seq1 = pF1KE5430.tfa, 957 bp
seq2 = pF1KE5430/gi568815589r_35857142.tfa (gi568815589r:35857142_36058098), 200957 bp

>pF1KE5430 957
>gi568815589r:35857142_36058098 (Chr9)

(complement)

1-957  (100001-100957)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAAAGCCAATGAGACCTCCCCTGTGATGGGGTTCGTTCTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAAAGCCAATGAGACCTCCCCTGTGATGGGGTTCGTTCTCCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTCTCTGCCCACCCAGAGCTGGAAAAGACATTCTTCGTGCTCATCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTCTCTGCCCACCCAGAGCTGGAAAAGACATTCTTCGTGCTCATCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATGTACCTCGTGATCCTGCTGGGCAATGGGGTCCTCATCCTGGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATGTACCTCGTGATCCTGCTGGGCAATGGGGTCCTCATCCTGGTGACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCCTTGACTCCCGCCTGCACACGCCCATGTACTTCTTCCTAGGGAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ATCCTTGACTCCCGCCTGCACACGCCCATGTACTTCTTCCTAGGGAACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCTTCCTGGACATCTGCTTCACTACCTCCTCAGTCCCACTGGTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCTTCCTGGACATCTGCTTCACTACCTCCTCAGTCCCACTGGTCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACAGCTTTTTGACTCCCCAGGAAACCATCTCCTTCTCAGCCTGTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACAGCTTTTTGACTCCCCAGGAAACCATCTCCTTCTCAGCCTGTGCTGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATGGCACTCTCCTTTGCCATGGCAGGAACAGAGTGCTTGCTCCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATGGCACTCTCCTTTGCCATGGCAGGAACAGAGTGCTTGCTCCTGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATGATGGCATTTGATCGCTATGTGGCCATCTGCAACCCCCTTAGGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATGATGGCATTTGATCGCTATGTGGCCATCTGCAACCCCCTTAGGTACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCGTGATCATGAGCAAGGCTGCCTACATGCCCATGGCTGCCAGCTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCGTGATCATGAGCAAGGCTGCCTACATGCCCATGGCTGCCAGCTCCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCTATTGGTGGTGCTGCTTCCGTGGTACACACATCCTTGGCAATTCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCTATTGGTGGTGCTGCTTCCGTGGTACACACATCCTTGGCAATTCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCCTTCTGTGGAGACAATGTCATCAACCACTTCACCTGTGAGATTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCCTTCTGTGGAGACAATGTCATCAACCACTTCACCTGTGAGATTCTGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CTGTTCTAAAGTTGGCCTGTGCTGACATTTCCATCAATGTGATCAGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CTGTTCTAAAGTTGGCCTGTGCTGACATTTCCATCAATGTGATCAGCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GAGGTGACGAATGTGATCTTCCTAGGAGTCCCGGTTCTGTTCATCTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GAGGTGACGAATGTGATCTTCCTAGGAGTCCCGGTTCTGTTCATCTCTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTATGTCTTCATCATCACCACCATCCTGAGGATCCCCTCAGCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTATGTCTTCATCATCACCACCATCCTGAGGATCCCCTCAGCTGAGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGAGGAAAAAGGTCTTCTCCACCTGCTCTGCCCACCTCACCGTGGTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGAGGAAAAAGGTCTTCTCCACCTGCTCTGCCCACCTCACCGTGGTGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTCTTCTACGGGACCTTATTCTTCATGTATGGGAAGCCTAAGTCTAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GTCTTCTACGGGACCTTATTCTTCATGTATGGGAAGCCTAAGTCTAAGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTCCATGGGAGCAGACAAAGAGGATCTTTCAGACAAACTCATCCCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTCCATGGGAGCAGACAAAGAGGATCTTTCAGACAAACTCATCCCCCTTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTATGGGGTGGTGACCCCGATGCTCAACCCCATCATCTATAGCCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTATGGGGTGGTGACCCCGATGCTCAACCCCATCATCTATAGCCTGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AACAAGGATGTGAAGGCTGCTGTGAGGAGACTGCTGAGACCAAAAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AACAAGGATGTGAAGGCTGCTGTGAGGAGACTGCTGAGACCAAAAGGCTT

    950     .
    951 CACTCAG
        |||||||
 100951 CACTCAG