seq1 = pF1KE5489.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KE5489/gi568815584f_20017407.tfa (gi568815584f:20017407_20218435), 201029 bp

>pF1KE5489 1029
>gi568815584f:20017407_20218435 (Chr14)

1-1029  (100001-101029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTTTATTTTTCACTCATACTCCATGGTATGAGTGATCTTTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCTTTATTTTTCACTCATACTCCATGGTATGAGTGATCTTTTCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTCTCTACAGGTCATCCAAGAGCGAGCTGTAGGATGGAGGCCATGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTCTCTACAGGTCATCCAAGAGCGAGCTGTAGGATGGAGGCCATGAAAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TATTAAATCAATCTCAAGTGTCAGAATTCATTTTGCTGGGACTGACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TATTAAATCAATCTCAAGTGTCAGAATTCATTTTGCTGGGACTGACCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCAGGATGTAGAGTTTCTTCTCTTTGCCCTCTTCTCGGTTATCTATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCAGGATGTAGAGTTTCTTCTCTTTGCCCTCTTCTCGGTTATCTATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGTCACAGTTTTGGGTAACCTTCTTATTATAGTCACAGTGTTTAACACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGTCACAGTTTTGGGTAACCTTCTTATTATAGTCACAGTGTTTAACACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTAACCTGAATACTCCCATGTATTTTCTCCTTGGTAATCTCTCTTTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTAACCTGAATACTCCCATGTATTTTCTCCTTGGTAATCTCTCTTTTGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATATGACCCTTGCTTCTTTTGCCACCCCTAAGGTGATTCTGAACTTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATATGACCCTTGCTTCTTTTGCCACCCCTAAGGTGATTCTGAACTTGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAAAAAGCAGAAGGTAATTTCTTTTGCTGGGTGCTTCACTCAGATATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAAAAAGCAGAAGGTAATTTCTTTTGCTGGGTGCTTCACTCAGATATTTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTTCACTTACTGGGTGGGGTTGAAATGGTACTGTTGGTCTCCATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTTCACTTACTGGGTGGGGTTGAAATGGTACTGTTGGTCTCCATGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTGACAGATATGTGGCCATTTGTAAGCCCCTACACTACATGACCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTGACAGATATGTGGCCATTTGTAAGCCCCTACACTACATGACCATCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAACAAGAAGGTATGTGTTTTGCTTGTAGTGACCTCATGGCTCTTGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAACAAGAAGGTATGTGTTTTGCTTGTAGTGACCTCATGGCTCTTGGGTC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTTCACTCAGGGTTTCAGATACCATTTGCTGTGAACTTGCCCTTTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTTCACTCAGGGTTTCAGATACCATTTGCTGTGAACTTGCCCTTTTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGTCCCAATGTGGTAGACAGCATTTTTTGTGACCTCCCTTTGGTTACTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGTCCCAATGTGGTAGACAGCATTTTTTGTGACCTCCCTTTGGTTACTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCTTGCCTGTATAGACATATATTTTGTACAGGTAGTCATTGTTGCCAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCTTGCCTGTATAGACATATATTTTGTACAGGTAGTCATTGTTGCCAACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTGGCATAATCTCCCTGAGCTGTTTCATTATTTTGCTTATCTCCTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTGGCATAATCTCCCTGAGCTGTTTCATTATTTTGCTTATCTCCTACAGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTGATCCTCATAACCATTAAGAACCACTCTCCTACTGGGCAATCTAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTGATCCTCATAACCATTAAGAACCACTCTCCTACTGGGCAATCTAAAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCGTTCCACTTTGACTGCTCACATCACAGTGGTGATTCTCTTCTTTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCGTTCCACTTTGACTGCTCACATCACAGTGGTGATTCTCTTCTTTGGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CATGCATCTTTATCTACATTTGGCCCTTCGGCAACCACTCTGTAGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CATGCATCTTTATCTACATTTGGCCCTTCGGCAACCACTCTGTAGATAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCCTTGCTGTGTTTTATACCATCATCACTCCTATCTTGAATCCAATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCCTTGCTGTGTTTTATACCATCATCACTCCTATCTTGAATCCAATTAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CTATACTCTGAGAAACAAAGAAATGAAGATATCCATGAAAAAACTCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CTATACTCTGAGAAACAAAGAAATGAAGATATCCATGAAAAAACTCTGGA

   1000     .    :    .    :    .
   1001 GAGCTTTTGTGAATTCTAGAGAAGATACT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GAGCTTTTGTGAATTCTAGAGAAGATACT