seq1 = pF1KE5474.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KE5474/gi568815587r_6694728.tfa (gi568815587r:6694728_6895708), 200981 bp

>pF1KE5474 981
>gi568815587r:6694728_6895708 (Chr11)

(complement)

1-981  (100001-100981)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTGGCGGAACCATAGTGGGAGAGTGAGTGAGTTTGTGTTGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGTGGCGGAACCATAGTGGGAGAGTGAGTGAGTTTGTGTTGCTGGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCCTGCTCCTGCGCCACTACAGGTACTATTGTTTGCCCTTTTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCCTGCTCCTGCGCCACTACAGGTACTATTGTTTGCCCTTTTGCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGCCTATGTGTTGGTGCTGACTGAGAACACACTCATCATTATGGCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGCCTATGTGTTGGTGCTGACTGAGAACACACTCATCATTATGGCAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGGAACCATTCTACCCTCCACAAACCCATGTACTTTTTTCTAGCTAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGGAACCATTCTACCCTCCACAAACCCATGTACTTTTTTCTAGCTAATAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTCCTTTCTGGAGATCTGGTATGTCACTGTCACTATTCCCAAGATGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTCCTTTCTGGAGATCTGGTATGTCACTGTCACTATTCCCAAGATGCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGGCTTTGTTGGATCCAAACAGGATCATGGACAGCTAATCTCCTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGGCTTTGTTGGATCCAAACAGGATCATGGACAGCTAATCTCCTTTGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGATGCATGACACAGCTCTACTTTTTCCTTGGCTTGGGCTGCACTGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGATGCATGACACAGCTCTACTTTTTCCTTGGCTTGGGCTGCACTGAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTCCTTCTCGCTGTTATGGCCTATGATCGCTATATGGCCATCTGCTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTCCTTCTCGCTGTTATGGCCTATGATCGCTATATGGCCATCTGCTATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTCTCCACTACCCAGTCATTGTCAGTGGCCGGCTGTGTGTGCAGATGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTCTCCACTACCCAGTCATTGTCAGTGGCCGGCTGTGTGTGCAGATGGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTGGCTCTTGGGCTGGAGGTTTTGGCATCTCCATGGTCAAAGTTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTGGCTCTTGGGCTGGAGGTTTTGGCATCTCCATGGTCAAAGTTTTTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATTTCTGGCCTCTCTTACTGTGGCCCCAACATCATCAACCACTTTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATTTCTGGCCTCTCTTACTGTGGCCCCAACATCATCAACCACTTTTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTGATGTCTCTCCATTGCTCAACCTCTCATGCACTGATATGTCCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTGATGTCTCTCCATTGCTCAACCTCTCATGCACTGATATGTCCACAGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGCTTACAGATTTCATCCTGGCCATTTTTATTCTTCTAGGGCCACTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGCTTACAGATTTCATCCTGGCCATTTTTATTCTTCTAGGGCCACTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TGTCACTGGGGCCTCCTATGTGGCCATTACTGGTGCTGTGATGCACATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TGTCACTGGGGCCTCCTATGTGGCCATTACTGGTGCTGTGATGCACATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTTCGGCTGCTGGACGCTATAAGGCCTTTTCCACCTGTGCCTCTCATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTTCGGCTGCTGGACGCTATAAGGCCTTTTCCACCTGTGCCTCTCATCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACTGTTGTGATAATCTTCTATGCAGCCAGTATCTTCATCTATGCTCGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ACTGTTGTGATAATCTTCTATGCAGCCAGTATCTTCATCTATGCTCGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAAGGCACTCTCAGCTTTTGACACCAACAAGTTGGTCTCTGTACTGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAAGGCACTCTCAGCTTTTGACACCAACAAGTTGGTCTCTGTACTGTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTCATTGTACCATTGCTCAATCCCATCATTTACTGCCTGCGCAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTCATTGTACCATTGCTCAATCCCATCATTTACTGCCTGCGCAATCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GAGGTCAAGAGAGCCCTATGCTGTACTCTGCACCTGTACCAGCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GAGGTCAAGAGAGCCCTATGCTGTACTCTGCACCTGTACCAGCACCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :
    951 TCCTGACCCCAAGAAAGCTAGCAGAAATGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TCCTGACCCCAAGAAAGCTAGCAGAAATGTA