seq1 = pF1KE5433.tfa, 960 bp
seq2 = pF1KE5433/gi568815579r_14699177.tfa (gi568815579r:14699177_14900136), 200960 bp

>pF1KE5433 960
>gi568815579r:14699177_14900136 (Chr19)

(complement)

1-960  (100001-100960)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACAGGAAATCAAACACATGCCCAAGAATTTCTCCTCCTGGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACAGGAAATCAAACACATGCCCAAGAATTTCTCCTCCTGGGATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCAGCAACGTCAGAGATTCAGTTCATTCTCTTTGGGCTGTTCCTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCAGCAACGTCAGAGATTCAGTTCATTCTCTTTGGGCTGTTCCTCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTACCTAGTCACTTTCACCGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCATATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGTACCTAGTCACTTTCACCGGGAACCTGCTCATCATCCTGGCCATATGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCAGACTCCCACCTCCACACCCCCATGTACTTCTTCCTCTCCAACCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTTGCTGACCTCTGTTTTACCTCCACGACTGTCCCAAAGATGTTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTTGCTGACCTCTGTTTTACCTCCACGACTGTCCCAAAGATGTTACTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATATACTGACACAGAACAAATTCATAACATATGCAGGCTGTCTCAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATATACTGACACAGAACAAATTCATAACATATGCAGGCTGTCTCAGTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATTTTTTTTTTCACTTCATTTGGATGCCTGGACAATTTACTCTTGACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATTTTTTTTTTCACTTCATTTGGATGCCTGGACAATTTACTCTTGACCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTATGACCGCTTCGTGGCCATCTGTCACCCCCTGCACTATACGG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTATGACCGCTTCGTGGCCGTCTGTCACCCCCTGCACTATACGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCATCATGAACCCCCAGCTCTGTGGACTGCTGGTTCTGGGGTCCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCATCATGAACCCCCAGCTCTGTGGACTGCTGGTTCTGGGGTCCTGGTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATCAGTGTCATGGGTTCCCTGCTCGAGACCTTGACTGTTTTGAGGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATCAGTGTCATGGGTTCCCTGCTCGAGACCTTGACTGTTTTGAGGCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGCACCAAAATGGAAATTCCACACTTTTTTTGTGATCTACTTGAAG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGCACCGAAATGGAAATTCCACACTTTTTTTGTGATCTACTTGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCCTGAAGCTCGCCTGTTCTGACACCTTCATTAATAACGTGGTGATATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCCTGAAGCTCGCCTGTTCTGACACCTTCATTAATAACGTGGTGATATAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTTGCAACTGGCGTCCTGGGTGTGATTTCCTTCACTGGAATATTTTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTTGCAACTGGCGTCCTGGGTGTGATTTCCTTCACTGGAATATTTTTCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTACTATAAAATTGTTTTCTCTATACTGAGGATTTCCTCAGCTGGGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTACTATAAAATTGTTTTCTCTATACTGAGGATTTCCTCAGCTGGGAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGCACAAAGCGTTTTCCACCTGTGGTTCCCACCTCTCAGTGGTCACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGCACAAAGCGTTTTCCACCTGTGGTTCCCACCTCTCAGTGGTCACCTTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTATGGCACGGGCTTTGGGGTCTATCTCAGTTCTGCAGCCACACCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTATGGCACGGGCTTTGGGGTCTATCTCAGTTCTGCAGCCACACCATC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTCTAGGACAAGTCTGGTGGCCTCAGTGATGTACACCATGGTCACCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTCTAGGACAAGTCTGGTGGCCTCAGTGATGTACACCATGGTCACCCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACACGGACATGAAGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTGAACCCCTTCATCTACAGCCTGAGGAACACGGACATGAAGAGGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CTGGGGAGACTCCTCAGTAGGGCAACATTTTTTAATGGTGACATCACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTGGGGAGACTCCTCAGTAGGGCAACATTTTTTAATGGTGACATCACTGC

    950     .    :
    951 AGGACTTTCA
        ||||||||||
 100951 AGGACTTTCA