seq1 = pF1KE5447.tfa, 984 bp
seq2 = pF1KE5447/gi568815591r_151460522.tfa (gi568815591r:151460522_151695456), 234935 bp

>pF1KE5447 984
>gi568815591r:151460522_151695456 (Chr7)

(complement)

1-31  (63358-63388)   100% ->
32-141  (100003-100112)   100% ->
142-223  (119005-119086)   100% ->
224-282  (120508-120566)   100% ->
283-328  (122748-122793)   100% ->
329-383  (125232-125286)   100% ->
384-510  (126615-126741)   100% ->
511-676  (129572-129737)   100% ->
677-714  (130074-130111)   100% ->
715-861  (131233-131379)   100% ->
862-955  (134840-134933)   100% ->
956-984  (138225-138253)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGAGAAGCTGGAGTTCGAGGACGAAG         CAGTAGAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  63358 ATGCTGGAGAAGCTGGAGTTCGAGGACGAAGGTG...TAGCAGTAGAAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CTCAGAAAGTGGTGTTTACATGCGATTCATGAGGTCACACAAGTGTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100013 CTCAGAAAGTGGTGTTTACATGCGATTCATGAGGTCACACAAGTGTTATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACATCGTTCCAACCAGTTCAAAGCTTGTTGTCTTTGATACTACATTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100063 ACATCGTTCCAACCAGTTCAAAGCTTGTTGTCTTTGATACTACATTACAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          GTTAAAAAGGCCTTCTTTGCTTTGGTAGCCAACGGTGTCCG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100113 GTA...CAGGTTAAAAAGGCCTTCTTTGCTTTGGTAGCCAACGGTGTCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AGCAGCGCCACTGTGGGAGAGTAAAAAACAAAGTTTTGTAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 119046 AGCAGCGCCACTGTGGGAGAGTAAAAAACAAAGTTTTGTAGGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GAATGCTAACAATTACAGATTTCATAAATATACTACATAGATACTATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120508 GAATGCTAACAATTACAGATTTCATAAATATACTACATAGATACTATAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TCACCTATG         GTACAGATTTATGAATTAGAGGAACATAAAAT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120558 TCACCTATGGTA...CAGGTACAGATTTATGAATTAGAGGAACATAAAAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TGAAACATGGAGGG         AGCTTTATTTACAAGAAACATTTAAGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 122780 TGAAACATGGAGGGGTA...CAGAGCTTTATTTACAAGAAACATTTAAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CTTTAGTGAATATATCTCCAGATGCAAG         CCTCTTCGATGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 125259 CTTTAGTGAATATATCTCCAGATGCAAGGTA...CAGCCTCTTCGATGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 GTATACTCCTTGATCAAAAATAAAATCCACAGATTGCCCGTTATTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126628 GTATACTCCTTGATCAAAAATAAAATCCACAGATTGCCCGTTATTGACCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    447 TATCAGTGGGAATGCACTTTATATACTTACCCACAAAAGAATCCTCAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126678 TATCAGTGGGAATGCACTTTATATACTTACCCACAAAAGAATCCTCAAGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TCCTCCAGCTTTTT         ATGTCTGATATGCCAAAGCCTGCCTTC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 126728 TCCTCCAGCTTTTTGTA...TAGATGTCTGATATGCCAAAGCCTGCCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    538 ATGAAGCAGAACCTGGATGAGCTTGGAATAGGAACGTACCACAACATTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129599 ATGAAGCAGAACCTGGATGAGCTTGGAATAGGAACGTACCACAACATTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 CTTCATACATCCAGACACTCCCATCATCAAAGCCTTGAACATATTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129649 CTTCATACATCCAGACACTCCCATCATCAAAGCCTTGAACATATTTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 AAAGACGAATATCAGCTCTGCCTGTTGTGGATGAGTCAG         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 129699 AAAGACGAATATCAGCTCTGCCTGTTGTGGATGAGTCAGGTT...TAGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 AAAGTTGTAGATATTTATTCCAAATTTGATGTAATT         AATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 130076 AAAGTTGTAGATATTTATTCCAAATTTGATGTAATTGTA...CAGAATCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TGCTGCTGAGAAAACATACAATAACCTAGATATCACGGTGACCCAGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131238 TGCTGCTGAGAAAACATACAATAACCTAGATATCACGGTGACCCAGGCCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    770 TTCAGCACCGTTCACAGTATTTTGAAGGTGTTGTGAAGTGCAATAAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131288 TTCAGCACCGTTCACAGTATTTTGAAGGTGTTGTGAAGTGCAATAAGCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 GAAATACTGGAGACCATCGTGGACAGAATAGTAAGAGCTGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 131338 GAAATACTGGAGACCATCGTGGACAGAATAGTAAGAGCTGAGGTG...CA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    862  GTCCATCGGCTGGTGGTGGTAAATGAAGCAGATAGTATTGTGGGTATTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134839 GGTCCATCGGCTGGTGGTGGTAAATGAAGCAGATAGTATTGTGGGTATTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 TTTCCCTGTCGGACATTCTGCAAGCCCTGATCCTCACACCAGCAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 134889 TTTCCCTGTCGGACATTCTGCAAGCCCTGATCCTCACACCAGCAGGTA..

   1050     .    :    .    :    .    :
    956     GTGCCAAACAAAAGGAGACAGAAACGGAG
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 134939 .CAGGTGCCAAACAAAAGGAGACAGAAACGGAG