seq1 = pF1KE5512.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KE5512/gi568815583r_75498361.tfa (gi568815583r:75498361_75721051), 222691 bp

>pF1KE5512 1080
>gi568815583r:75498361_75721051 (Chr15)

(complement)

1-158  (100001-100158)   100% ->
159-303  (103500-103644)   100% ->
304-408  (111058-111162)   100% ->
409-502  (111401-111494)   100% ->
503-600  (113739-113836)   100% ->
601-678  (115825-115902)   100% ->
679-759  (119834-119914)   100% ->
760-1080  (122371-122691)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGAGTTGAGTCAGGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGAGTTGAGTCAGGCCCTGGCTAGTAGCTTTTCTGTGTCTCAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTGAACAGCACAGCTGCCCCACACCCCCGCCTATCCCAGTACAAGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTGAACAGCACAGCTGCCCCACACCCCCGCCTATCCCAGTACAAGTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGCCGCCGGAGGTTACTGGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTACAGTTCCTTGGAGCAGAGTGAGCGCCGCCGGAGGTTACTGGAACTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CAGAAATC         CAAGCGGCTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CAGAAATCGTA...CAGCAAGCGGCTGGATTATGTGAACCATGCCAGAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGGATGGAGAGTGAGGAAGAAAATAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103533 ACTGGCTGAAGATGACTGGACAGGGATGGAGAGTGAGGAAGAAAATAAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAGATGATGAAGAAATGGACATTGACACTGTCAAGAAGTTACCAAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103583 AAGATGATGAAGAAATGGACATTGACACTGTCAAGAAGTTACCAAAACAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TATGCTAATCAA         TTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 103633 TATGCTAATCAAGTA...CAGTTGATGCTTTCTGAGTGGTTAATTGACGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCCTTCAGATTTGGGGCAGGAATGGATTGTGGTCGTGTGCCCTGTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111087 TCCTTCAGATTTGGGGCAGGAATGGATTGTGGTCGTGTGCCCTGTTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGG         GGTTCTACCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 111137 AAAGAGCCCTTATCGTGGCCTCCAGGGTG...CAGGGTTCTACCAGTGCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TACACCAAGAGTGGCTACTGTGTCAACAGGTTTTCTTCACTTCTGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111416 TACACCAAGAGTGGCTACTGTGTCAACAGGTTTTCTTCACTTCTGCCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGCAACAGGCGAAACTCAACAGCAAAAG         ACTACACCATTC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 111466 AGGCAACAGGCGAAACTCAACAGCAAAAGGTA...CAGACTACACCATTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAGATTGCATTTACAATGAGGTAAACCAGACCTACTACGTTCTGGATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113751 TAGATTGCATTTACAATGAGGTAAACCAGACCTACTACGTTCTGGATGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGTGCTGGCGGGGACACCCTTTTTATGATTGCCAG         ACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 113801 ATGTGCTGGCGGGGACACCCTTTTTATGATTGCCAGGTA...CAGACTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 TTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115830 TTTCCGATTCTACTGGATGCATTCAAAGTTACCAGAAGAAGAAGGACTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GAGAGAAAACCAAGCTTAATCCT         TTTAAATTTGTGGGGCTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 115880 GAGAGAAAACCAAGCTTAATCCTGTA...CAGTTTAAATTTGTGGGGCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 AAGAACTTCCCTTGCACTCCCGAAAGCCTGTGTGATGTGCTATCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119852 AAGAACTTCCCTTGCACTCCCGAAAGCCTGTGTGATGTGCTATCTATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TTTCCCTTTTGAG         GTAGATGGACTTCTCTTCTACCACAAAC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 119902 TTTCCCTTTTGAGGTA...TAGGTAGATGGACTTCTCTTCTACCACAAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGACCCACTACAGCCCCGGAAGCACTCCCTTGGTGGGCTGGCTGCGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122399 AGACCCACTACAGCCCCGGAAGCACTCCCTTGGTGGGCTGGCTGCGCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TACATGGTGTCAGATGTCCTTGGTGTAGCTGTGCCGGCTGGCCCGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122449 TACATGGTGTCAGATGTCCTTGGTGTAGCTGTGCCGGCTGGCCCGCTGAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CACCAAGCCAGACTATGCTGGGCACCAGCTCCAGCAGATTATGGAGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122499 CACCAAGCCAGACTATGCTGGGCACCAGCTCCAGCAGATTATGGAGCACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AGAAGAGCCAGAAGGAAGGCATGAAGGAGAAACTCACACACAAGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122549 AGAAGAGCCAGAAGGAAGGCATGAAGGAGAAACTCACACACAAGGCCTCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GAGAATGGGCACTATGAATTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGTTGAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122599 GAGAATGGGCACTATGAATTGGAGCACCTGTCTACTCCCAAGTTGAAGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TTCTTCCCATAGCCCAGACCACCCTGGATGCCTCATGGAGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122649 TTCTTCCCATAGCCCAGACCACCCTGGATGCCTCATGGAGAAT