seq1 = pF1KE5441.tfa, 951 bp
seq2 = pF1KE5441/gi568815582r_2753096.tfa (gi568815582r:2753096_2958104), 205009 bp

>pF1KE5441 951
>gi568815582r:2753096_2958104 (Chr16)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-109  (101257-101283)   100% ->
110-281  (101852-102023)   100% ->
282-559  (102254-102531)   100% ->
560-717  (104083-104240)   100% ->
718-951  (104776-105009)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGGTTTCTGGAGCGCCCCCAGCCCTGGGTGGGGGCTGTCTCGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTGGTTTCTGGAGCGCCCCCAGCCCTGGGTGGGGGCTGTCTCGGCAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCACCTCCCTGCTGCTGCTGGCGTCGACAG         CCATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 CTTCACCTCCCTGCTGCTGCTGGCGTCGACAGGTA...CAGCCATCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGCGGCCAGGATACCTG         TTCCCCCAGCCTGTGGGAAGCCC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 101266 ATGCGGCCAGGATACCTGGTG...CAGTTCCCCCAGCCTGTGGGAAGCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 CAGCAGCTGAACCGGGTTGTGGGCGGCGAGGACAGCACTGACAGCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101875 CAGCAGCTGAACCGGGTTGTGGGCGGCGAGGACAGCACTGACAGCGAGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCCCTGGATCGTGAGCATCCAGAAGAATGGGACCCACCACTGCGCAGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101925 GCCCTGGATCGTGAGCATCCAGAAGAATGGGACCCACCACTGCGCAGGTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTCTGCTCACCAGCCGCTGGGTGATCACTGCTGCCCACTGTTTCAAGGA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 101975 CTCTGCTCACCAGCCGCTGGGTGATCACTGCTGCCCACTGTTTCAAGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    282         CAACCTGAACAAACCATACCTGTTCTCTGTGCTGCTGGGGGC
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102025 TA...CAGCAACCTGAACAAACCATACCTGTTCTCTGTGCTGCTGGGGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CTGGCAGCTGGGGAACCCTGGCTCTCGGTCCCAGAAGGTGGGTGTTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102296 CTGGCAGCTGGGGAACCCTGGCTCTCGGTCCCAGAAGGTGGGTGTTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GGGTGGAGCCCCACCCTGTGTATTCCTGGAAGGAAGGTGCCTGTGCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102346 GGGTGGAGCCCCACCCTGTGTATTCCTGGAAGGAAGGTGCCTGTGCAGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATTGCCCTGGTGCGTCTCGAGCGCTCCATACAGTTCTCAGAGCGGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102396 ATTGCCCTGGTGCGTCTCGAGCGCTCCATACAGTTCTCAGAGCGGGTCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCCCATCTGCCTACCTGATGCCTCTATCCACCTCCCTCCAAACACCCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102446 GCCCATCTGCCTACCTGATGCCTCTATCCACCTCCCTCCAAACACCCACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGGATCTCAGGCTGGGGGAGCATCCAAGATGGAG         TTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 102496 GCTGGATCTCAGGCTGGGGGAGCATCCAAGATGGAGGTG...CAGTTCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TTGCCCCACCCTCAGACCCTGCAGAAGCTGAAGGTTCCTATCATCGACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104088 TTGCCCCACCCTCAGACCCTGCAGAAGCTGAAGGTTCCTATCATCGACTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GGAAGTCTGCAGCCATCTGTACTGGCGGGGAGCAGGACAGGGACCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104138 GGAAGTCTGCAGCCATCTGTACTGGCGGGGAGCAGGACAGGGACCCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CTGAGGACATGCTGTGTGCCGGCTACTTGGAGGGGGAGCGGGATGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104188 CTGAGGACATGCTGTGTGCCGGCTACTTGGAGGGGGAGCGGGATGCTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTG         GGCGACTCCGGGGGCCCCCTCATGTGCCAGGTGGACGG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104238 CTGGTG...CAGGGCGACTCCGGGGGCCCCCTCATGTGCCAGGTGGACGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CGCCTGGCTGCTGGCCGGCATCATCAGCTGGGGCGAGGGCTGTGCCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104814 CGCCTGGCTGCTGGCCGGCATCATCAGCTGGGGCGAGGGCTGTGCCGAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GCAACAGGCCCGGGGTCTACATCAGCCTCTCTGCGCACCGCTCCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104864 GCAACAGGCCCGGGGTCTACATCAGCCTCTCTGCGCACCGCTCCTGGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GAGAAGATCGTGCAAGGGGTGCAGCTCCGCGGGCGCGCTCAGGGGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104914 GAGAAGATCGTGCAAGGGGTGCAGCTCCGCGGGCGCGCTCAGGGGGGTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    906 GGCCCTCAGGGCACCGAGCCAGGGCTCTGGGGCCGCCGCGCGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104964 GGCCCTCAGGGCACCGAGCCAGGGCTCTGGGGCCGCCGCGCGCTCC