seq1 = pF1KE5453.tfa, 1056 bp
seq2 = pF1KE5453/gi568815590r_116545009.tfa (gi568815590r:116545009_116855797), 310789 bp

>pF1KE5453 1056
>gi568815590r:116545009_116855797 (Chr8)

(complement)

1-132  (100001-100132)   100% ->
133-289  (129626-129782)   100% ->
290-457  (196818-196985)   100% ->
458-557  (198484-198583)   100% ->
558-707  (199793-199942)   100% ->
708-828  (206872-206992)   100% ->
829-961  (209195-209327)   100% ->
962-1056  (210695-210789)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTCCCGCAAGGAAGGTACCGGCTCTACTGCCACCTCTTCCAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTCCCGCAAGGAAGGTACCGGCTCTACTGCCACCTCTTCCAGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGCCGGCGCAGCAGGGAAAGGCAAAGGCAAAGGCGGCTCGGGAGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGCCGGCGCAGCAGGGAAAGGCAAAGGCAAAGGCGGCTCGGGAGATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCCGTGAAGCAAGTGCAGATAGATGGCCTT         GTGGTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100101 CAGCCGTGAAGCAAGTGCAGATAGATGGCCTTGTG...TAGGTGGTATTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGATAATCAAACATTATCAAGAAGAAGGACAAGGAACTGAAGTTGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129635 AAGATAATCAAACATTATCAAGAAGAAGGACAAGGAACTGAAGTTGTTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGGAGTGCTTTTGGGTCTGGTTGTAGAAGATCGGCTTGAAATTACCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129685 AGGAGTGCTTTTGGGTCTGGTTGTAGAAGATCGGCTTGAAATTACCAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTTCCTTTCCCTCAGCACACAGAGGATGATGCTGACTTTGATGAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 129735 GCTTTCCTTTCCCTCAGCACACAGAGGATGATGCTGACTTTGATGAAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290        TCCAATATCAGATGGAAATGATGCGGAGCCTTCGCCATGTAAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129785 A...CAGTCCAATATCAGATGGAAATGATGCGGAGCCTTCGCCATGTAAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CATTGATCATCTTCACGTGGGCTGGTATCAGTCCACATACTATGGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196861 CATTGATCATCTTCACGTGGGCTGGTATCAGTCCACATACTATGGCTCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCGTTACCCGGGCACTCCTGGACTCTCAGTTTAGTTACCAGCATGCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 196911 TCGTTACCCGGGCACTCCTGGACTCTCAGTTTAGTTACCAGCATGCCATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAATCTGTCGTTCTCATTTATG         ATCCCATAAAAACTGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 196961 GAAGAATCTGTCGTTCTCATTTATGGTT...GAGATCCCATAAAAACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCAAGGATCTCTCTCACTAAAGGCATACAGACTGACTCCTAAACTGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198500 CCAAGGATCTCTCTCACTAAAGGCATACAGACTGACTCCTAAACTGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAGTTTGTAAAGAAAAGGATTTTTCCCCTGAAGC         ATTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 198550 AAGTTTGTAAAGAAAAGGATTTTTCCCCTGAAGCGTA...CAGATTGAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGCAAATATCACCTTTGAGTACATGTTTGAAGAAGTGCCGATTGTAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199800 AAAGCAAATATCACCTTTGAGTACATGTTTGAAGAAGTGCCGATTGTAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TAAAAATTCACATCTGATCAATGTCCTAATGTGGGAACTTGAAAAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199850 TAAAAATTCACATCTGATCAATGTCCTAATGTGGGAACTTGAAAAGAAGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGCTGTTGCAGATAAACATGAATTGCTCAGCCTTGCCAGCAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 199900 CAGCTGTTGCAGATAAACATGAATTGCTCAGCCTTGCCAGCAGGTA...C

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    708   CAATCATTTGGGGAAGAATCTACAGTTGCTGATGGACAGAGTGGATGA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206870 AGCAATCATTTGGGGAAGAATCTACAGTTGCTGATGGACAGAGTGGATGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AATGAGCCAAGATATAGTTAAATACAACACATACATGAGGAATACTAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 206920 AATGAGCCAAGATATAGTTAAATACAACACATACATGAGGAATACTAGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AACAACAGCAGCAGAAACATCAG         TATCAGCAGCGTCGCCAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 206970 AACAACAGCAGCAGAAACATCAGGTT...TAGTATCAGCAGCGTCGCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAGGAGAATATGCAGCGCCAGAGCCGAGGAGAACCCCCGCTCCCTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209213 CAGGAGAATATGCAGCGCCAGAGCCGAGGAGAACCCCCGCTCCCTGAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGACCTGTCCAAACTCTTCAAACCACCACAGCCGCCTGCCAGGATGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 209263 GGACCTGTCCAAACTCTTCAAACCACCACAGCCGCCTGCCAGGATGGACT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CGCTGCTCATTGCAG         GCCAGATAAACACTTACTGCCAGAAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 209313 CGCTGCTCATTGCAGGTA...CAGGCCAGATAAACACTTACTGCCAGAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATCAAGGAGTTCACTGCCCAAAACTTAGGCAAGCTCTTCATGGCCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210721 ATCAAGGAGTTCACTGCCCAAAACTTAGGCAAGCTCTTCATGGCCCAGGC

   1100     .    :    .
   1038 TCTTCAAGAATACAACAAC
        |||||||||||||||||||
 210771 TCTTCAAGAATACAACAAC