seq1 = pF1KE5425.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KE5425/gi568815587r_124340153.tfa (gi568815587r:124340153_124541085), 200933 bp

>pF1KE5425 933
>gi568815587r:124340153_124541085 (Chr11)

(complement)

1-933  (100001-100933)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTGAGAATTCCTCCTTCGTGACACAGTTTATCCTCGCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTGAGAATTCCTCCTTCGTGACACAGTTTATCCTCGCAGGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AACTGACCAACCGGGAGTCCAGATCCCCCTCTTCTTCCTGTTTCTAGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AACTGACCAACCGGGAGTCCAGATCCCCCTCTTCTTCCTGTTTCTAGGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACGTGGTCACTGTGGTGGGGAACCTGGGCTTGATAACCCTGATAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACGTGGTCACTGTGGTGGGGAACCTGGGCTTGATAACCCTGATAAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCAACTCTCACTTGCACACCCCTATGTACTTCTTCCTCTATAACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCAACTCTCACTTGCACACCCCTATGTACTTCTTCCTCTATAACTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCATAGATTTCTGCTATTCCAGTGTTATCACTCCCAAAATGCTGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCATAGATTTCTGCTATTCCAGTGTTATCACTCCCAAAATGCTGATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCTTTGTCTTAAAGAAGAACAGCATCTCCTACGCAGGGTGTATGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCTTTGTCTTAAAGAAGAACAGCATCTCCTACGCAGGGTGTATGACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTCTTCTTTCTTTTCTTTGTTGTCTCTGAGTCCTTCATCCTGTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTTCTTCTTTCTTTTCTTTGTTGTCTCTGAGTCCTTCATCCTGTCAGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATGGCGTATGACCGCTATGTGGCCATCTGTAACCCACTGTTGTACATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATGGCGTATGACCGCTATGTGGCCATCTGTAACCCACTGTTGTACATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCACCATGTCTCCCCAGGTGTGTTTTCTCCTTTTGTTGGGTGTCTATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCACCATGTCTCCCCAGGTGTGTTTTCTCCTTTTGTTGGGTGTCTATGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGGGTTTGCTGGGGCCATGGCCCACACAGCGTGCATGATGGGTGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGGGTTTGCTGGGGCCATGGCCCACACAGCGTGCATGATGGGTGTGAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTCTGTGCCAATAACCTTGTCAACCACTACATGTGTGACATCCTTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTCTGTGCCAATAACCTTGTCAACCACTACATGTGTGACATCCTTCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TTCTTGAGTGTGCTTGCACCAGCACCTATGTGAATGAGCTTGTAGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TTCTTGAGTGTGCTTGCACCAGCACCTATGTGAATGAGCTTGTAGTGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTTGTTGTGGGCATTGATATTGGTGTGCCCACAGTCACCATCTTCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTTGTTGTGGGCATTGATATTGGTGTGCCCACAGTCACCATCTTCATTTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGCTCTCATTCTCTCCAGCATCTTCCACATTGATTCCACGGAGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGCTCTCATTCTCTCCAGCATCTTCCACATTGATTCCACGGAGGGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTCCAAAGCCTTCAGCACCTGCAGCTCCCACATAATTGCAGTTTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTCCAAAGCCTTCAGCACCTGCAGCTCCCACATAATTGCAGTTTCTCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTCTTTGGGTCAGGAGCATTCATGTACCTCAAACCCTTTTCTCTTTTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTCTTTGGGTCAGGAGCATTCATGTACCTCAAACCCTTTTCTCTTTTAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATGAACCAGGGCAAGGTGTCTTCCCTATTCTATACCACTGTGGTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATGAACCAGGGCAAGGTGTCTTCCCTATTCTATACCACTGTGGTGCCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGCTCAACCCATTAATTTATAGCCTGAGGAATAAGGACGTCAAAGTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGCTCAACCCATTAATTTATAGCCTGAGGAATAAGGACGTCAAAGTTGCT

    900     .    :    .    :    .    :
    901 CTAAAGAAAATCTTGAACAAAAATGCATTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CTAAAGAAAATCTTGAACAAAAATGCATTCTCC