seq1 = pF1KE5458.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KE5458/gi568815586r_10838257.tfa (gi568815586r:10838257_11039207), 200951 bp

>pF1KE5458 951
>gi568815586r:10838257_11039207 (Chr12)

(complement)

1-951  (100001-100951)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGTGGTGTCATAAAGAGCATATTTACATTCGTTTTAATTGTGGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGTGGTGTCATAAAGAGCATATTTACATTCGTTTTAATTGTGGAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATAATTGGAAATTTAGGAAATAGTTTCATAGCACTGGTGAACTGTATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATAATTGGAAATTTAGGAAATAGTTTCATAGCACTGGTGAACTGTATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGTCAAGGGAAGAAAGATCTCTTCGGTTGATCGGATCCTCACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGGTCAAGGGAAGAAAGATCTCTTCGGTTGATCGGATCCTCACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGCAATCTCTCGAATTAGCCTGGTTTGGTTAATATTCGGAAGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGCAATCTCTCGAATTAGCCTGGTTTGGTTAATATTCGGAAGCTGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGTGTCTGTGTTTTTCCCAGCTTTATTTGCCACTGAAAAAATGTTCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGTGTCTGTGTTTTTCCCAGCTTTATTTGCCACTGAAAAAATGTTCAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGCTTACTAATATCTGGACAGTGATCAATCATTTTAGTGTCTGGTTAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGCTTACTAATATCTGGACAGTGATCAATCATTTTAGTGTCTGGTTAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACAGGCCTCGGTACTTTTTATTTTCTCAAGATAGCCAATTTTTCTAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACAGGCCTCGGTACTTTTTATTTTCTCAAGATAGCCAATTTTTCTAACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TATTTTTCTCTACCTAAAGTGGAGAGTTAAAAAGGTGGTTTTGGTGCTGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
 100351 TATTTTTCTCTACCTAAAGTGGAGGGTTAAAAAGGTGGTTTTGGTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTCTTGTGACTTCGGTCTTCTTGTTTTTAAATATTGCACTGATAAACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTCTTGTGACTTCGGTCTTCTTGTTTTTAAATATTGCACTGATAAACATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CATATAAATGCCAGTATCAATGGATACAGAAGAAACAAGACTTGCAGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CATATAAATGCCAGTATCAATGGATACAGAAGAAACAAGACTTGCAGTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGATTCAAGTAACTTTACACGATTTTCCAGTCTTATTGTATTAACCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGATTCAAGTAACTTTACACGATTTTCCAGTCTTATTGTATTAACCAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGTGTTCATTTTCATACCCTTTACTTTGTCCCTGGCAATGTTTCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGTGTTCATTTTCATACCCTTTACTTTGTCCCTGGCAATGTTTCTTCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCATCTTCTCCATGTGGAAACATCGCAAGAAGATGCAGCACACTGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCATCTTCTCCATGTGGAAACATCGCAAGAAGATGCAGCACACTGTCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AATATCCGGAGACGCCAGCACCAAAGCCCACAGAGGAGTTAAAAGTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AATATCCGGAGACGCCAGCACCAAAGCCCACAGAGGAGTTAAAAGTGTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCACTTTCTTCCTACTCTATGCCATTTTCTCTCTGTCTTTTTTCATATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCACTTTCTTCCTACTCTATGCCATTTTCTCTCTGTCTTTTTTCATATCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTTGGACCTCTGAAAGGTTGGAGGAAAATCTAATTATTCTTTCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTTTGGACCTCTGAAAGGTTGGAGGAAAATCTAATTATTCTTTCCCAGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GATGGGAATGGCTTATCCTTCATGTCACTCATGTGTTCTGATTCTTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GATGGGAATGGCTTATCCTTCATGTCACTCATGTGTTCTGATTCTTGGAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAAGAAGCTGAGACAGGCCTCTCTGTCAGTGCTACTGTGGCTGAGGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACAAGAAGCTGAGACAGGCCTCTCTGTCAGTGCTACTGTGGCTGAGGTAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ATGTTCAAAGATGGGGAGCCCTCAGGTCACAAAGAATTTAGAGAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 ATGTTCAAAGATGGGGAGCCCTCAGGTCACAAAGAATTTAGAGAATCATC

    950 
    951 T
        |
 100951 T