seq1 = pF1KE5580.tfa, 1071 bp
seq2 = pF1KE5580/gi568815592r_27811249.tfa (gi568815592r:27811249_28012319), 201071 bp

>pF1KE5580 1071
>gi568815592r:27811249_28012319 (Chr6)

(complement)

1-1071  (100001-101071)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATTGGGTAAATAAGAGTGTCCCACAGGAGTTCATTCTGTTAGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATTGGGTAAATAAGAGTGTCCCACAGGAGTTCATTCTGTTAGTTTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCAGATCAACCATGGCTAGAGATTCCACCCTTTGTGATGTTTCTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCAGATCAACCATGGCTAGAGATTCCACCCTTTGTGATGTTTCTGTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTATATCTTGACAATCTTTGGCAATCTGACAATAATTCTTGTGTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTATATCTTGACAATCTTTGGCAATCTGACAATAATTCTTGTGTCACAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGGATTTCAAACTCCACACCCCTATGTACTTTTTTCTTAGCAATCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGGATTTCAAACTCCACACCCCTATGTACTTTTTTCTTAGCAATCTCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ACTCCTGGACCTTTGCTATACCACAAGTACAGTTCCACAAATGCTGGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 ACTCCTGGACCTTTGCTATACCACAAGTACAGTTCCACAAATGCTGGTAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACATATGCAACACCAGGAAAGTAATCAGTTATGGTGGCTGTGTGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACATATGCAACACCAGGAAAGTAATCAGTTATGGTGGCTGTGTGGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTTTCATTTTCCTGGCCTTGGGTTCCACAGAATGTCTTCTCCTGGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTTTCATTTTCCTGGCCTTGGGTTCCACAGAATGTCTTCTCCTGGCCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGTGCTTTGATAGGTTTGTAGCTATTTGTCGGCCTCTCCATTACTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGTGCTTTGATAGGTTTGTAGCTATTTGTCGGCCTCTCCATTACTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTATCATGCACCAGAGGCTCTGCTTCCAGTTGGCAGCTGCATCCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTATCATGCACCAGAGGCTCTGCTTCCAGTTGGCAGCTGCATCCTGGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGTGGCTTTAGCAATTCAGTATTACAGTCCACCTGGACACTTAAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGTGGCTTTAGCAATTCAGTATTACAGTCCACCTGGACACTTAAGATGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTGTGTGGTCACAAAGAAGTGGATCACTTCTTCTGTGAAGTCCCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTGTGTGGTCACAAAGAAGTGGATCACTTCTTCTGTGAAGTCCCTGCTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGCTCAAGTTGTCCTGTGTTGACACAACAGCAAATGAGGCTGAACTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGCTCAAGTTGTCCTGTGTTGACACAACAGCAAATGAGGCTGAACTATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCATCAGTGTGCTATTCCTTCTAATACCCGTGACACTCATCCTTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCATCAGTGTGCTATTCCTTCTAATACCCGTGACACTCATCCTTATATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTATGCTTTTATTGTCCAAGCAGTGTTGAGAATCCAGTCTGCTGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTATGCTTTTATTGTCCAAGCAGTGTTGAGAATCCAGTCTGCTGAAGGTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AACGAAAGGCATTTGGGACATGTGGCTCCCATCTAATTGTGGTGTCACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AACGAAAGGCATTTGGGACATGTGGCTCCCATCTAATTGTGGTGTCACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTTATGGTACAGCTATCTCCATGTACCTGCAACCACCTTCACCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTTATGGTACAGCTATCTCCATGTACCTGCAACCACCTTCACCCAGCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CAAAGACCGGGGAAAGATGGTTTCTCTCTTCTGTGGAATCATTGCACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CAAAGACCGGGGAAAGATGGTTTCTCTCTTCTGTGGAATCATTGCACCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAATCCCCTTATATATACACTTAGGAACAAAGAGGTAAAGGAAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAATCCCCTTATATATACACTTAGGAACAAAGAGGTAAAGGAAGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTTAAAAGGTTGGTTGCAAAGAGTCTTCTTAATCAAGAAATAAGAAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTTAAAAGGTTGGTTGCAAAGAGTCTTCTTAATCAAGAAATAAGAAATAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GCAAATGATAAGCTTTGCTAAAGACACAGTGCTTACTTACCTTACTAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GCAAATGATAAGCTTTGCTAAAGACACAGTGCTTACTTACCTTACTAACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCTCCGCAAGTTGTCCTATTTTTGTCATTACTATAGAAAACTATTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCTCCGCAAGTTGTCCTATTTTTGTCATTACTATAGAAAACTATTGTAAT

   1050     .    :    .    :
   1051 CTCCCTCAAAGAAAATTTCCT
        |||||||||||||||||||||
 101051 CTCCCTCAAAGAAAATTTCCT