seq1 = pF1KE5442.tfa, 942 bp
seq2 = pF1KE5442/gi568815587r_55893684.tfa (gi568815587r:55893684_56094625), 200942 bp

>pF1KE5442 942
>gi568815587r:55893684_56094625 (Chr11)

(complement)

1-942  (100001-100942)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCAGAAAAAATTATACCTCACTGACTGAGTTCGTCCTATTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCAGAAAAAATTATACCTCACTGACTGAGTTCGTCCTATTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGCAGACACGCTGGAGCTACAGATTATCCTCTTTTTGTTTTTTCTTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCAGACACGCTGGAGCTACAGATTATCCTCTTTTTGTTTTTTCTTGTGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTATACACTTACAGTACTGGGAAATCTCGGGATGATCCTCTTAATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTATACACTTACAGTACTGGGAAATCTCGGGATGATCCTCTTAATCAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCGATTCCCAGCTTCACACACCCATGTATTTCTTCCTGGCTAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCGATTCCCAGCTTCACACACCCATGTATTTCTTCCTGGCTAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTTGTGGACGTTTGTAACTCAACTACCATCACCCCAAAGATGCTGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTTGTGGACGTTTGTAACTCAACTACCATCACCCCAAAGATGCTGGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATTTATTATCAGAGAAGAAAACCATCTCTTTTGCTGGCTGCTTCCTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATTTATTATCAGAGAAGAAAACCATCTCTTTTGCTGGCTGCTTCCTACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGTACTTCTTTATCTCCCTGGCGACAACCGAATGCATCCTCTTTGGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGTACTTCTTTATCTCCCTGGCGACAACCGAATGCATCCTCTTTGGGTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCCTATGACCGGTATGCGGCCATATGTCGCCCGCTGCTTTACTCCT
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCCTATGACAGGTATGCGGCCATATGTCGCCCGCTGCTTTACTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGATCATGTCCAGGACCGTCTACCTAAAAATGGCAGCCGGGGCTTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGATCATGTCCAGGACCGTCTACCTAAAAATGGCAGCCGGGGCTTTTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCAGGGTTGCTGAACTTCATGGTCAACACAAGCCATGTCAGCAGCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCAGGGTTGCTGAACTTCATGGTCAACACAAGCCATGTCAGCAGCTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTCTGTGACTCCAATGTCATCCATCACTTCTTCTGTGACAGTCCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTCTGTGACTCCAATGTCATCCATCACTTCTTCTGTGACAGTCCCCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTTTCAAGCTCTCTTGTTCTGACACAATCCTGAAAGAAAGCATAAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTTTCAAGCTCTCTTGTTCTGACACAATCCTGAAAGAAAGCATAAGTTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATTTTGGCTGGTGTGAATATTGTGGGGACTCTGCTTGTCATCCTCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATTTTGGCTGGTGTGAATATTGTGGGGACTCTGCTTGTCATCCTCTCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACTCCTACGTTCTCTTCTCCATTTTTTCTATGCATTCGGGGGAGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACTCCTACGTTCTCTTCTCCATTTTTTCTATGCATTCGGGGGAGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGCACAGAGCTTTCTCCACGTGTGCCTCTCACCTGACAGCCATAATTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGCACAGAGCTTTCTCCACGTGTGCCTCTCACCTGACAGCCATAATTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGCCACCTGCATCTATACTTACCTGAGACCTAGTTCCAGCTACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGCCACCTGCATCTATACTTACCTGAGACCTAGTTCCAGCTACTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCTGAATCAGGACAAAGTGGCTTCTGTGTTCTACACAGTGGTGATTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCTGAATCAGGACAAAGTGGCTTCTGTGTTCTACACAGTGGTGATTCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTTGAATCCTCTGATCTACAGCCTCAGGAATAAGGAAGTAAAGAAGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
 100851 TGTTGAATCCTCTGATCTACAGCCTCAGGAGTAAGGAAGTAAAGAAGGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTAGCGAATGTAATTAGCAGGAAAAGGACCTCTTCCTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTAGCGAATGTAATTAGCAGGAAAAGGACCTCTTCCTTTCTG