seq1 = pF1KE5467.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5467/gi568815581f_58055154.tfa (gi568815581f:58055154_58256083), 200930 bp

>pF1KE5467 930
>gi568815581f:58055154_58256083 (Chr17)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAACCACAGAACACCACACAGGTATCAATGTTTGTCCTCTTAGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAACCACAGAACACCACACAGGTATCAATGTTTGTCCTCTTAGGGTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCACAGACCCAAGAGCTCCAGAAATTCCTGTTCCTTCTGTTCCTGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCACAGACCCAAGAGCTCCAGAAATTCCTGTTCCTTCTGTTCCTGTTAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTATGTTACCACCATTGTGGGAAACCTCCTTATCATGGTCACAGTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTATGTTACCACCATTGTGGGAAACCTCCTTATCATGGTCACAGTGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGACTGCCGGCTCCACACACCCATGTATTTTCTGCTCCGAAATCTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGACTGCCGGCTCCACACACCCATGTATTTTCTGCTCCGAAATCTAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTCATAGACCTCTGCTATTCCACAGTCACCTCTCCAAAGATGCTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTCATAGACCTCTGCTATTCCACAGTCACCTCTCCAAAGATGCTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTCCTCCATGAGACCAAGACGATCTCCTACCAGGGCTGCATGGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCCTCCATGAGACCAAGACGATCTCCTACCAGGGCTGCATGGCCCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATCTTCTTCTTCCACCTTTTGGGAGGTGGGACTGTCTTTTTTCTCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATCTTCTTCTTCCACCTTTTGGGAGGTGGGACTGTCTTTTTTCTCTCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGGCCTATGACCGCTACATAGCCATCTCCCAGCCCCTCCGGTATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGGCCTATGACCGCTACATAGCCATCTCCCAGCCCCTCCGGTATGTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCATGAACACTCAATTGTGTGTGGGCCTGGTAGTAGCCGCCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCATGAACACTCAATTGTGTGTGGGCCTGGTAGTAGCCGCCTGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGCTTTGTCCACTCCATTGTCCAACTGGCTCTGATACTTCCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGCTTTGTCCACTCCATTGTCCAACTGGCTCTGATACTTCCACTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGGCCCCAATATCCTAGATAACTTCTACTGTGATGTTCCCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGGCCCCAATATCCTAGATAACTTCTACTGTGATGTTCCCCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TACTGAGACTTGCCTGCACTGATACCTCCCTCCTGGAGTTCCTCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TACTGAGACTTGCCTGCACTGATACCTCCCTCCTGGAGTTCCTCATGATC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCAACAGTGGGCTGCTAGTTATCATCTGGTTCCTCCTCCTTCTGATCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCAACAGTGGGCTGCTAGTTATCATCTGGTTCCTCCTCCTTCTGATCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTATACTGTCATCCTGGTGATGCTGAGGTCCCACTCGGGAAAGGCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTATACTGTCATCCTGGTGATGCTGAGGTCCCACTCGGGAAAGGCAAGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAAGGCAGCTTCCACCTGCACCACCCACATCATCGTGGTGTCCATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAAGGCAGCTTCCACCTGCACCACCCACATCATCGTGGTGTCCATGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCATTCCCTGTATCTATATCTATACCTGGCCCTTCACCCCATTCCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCATTCCCTGTATCTATATCTATACCTGGCCCTTCACCCCATTCCTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACAAGGCTGTGTCCATCAGCTACACAGTCATGACCCCCATGCTCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACAAGGCTGTGTCCATCAGCTACACAGTCATGACCCCCATGCTCAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCATGATCTACACCCTGAGAAACCAGGACATGAAAGCAGCCATGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCATGATCTACACCCTGAGAAACCAGGACATGAAAGCAGCCATGAGGAGA

    900     .    :    .    :    .    :
    901 TTAGGCAAGTGCCTAGTAATTTGCAGGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAGGCAAGTGCCTAGTAATTTGCAGGGAG