seq1 = pF1KE5471.tfa, 969 bp
seq2 = pF1KE5471/gi568815591f_143122079.tfa (gi568815591f:143122079_143323047), 200969 bp

>pF1KE5471 969
>gi568815591f:143122079_143323047 (Chr7)

1-969  (100001-100969)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAACGGTGAACACAGATGCCACAGATAAAGACATATCCAAGTTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAACGGTGAACACAGATGCCACAGATAAAGACATATCCAAGTTCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTCACCTTCACTTTGGTGGTCTCCGGAATAGAGTGCATCACTGGCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTCACCTTCACTTTGGTGGTCTCCGGAATAGAGTGCATCACTGGCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTGGGAGTGGCTTCATCACGGCCATCTATGGGGCTGAGTGGGCCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTGGGAGTGGCTTCATCACGGCCATCTATGGGGCTGAGTGGGCCAGGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AAAACACTCCCCACTGGTGACCGCATTATGTTGATGCTGAGCTTTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AAAACACTCCCCACTGGTGACCGCATTATGTTGATGCTGAGCTTTTCCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCTTGCTACAGATTTGGATGATGCTGGAGAACATTTTCAGTCTGCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTCTTGCTACAGATTTGGATGATGCTGGAGAACATTTTCAGTCTGCTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCCGAATTGTTTATAACCAAAACTCAGTGTATATCCTCTTCAAAGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCCGAATTGTTTATAACCAAAACTCAGTGTATATCCTCTTCAAAGTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTGTCTTTCTGAACCATTCCAATCTCTGGTTTGCTGCCTGGCTCAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTGTCTTTCTGAACCATTCCAATCTCTGGTTTGCTGCCTGGCTCAAAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCTATTGTCTTAGAATTGCAAACTTCAATCATCCTTTGTTCTTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCTATTGTCTTAGAATTGCAAACTTCAATCATCCTTTGTTCTTCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAAGAGGAAAATCATAGTGCTGATGCCTTGGCTTCTCAGGCTGTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAAGAGGAAAATCATAGTGCTGATGCCTTGGCTTCTCAGGCTGTCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTGGTTTCCTTAAGCTTCAGCTTTCCTCTCTCGAGAGATGTCTTCAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTGGTTTCCTTAAGCTTCAGCTTTCCTCTCTCGAGAGATGTCTTCAATGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTATGTGAATAGCTCCATTCCTATCCCCTCCTCCAACTCCACGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTATGTGAATAGCTCCATTCCTATCCCCTCCTCCAACTCCACGGAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTACTTCTCTGAGACCAATATGGTCAACCTGGTATTTTTCTATAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTACTTCTCTGAGACCAATATGGTCAACCTGGTATTTTTCTATAACATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGGATCTTCGTTCCTCTGATCATGTTCATCCTGGCAGCCACCCTGCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGGATCTTCGTTCCTCTGATCATGTTCATCCTGGCAGCCACCCTGCTGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTCTCTCTCAAGAGACACACCCTACACATGGGAAGCAATGCCACAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTCTCTCTCAAGAGACACACCCTACACATGGGAAGCAATGCCACAGGGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAGGGACCCCAGCATGAAGGCTCACATAGGGGCCATCAAAGCCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAGGGACCCCAGCATGAAGGCTCACATAGGGGCCATCAAAGCCACCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TACTTTCTCATCCTCTACATTTTCAATGCAATTGCTCTATTTCTTTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TACTTTCTCATCCTCTACATTTTCAATGCAATTGCTCTATTTCTTTCCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTCCAACATCTTTGACACTTACAGTTCCTGGAATATTTTGTGCAAGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GTCCAACATCTTTGACACTTACAGTTCCTGGAATATTTTGTGCAAGATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCATGGCTGCCTACCCTGCCGGCCACTCAGTACAACTGATCTTGGGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCATGGCTGCCTACCCTGCCGGCCACTCAGTACAACTGATCTTGGGCAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CCTGGGCTGAGAAGAGCCTGGAAGCGGTTTCAGCACCAAGTTCCTCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CCTGGGCTGAGAAGAGCCTGGAAGCGGTTTCAGCACCAAGTTCCTCTTTA

    950     .    :    .
    951 CCTAAAAGGGCAGACTCTG
        |||||||||||||||||||
 100951 CCTAAAAGGGCAGACTCTG