATTATGGGACAATCCTCTTCATGTATGTGAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCAAGTTCCAGCTATGCTTCGGACCATGACATGATAGTGTCAATATTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCAAGTTCCAGCTATGCTTCGGACCATGACATGATAGTGTCAATATTTTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACCATTGTGATTCCCTTGCTGAATCCCGTCATCTACAGTTTGAGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACCATTGTGATTCCCTTGCTGAATCCCGTCATCTACAGTTTGAGGAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AAGATGTAAAAGACTCAATGAAAAAAATGTTTGGGAAAAATCAGGTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AAGATGTAAAAGACTCAATGAAAAAAATGTTTGGGAAAAATCAGGTTATC

   1050     .    :    .    :    .
   1051 AATAAAGTATATTTTCATACTAAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 101051 AATAAAGTATATTTTCATACTAAAAAA