seq1 = pF1KE5481.tfa, 993 bp
seq2 = pF1KE5481/gi568815587r_123876699.tfa (gi568815587r:123876699_124077691), 200993 bp

>pF1KE5481 993
>gi568815587r:123876699_124077691 (Chr11)

(complement)

1-993  (100001-100993)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTAGCCGCTCTGTGTGTGAGAAGATGACCATGACAACGGAGAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTAGCCGCTCTGTGTGTGAGAAGATGACCATGACAACGGAGAACCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCAGACTGTGGTGAGCCACTTCTTCCTGGAGGGTTTGAGGTACACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCAGACTGTGGTGAGCCACTTCTTCCTGGAGGGTTTGAGGTACACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTAAACATTCTAGCCTCTTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCATCTACAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTAAACATTCTAGCCTCTTCTTCCTCCTCTTCCTCCTCATCTACAGCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGTGGCTGGGAATCTCCTCATCCTCCTAACTGTGGGCTCTGACTCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTGTGGCTGGGAATCTCCTCATCCTCCTAACTGTGGGCTCTGACTCTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCAGCTTACCCATGTACCACTTCCTGGGGCACCTCTCCTTCCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCAGCTTACCCATGTACCACTTCCTGGGGCACCTCTCCTTCCTGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCTGTTTGTCTACAGTGACAGTGCCCAAGGTCATGGCAGGCCTGCTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCTGTTTGTCTACAGTGACAGTGCCCAAGGTCATGGCAGGCCTGCTGACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGATGGGAAGGTGATCTCCTTTGAGGGCTGTGCCGTACAGCTTTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGATGGGAAGGTGATCTCCTTTGAGGGCTGTGCCGTACAGCTTTATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCCACTTTCTGGCCAGCACTGAGTGCTTCCTGTACACAGTCATGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCCACTTTCTGGCCAGCACTGAGTGCTTCCTGTACACAGTCATGGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ATGACCGCTATCTGGCTATCTGTCAACCCCTGCACTACCCAGTGGCCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ATGACCGCTATCTGGCTATCTGTCAACCCCTGCACTACCCAGTGGCCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AACAGAAGGATGTGTGCAGAAATGGCTGGAATCACCTGGGCCATAGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AACAGAAGGATGTGTGCAGAAATGGCTGGAATCACCTGGGCCATAGGTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CACGCACGCTGCAATCCACACCTCCCTCACCTTCCGCCTGCTCTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CACGCACGCTGCAATCCACACCTCCCTCACCTTCCGCCTGCTCTACTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGCCTTGCCACATTGCCTACTTCTTCTGCGACATACCCCCTGTCCTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGCCTTGCCACATTGCCTACTTCTTCTGCGACATACCCCCTGTCCTAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCGCCTGTACAGACACCACCATTAATGAGCTAGTCATGCTTGCCAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCGCCTGTACAGACACCACCATTAATGAGCTAGTCATGCTTGCCAGCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGGCATCGTGGCTGCAGGCTGCCTCATCCTCATCGTTATTTCCTACATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGGCATCGTGGCTGCAGGCTGCCTCATCCTCATCGTTATTTCCTACATCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCATCGTGGCAGCTGTGTTGCGCATCCGCACAGCCCAGGGCCGGCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCATCGTGGCAGCTGTGTTGCGCATCCGCACAGCCCAGGGCCGGCAGCGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GCCTTCTCCCCCTGCACTGCCCAGCTCACTGGGGTGCTCCTGTACTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GCCTTCTCCCCCTGCACTGCCCAGCTCACTGGGGTGCTCCTGTACTACGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCCACCTGTCTGTATCTACCTGCAGCCTCGCTCCAGTGAGGCAGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCCACCTGTCTGTATCTACCTGCAGCCTCGCTCCAGTGAGGCAGGAGCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GGGCCCCTGCTGTCTTCTACACAATCGTAACTCCAATGCTCAACCCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGGCCCCTGCTGTCTTCTACACAATCGTAACTCCAATGCTCAACCCATTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATTTACACTTTGCGGAACAAGGAGGTGAAGCATGCTCTGCAAAGGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATTTACACTTTGCGGAACAAGGAGGTGAAGCATGCTCTGCAAAGGCTTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTGCAGCAGCTTCCGAGAGTCTACAGCAGGCAGCCCACCCCCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTGCAGCAGCTTCCGAGAGTCTACAGCAGGCAGCCCACCCCCA