seq1 = pF1KE5424.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KE5424/gi568815594r_155828333.tfa (gi568815594r:155828333_156053847), 225515 bp

>pF1KE5424 963
>gi568815594r:155828333_156053847 (Chr4)

(complement)

1-135  (100001-100135)   100% ->
136-244  (110584-110692)   100% ->
245-384  (111392-111531)   100% ->
385-552  (114310-114477)   100% ->
553-674  (116365-116486)   100% ->
675-838  (124143-124306)   100% ->
839-931  (125420-125512)   100% ->
932-963  (127778-127809)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGCGGGCGCTGCCGTGGCTGCCGTGGCTGCTGTGGCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTGCGGGCGCTGCCGTGGCTGCCGTGGCTGCTGTGGCTGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGGCGGCGGCGATGCGGACTCCCGCGCCCCCTTCACCCCGACCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGGGCGGCGGCGATGCGGACTCCCGCGCCCCCTTCACCCCGACCTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGGAGCCGCGAGCGTGAAGCCGCCGCCTTCCGG         GAAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100101 CGCGGAGCCGCGAGCGTGAAGCCGCCGCCTTCCGGGTA...TAGGAAAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTTAATAGACATCGATACTTGAATTCTTTATTTCCCAGTGAAAACTCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110590 CTTAATAGACATCGATACTTGAATTCTTTATTTCCCAGTGAAAACTCCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGCCTTCTATGGAATAAATCAGTTTTCCTATTTGTTTCCTGAAGAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110640 CGCCTTCTATGGAATAAATCAGTTTTCCTATTTGTTTCCTGAAGAGTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AAG         CCATTTATTTAAGAAGCAAACCTTCCAAGTTTCCCAGA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110690 AAGGTA...CAGCCATTTATTTAAGAAGCAAACCTTCCAAGTTTCCCAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACTCAGCAGAAGTACATATGTCCATCCCCAATGTGTCTTTGCCGTTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111430 TACTCAGCAGAAGTACATATGTCCATCCCCAATGTGTCTTTGCCGTTAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ATTTGACTGGAGGGACAAGCAGGTTGTGACACAAGTGAGAAACCAGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111480 ATTTGACTGGAGGGACAAGCAGGTTGTGACACAAGTGAGAAACCAGCAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TG         TGTGGAGGATGCTGGGCCTTCAGCGTGGTGGGGGCAGTG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111530 TGGTA...CAGTGTGGAGGATGCTGGGCCTTCAGCGTGGTGGGGGCAGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAATCTGCTTATGCAATAAAGGGGAAGCCCCTGGAAGACCTAAGTGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114349 GAATCTGCTTATGCAATAAAGGGGAAGCCCCTGGAAGACCTAAGTGTCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCAGGTCATTGACTGTTCGTATAATAATTATGGCTGCAATGGAGGCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114399 GCAGGTCATTGACTGTTCGTATAATAATTATGGCTGCAATGGAGGCTCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CTCTCAATGCTTTGAACTGGTTAAACAAG         ATGCAAGTAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 114449 CTCTCAATGCTTTGAACTGGTTAAACAAGGTG...TAGATGCAAGTAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CTGGTGAAAGATTCAGAATATCCTTTTAAAGCACAAAATGGTCTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116377 CTGGTGAAAGATTCAGAATATCCTTTTAAAGCACAAAATGGTCTGTGCCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTACTTTTCTGGTTCACATTCTGGATTTTCAATCAAAGGTTATTCTGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116427 TTACTTTTCTGGTTCACATTCTGGATTTTCAATCAAAGGTTATTCTGCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGACTTCAG         TGACCAAGAAGATGAAATGGCAAAAGCACTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 116477 ATGACTTCAGGTA...TAGTGACCAAGAAGATGAAATGGCAAAAGCACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTTACCTTTGGCCCTTTGGTAGTCATAGTAGATGCAGTGAGCTGGCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124174 CTTACCTTTGGCCCTTTGGTAGTCATAGTAGATGCAGTGAGCTGGCAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TTATCTGGGAGGCATTATACAGCATCACTGCTCTAGTGGAGAAGCAAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124224 TTATCTGGGAGGCATTATACAGCATCACTGCTCTAGTGGAGAAGCAAATC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ATGCAGTTCTCATAACTGGGTTTGATAAAACAG         GAAGCACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124274 ATGCAGTTCTCATAACTGGGTTTGATAAAACAGGTA...TAGGAAGCACT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CCATATTGGATTGTGCGGAATTCCTGGGGAAGTTCTTGGGGAGTAGATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125428 CCATATTGGATTGTGCGGAATTCCTGGGGAAGTTCTTGGGGAGTAGATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TTATGCCCATGTCAAAATGGGAAGTAATGTTTGTG         GTATTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 125478 TTATGCCCATGTCAAAATGGGAAGTAATGTTTGTGGTA...TAGGTATTG

   1000     .    :    .    :    .
    938 CAGATTCCGTTTCTTCTATATTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 127784 CAGATTCCGTTTCTTCTATATTTGTG