seq1 = pF1KE5416.tfa, 1038 bp
seq2 = pF1KE5416/gi568815579r_43361354.tfa (gi568815579r:43361354_43565571), 204218 bp

>pF1KE5416 1038
>gi568815579r:43361354_43565571 (Chr19)

(complement)

1-79  (100001-100079)   100% ->
80-211  (101116-101247)   100% ->
212-382  (101803-101973)   100% ->
383-544  (102285-102446)   100% ->
545-1038  (103725-104218)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCCGCCAGGAAAGCAGGTGCCCAGGCCATGATCTGGACTGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACCCCGCCAGGAAAGCAGGTGCCCAGGCCATGATCTGGACTGCAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCGCGGAG         GAGCGCAGGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100051 CTGGCTGCTGCTGCTGCTGCTTCGCGGAGGTG...CAGGAGCGCAGGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGGAGTGCTACAGCTGCGTGCAGAAAGCAGATGACGGATGCTCCCCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101128 TGGAGTGCTACAGCTGCGTGCAGAAAGCAGATGACGGATGCTCCCCGAAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAGATGAAGACAGTGAAGTGCGCGCCGGGCGTGGACGTCTGCACCGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101178 AAGATGAAGACAGTGAAGTGCGCGCCGGGCGTGGACGTCTGCACCGAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGTGGGGGCGGTGGAGACCA         TCCACGGACAATTCTCGCTGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101228 CGTGGGGGCGGTGGAGACCAGTG...TAGTCCACGGACAATTCTCGCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGTGCGGGGTTGCGGTTCGGGACTCCCCGGCAAGAATGACCGCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101824 CAGTGCGGGGTTGCGGTTCGGGACTCCCCGGCAAGAATGACCGCGGCCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GATCTTCACGGGCTTCTGGCGTTCATCCAGCTGCAGCAATGCGCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101874 GATCTTCACGGGCTTCTGGCGTTCATCCAGCTGCAGCAATGCGCTCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCGCTGCAACGCCAAGCTCAACCTCACCTCGCGGGCGCTCGACCCGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101924 TCGCTGCAACGCCAAGCTCAACCTCACCTCGCGGGCGCTCGACCCGGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383          GTAATGAGAGTGCATACCCGCCCAACGGCGTGGAGTGCTAC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101974 GTC...CAGGTAATGAGAGTGCATACCCGCCCAACGGCGTGGAGTGCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 AGCTGTGTGGGCCTGAGCCGGGAGGCGTGCCAGGGTACATCGCCGCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102326 AGCTGTGTGGGCCTGAGCCGGGAGGCGTGCCAGGGTACATCGCCGCCGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CGTGAGCTGCTACAACGCCAGCGATCATGTCTACAAGGGCTGCTTCGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102376 CGTGAGCTGCTACAACGCCAGCGATCATGTCTACAAGGGCTGCTTCGACG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCAACGTCACCTTGACGGCAG         CTAATGTGACTGTGTCCTTG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 102426 GCAACGTCACCTTGACGGCAGGTG...CAGCTAATGTGACTGTGTCCTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 CCTGTCCGGGGCTGTGTCCAGGATGAATTCTGCACTCGGGATGGAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103745 CCTGTCCGGGGCTGTGTCCAGGATGAATTCTGCACTCGGGATGGAGTAAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGGCCCAGGGTTCACGCTCAGTGGCTCCTGTTGCCAGGGGTCCCGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103795 AGGCCCAGGGTTCACGCTCAGTGGCTCCTGTTGCCAGGGGTCCCGCTGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ACTCTGACCTCCGCAACAAGACCTACTTCTCCCCTCGAATCCCACCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103845 ACTCTGACCTCCGCAACAAGACCTACTTCTCCCCTCGAATCCCACCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTCCGGCTGCCCCCTCCAGAGCCCACGACTGTGGCCTCAACCACATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103895 GTCCGGCTGCCCCCTCCAGAGCCCACGACTGTGGCCTCAACCACATCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CACCACTTCTACCTCGGCCCCAGTGAGACCCACATCCACCACCAAACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103945 CACCACTTCTACCTCGGCCCCAGTGAGACCCACATCCACCACCAAACCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 TGCCAGCGCCAACCAGTCAGACTCCGAGACAGGGAGTAGAACACGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103995 TGCCAGCGCCAACCAGTCAGACTCCGAGACAGGGAGTAGAACACGAGGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TCCCGGGATGAGGAGCCCAGGTTGACTGGAGGCGCCGCTGGCCACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104045 TCCCGGGATGAGGAGCCCAGGTTGACTGGAGGCGCCGCTGGCCACCAGGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CCGCAGCAATTCAGGGCAGTATCCTGCAAAAGGGGGGCCCCAGCAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104095 CCGCAGCAATTCAGGGCAGTATCCTGCAAAAGGGGGGCCCCAGCAGCCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 ATAATAAAGGCTGTGTGGCTCCCACAGCTGGATTGGCAGCCCTTCTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104145 ATAATAAAGGCTGTGTGGCTCCCACAGCTGGATTGGCAGCCCTTCTGTTG

   1050     .    :    .    :
   1015 GCCGTGGCTGCTGGTGTCCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||
 104195 GCCGTGGCTGCTGGTGTCCTACTG