seq1 = pF1KE5557.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KE5557/gi568815587r_126103421.tfa (gi568815587r:126103421_126311638), 208218 bp

>pF1KE5557 1131
>gi568815587r:126103421_126311638 (Chr11)

(complement)

1-189  (100001-100189)   100% ->
190-355  (100584-100749)   100% ->
356-557  (101917-102118)   100% ->
558-651  (105858-105951)   100% ->
652-796  (106027-106171)   100% ->
797-894  (107311-107408)   100% ->
895-1131  (107982-108218)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGCGCCCAGGTGGAGCGCGTCGGGCCCCTGGATCCGGGGAAACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGCGCCCAGGTGGAGCGCGTCGGGCCCCTGGATCCGGGGAAACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAAGGTTGCGGGAGTCTCTTCACTCTCGTCTCAAAGCCATTTTGTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAAGGTTGCGGGAGTCTCTTCACTCTCGTCTCAAAGCCATTTTGTGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCGCTGCCTCTACGGCCATAAATGCCCAGAGATTAGCGGAGAAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCCGCTGCCTCTACGGCCATAAATGCCCAGAGATTAGCGGAGAAGCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGAGCCCAGAAACGGGAACAAGACACAAAGAAGGAGCCG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100151 CGAGCCCAGAAACGGGAACAAGACACAAAGAAGGAGCCGGTG...TAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GTCCACAAACGCTGTTCAGCGGAGAGTGCAAGAAATAGTGCGGTTCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100586 GTCCACAAACGCTGTTCAGCGGAGAGTGCAAGAAATAGTGCGGTTCACAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GGCAGCTGCAGCGAGTCCACCCCAACGTGCTTGCTAAGGCACTGACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100636 GGCAGCTGCAGCGAGTCCACCCCAACGTGCTTGCTAAGGCACTGACCCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGAATTCTCCACCAGGACAAGAACCTTGTGGTCATCAATAAGCCCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100686 GGAATTCTCCACCAGGACAAGAACCTTGTGGTCATCAATAAGCCCTACGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCTCCCTGTGCATG         GTGGCCCTGGGGTCCAGCTCTGCATCA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100736 TCTCCCTGTGCATGGTA...TAGGTGGCCCTGGGGTCCAGCTCTGCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGATGTACTACCTATCCTGGCAAAGATGCTTCATGGCCACAAGGCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101944 CTGATGTACTACCTATCCTGGCAAAGATGCTTCATGGCCACAAGGCAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCTTGCATCTGTGCCACCGGCTGGACAAGGAAACCACAGGTGTAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101994 CCCTTGCATCTGTGCCACCGGCTGGACAAGGAAACCACAGGTGTAATGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GTTGGCTTGGGACAAGGACATGGCACATCAAGTCCAAGAGTTGTTTAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102044 GTTGGCTTGGGACAAGGACATGGCACATCAAGTCCAAGAGTTGTTTAGAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCCGTCAGGTGGTGAAGAAGTACTG         GGCCATCACTGTGCAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102094 CCCGTCAGGTGGTGAAGAAGTACTGGTA...CAGGGCCATCACTGTGCAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GTCCCCATGCCCTCAGCAGGAGTCGTGGACATCCCCATTGTGGAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105874 GTCCCCATGCCCTCAGCAGGAGTCGTGGACATCCCCATTGTGGAGAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGCGCAAGGCCAGCAGCAACACCACAAG         ATGACATTGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 105924 GGCGCAAGGCCAGCAGCAACACCACAAGGTG...CAGATGACATTGTCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CGAGCTACCGCATGGACGATGGGAAAATGGTGAAAGTGCGGCGCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106040 CGAGCTACCGCATGGACGATGGGAAAATGGTGAAAGTGCGGCGCAGCCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 AATGCGCAAGTTGCTGTAACTCAGTACCAGGTGCTCAGCAGCACTCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106090 AATGCGCAAGTTGCTGTAACTCAGTACCAGGTGCTCAGCAGCACTCTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCCGCCCTCGTGGAGCTCCAGCCCATCACTG         GAATAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 106140 CTCCGCCCTCGTGGAGCTCCAGCCCATCACTGGTG...AAGGAATAAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATCAGCTTCGAGTTCACTTGTCTTTTGGATTGGATTGTCCAATCCTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107320 ATCAGCTTCGAGTTCACTTGTCTTTTGGATTGGATTGTCCAATCCTTGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GATCACAAGTACTCAGACTGGAATAGGTTGGCCCCCCAG         AA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 107370 GATCACAAGTACTCAGACTGGAATAGGTTGGCCCCCCAGGTA...TAGAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GCTGTCTGTGGGCACCCTGAAGAAGCTGGGGCTAGAACAGTCGAAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107984 GCTGTCTGTGGGCACCCTGAAGAAGCTGGGGCTAGAACAGTCGAAGGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GCTACATCCCCCTTCACCTGCACGCCCGGCAGCTGATCCTGCCTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108034 GCTACATCCCCCTTCACCTGCACGCCCGGCAGCTGATCCTGCCTGCCCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GGGTCCGGGAAGGAGGAACTCAACTTGGTCTGCAAACTTCCTCGCTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108084 GGGTCCGGGAAGGAGGAACTCAACTTGGTCTGCAAACTTCCTCGCTTCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 TGTGCATTCCCTGCACCGCCTGCGTTTAGAGATGCCAAATGAGGATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108134 TGTGCATTCCCTGCACCGCCTGCGTTTAGAGATGCCAAATGAGGATCAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1097 ATGAGAACAATGAAGCCAAGTGTCTGGGAGCACAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108184 ATGAGAACAATGAAGCCAAGTGTCTGGGAGCACAG