seq1 = pF1KE5562.tfa, 1236 bp
seq2 = pF1KE5562/gi568815583r_30262296.tfa (gi568815583r:30262296_32521730), 2259435 bp

>pF1KE5562 1236
>gi568815583r:30262296_32521730 (Chr15)

1-33  (320630-320662)   100% ->
34-80  (323583-323629)   97% ->
81-160  (1891612-1891691)   100% ->
161-328  (1895313-1895480)   100% ->
329-523  (1896117-1896311)   99% ->
524-610  (1897274-1897360)   100% ->
611-720  (1900931-1901040)   99% ->
721-1236  (1905645-1906160)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAAAATATTGCATCTACCAGCATTTTCAG         TTCCAATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 320630 ATGCAAAAATATTGCATCTACCAGCATTTTCAGGTA...TAGTTCCAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTAATCCAGCATTTGTGGATAGCTGCAAACTGCGATAT         TG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||>>>...>>>||
 323591 GCTAATCCAGCATTTGTGGATAGCTGCAAACTGTGATATGTA...TAGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     83 CTGATGAGCGCTTTGACGCCACATTCCACACTAACGTGTTGGTGAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1891614 CTGATGAGCGCTTTGACGCCACATTCCACACTAACGTGTTGGTGAATTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TCTGGGCATTGCCAGTACCTGCCTCCAG         GCATATTCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
1891664 TCTGGGCATTGCCAGTACCTGCCTCCAGGTA...CAGGCATATTCAAGAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 TTCCTGCTACATCGATGTACGCTGGTTTCCCTTTGATGTGCAGCACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1895326 TTCCTGCTACATCGATGTACGCTGGTTTCCCTTTGATGTGCAGCACTGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 AACTGAAGTTTGGGTCCTGGTCTTACGGAGGCTGGTCCTTGGATCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1895376 AACTGAAGTTTGGGTCCTGGTCTTACGGAGGCTGGTCCTTGGATCTGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ATGCAGGAGGCAGATATCAGTGGCTATATCCCCAATGGAGAATGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1895426 ATGCAGGAGGCAGATATCAGTGGCTATATCCCCAATGGAGAATGGGACCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGTGG         GAATCCCCGGCAAGAGGAGTGAAAGGTTCTATGAGT
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1895476 AGTGGGTA...GAGGAATCCCCGGCAAGAGGAGTGAAAGGTTCTATGAGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GCTGCAAAGAGCCCTACCCCGATGTCACCTTCACAGTGACCATGCGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1896153 GCTGCAAAGAGCCCTACCCCGATGTCACCTTCACAGTGACCATGCGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AGGACACTCTACTATGGCCTCAACCTGCTGATCCCCTGTGTGCTCATCTC
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1896203 AGGACGCTCTACTATGGCCTCAACCTGCTGATCCCCTGTGTGCTCATCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CGCCCTCGCCCTGCTGGTGTTCCTGCTTCCTGCAGATTCCGGGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1896253 CGCCCTCGCCCTGCTGGTGTTCCTGCTTCCTGCAGATTCCGGGGAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTTCCCTGG         GGATAACAGTCTTACTCTCTCTTACCGTCTTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
1896303 TTTCCCTGGGTA...TAGGGATAACAGTCTTACTCTCTCTTACCGTCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 ATGCTGCTCGTGGCTGAGATCATGCCCGCAACATCCGATTCGGTACCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1897306 ATGCTGCTCGTGGCTGAGATCATGCCCGCAACATCCGATTCGGTACCATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GATAG         CCCAGTACTTCGCCAGCACCATGATCATCGTGGGCC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1897356 GATAGGTA...CAGCCCAGTACTTCGCCAGCACCATGATCATCGTGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCTCGGTGGTGGTGACGGTGATCGTGCTGCAGTACCACCACCACGACCCC
        |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
1900967 TCTCGGTGGTGGTGACAGTGATCGTGCTGCAGTACCACCACCACGACCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GACGGGGGCAAGATGCCCAAGTGG         ACCAGAGTCATCCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
1901017 GACGGGGGCAAGATGCCCAAGTGGGTA...CAGACCAGAGTCATCCTTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GAACTGGTGCGCGTGGTTCCTGCGAATGAAGAGGCCCGGGGAGGACAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905662 GAACTGGTGCGCGTGGTTCCTGCGAATGAAGAGGCCCGGGGAGGACAAGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGCGCCCGGCCTGCCAGCACAAGCAGCGGCGCTGCAGCCTGGCCAGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905712 TGCGCCCGGCCTGCCAGCACAAGCAGCGGCGCTGCAGCCTGGCCAGTGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GAGATGAGCGCCGTGGCGCCGCCGCCCGCCAGCAACGGGAACCTGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905762 GAGATGAGCGCCGTGGCGCCGCCGCCCGCCAGCAACGGGAACCTGCTGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CATCGGCTTCCGCGGCCTGGACGGCGTGCACTGTGTCCCGACCCCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905812 CATCGGCTTCCGCGGCCTGGACGGCGTGCACTGTGTCCCGACCCCCGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CTGGGGTAGTGTGTGGCCGCATGGCCTGCTCCCCCACGCACGATGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905862 CTGGGGTAGTGTGTGGCCGCATGGCCTGCTCCCCCACGCACGATGAGCAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CTCCTGCACGGTGGGCAACCCCCCGAGGGGGACCCGGACTTGGCCAAGAT
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905912 CTCCTGCACGGCGGGCAACCCCCCGAGGGGGACCCGGACTTGGCCAAGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CCTGGAGGAGGTCCGCTACATTGCCAACCGCTTCCGCTGCCAGGACGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1905962 CCTGGAGGAGGTCCGCTACATTGCCAACCGCTTCCGCTGCCAGGACGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 GCGAGGCGGTCTGCAGCGAGTGGAAGTTCGCCGCCTGTGTGGTGGACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1906012 GCGAGGCGGTCTGCAGCGAGTGGAAGTTCGCCGCCTGTGTGGTGGACCGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 CTGTGCCTCATGGCCTTCTCGGTCTTCACCATCATCTGCACCATCGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1906062 CTGTGCCTCATGGCCTTCTCGGTCTTCACCATCATCTGCACCATCGGCAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1188 CCTGATGTCGGCTCCCAACTTCGTGGAGGCCGTGTCCAAAGACTTTGCG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1906112 CCTGATGTCGGCTCCCAACTTCGTGGAGGCCGTGTCCAAAGACTTTGCG