seq1 = pF1KE5479.tfa, 993 bp
seq2 = pF1KE5479/gi568815596r_239945080.tfa (gi568815596r:239945080_240146072), 200993 bp

>pF1KE5479 993
>gi568815596r:239945080_240146072 (Chr2)

(complement)

1-993  (100001-100993)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTGGGGAGAATGTCACCAGGGTCGGCACCTTCATCCTGGTGGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTGGGGAGAATGTCACCAGGGTCGGCACCTTCATCCTGGTGGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCACGGCCCCAGGGCTGCAGTACCTGCTCTTCCTCCTCTTCCTGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCACGGCCCCAGGGCTGCAGTACCTGCTCTTCCTCCTCTTCCTGCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTACCTCTTTGTCCTGGTGGAGAACCTGGCCATCATCCTCACCGTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTACCTCTTTGTCCTGGTGGAGAACCTGGCCATCATCCTCACCGTCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCAGCACCTCCCTCCACAGGCCCATGTACTACTTTCTGAGCTCCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCAGCACCTCCCTCCACAGGCCCATGTACTACTTTCTGAGCTCCATGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTCCTAGAGATCTGGTACGTGTCTGACATCACCCCCAAGATGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTCCTAGAGATCTGGTACGTGTCTGACATCACCCCCAAGATGCTGGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTCCTCCTCCAGCAGAAACGCATCTCTTTCGTCGGGTGCATGACGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTCCTCCTCCAGCAGAAACGCATCTCTTTCGTCGGGTGCATGACGCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTACTTCTTCAGCTCCCTGGTGTGCACCGAGTGTGTGCTTCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTACTTCTTCAGCTCCCTGGTGTGCACCGAGTGTGTGCTTCTGGCCTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTACGACCGCTACGTGGCCATCTGCCACCCGCTGCGCTACCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTACGACCGCTACGTGGCCATCTGCCACCCGCTGCGCTACCACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCTTGTGACCCCGGGGCTGTGCCTCCAGCTGGTGGGCTTCTCCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCTTGTGACCCCGGGGCTGTGCCTCCAGCTGGTGGGCTTCTCCTTTGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGTGGCTTCACCATCTCCATGATCAAGGTCTGTTTTATCTCCAGCGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGTGGCTTCACCATCTCCATGATCAAGGTCTGTTTTATCTCCAGCGTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTTCTGTGGCTCCAACGTCTTGAACCACTTCTTCTGTGACATTTCCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTTCTGTGGCTCCAACGTCTTGAACCACTTCTTCTGTGACATTTCCCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTCAAGCTGGCCTGCACGGACTTCTCCACTGCAGAGCTGGTGGATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTCAAGCTGGCCTGCACGGACTTCTCCACTGCAGAGCTGGTGGATTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTCTGGCCTTCATCATCCTGGTGTTTCCACTCCTGGCCACCATGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTCTGGCCTTCATCATCCTGGTGTTTCCACTCCTGGCCACCATGCTGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATATGCGCACATCACCCTGGCTGTCCTGCGCATCCCCTCGGCCACCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ATATGCGCACATCACCCTGGCTGTCCTGCGCATCCCCTCGGCCACCGGCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCTGGAGAGCCTTCTTCACCTGCGCCTCTCACCTCACCGTGGTCACCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCTGGAGAGCCTTCTTCACCTGCGCCTCTCACCTCACCGTGGTCACCGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATACAGCCTTGCTTTTCATGTATGTCCGGCCCCAGGCCATTGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATACAGCCTTGCTTTTCATGTATGTCCGGCCCCAGGCCATTGATTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCGGAGCTCCAACAAGCTCATCTCTGTTTTGTACACAGTTATCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCGGAGCTCCAACAAGCTCATCTCTGTTTTGTACACAGTTATCACCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTTGAACCCCTTGATATACTGCCTGAGGAATAAGGAATTTAAGAATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTTGAACCCCTTGATATACTGCCTGAGGAATAAGGAATTTAAGAATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTGAAAAAAGCCTTCGGCTTGACGAGCTGCGCCGTAGAGGGGAGGCTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGAAAAAAGCCTTCGGCTTGACGAGCTGCGCCGTAGAGGGGAGGCTTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TAGTCTTCTGGAACTTCATCTCCAAATACACAGCCAGCCTCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TAGTCTTCTGGAACTTCATCTCCAAATACACAGCCAGCCTCTC