seq1 = pF1KE5412.tfa, 930 bp
seq2 = pF1KE5412/gi568815587r_56362472.tfa (gi568815587r:56362472_56563401), 200930 bp

>pF1KE5412 930
>gi568815587r:56362472_56563401 (Chr11)

(complement)

1-930  (100001-100930)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTAATTTCACGGATGTGACAGAATTTACTCTCCTGGGGCTGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTAATTTCACGGATGTGACAGAATTTACTCTCCTGGGGCTGACCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGTCAGGAGCTACAGGTTCTCTTTTTTGTGGTGTTCCTAGCGGTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGTCAGGAGCTACAGGTTCTCTTTTTTGTGGTGTTCCTAGCGGTTTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGATCACTCTGTTGGGAAATATTGGTATGATCATTTTGATTAGCATCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGATCACTCTGTTGGGAAATATTGGTATGATCATTTTGATTAGCATCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTCAGCTTCAGAGTCCCATGTACTTTTTCCTGAGTCATCTGTCTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTCAGCTTCAGAGTCCCATGTACTTTTTCCTGAGTCATCTGTCTTTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACGTGTGCTTCTCCTCCAACGTTACCCCCAAAATGCTGGAAAACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACGTGTGCTTCTCCTCCAACGTTACCCCCAAAATGCTGGAAAACTTAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TATCAGAGACAAAAACCATTTCCTATGTGGGATGCTTGGTGCAGTGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TATCAGAGACAAAAACCATTTCCTATGTGGGATGCTTGGTGCAGTGCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTTTTCATTGCCGTTGTCCACGTGGAGGTCTATATCCTGGCTGTGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTTTTCATTGCCGTTGTCCACGTGGAGGTCTATATCCTGGCTGTGATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTTGACAGGTACATGGCCGGCTGCAACCCTCTGCTTTATGGCAGTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTTGACAGGTACATGGCCGGCTGCAACCCTCTGCTTTATGGCAGTAAAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTCTAGGACTGTGTGTGTTCGGCTCATCTCTGTGCCTTATGTCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTCTAGGACTGTGTGTGTTCGGCTCATCTCTGTGCCTTATGTCTATGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCTCTGTCAGCCTAATATGCACACTATGGACTTATGGCTTATACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCTCTGTCAGCCTAATATGCACACTATGGACTTATGGCTTATACTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGAAACTTTGAAATCAATCACTTCTATTGTGCAGATCCCCCTCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGAAACTTTGAAATCAATCACTTCTATTGTGCAGATCCCCCTCTCATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGATTGCCTGTGGGAGAGTGCACATCAAAGAAATCACAATGATTGTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGATTGCCTGTGGGAGAGTGCACATCAAAGAAATCACAATGATTGTTATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCTGGAATTAACTTCACATATTCCCTCTCGGTGGTCCTCATCTCCTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCTGGAATTAACTTCACATATTCCCTCTCGGTGGTCCTCATCTCCTACAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCTCATTGTAGTAGCTGTGCTACGCATGCGCTCTGCCGATGGCAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCTCATTGTAGTAGCTGTGCTACGCATGCGCTCTGCCGATGGCAGGAGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGGCGTTCTCCACCTGTGGGTCCCACTTGACGGCTGTTTCTATGTTTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGGCGTTCTCCACCTGTGGGTCCCACTTGACGGCTGTTTCTATGTTTTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGGACCCCCATCTTCATGTATCTCAGGAGACCCACTGAGGAATCCGTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGGACCCCCATCTTCATGTATCTCAGGAGACCCACTGAGGAATCCGTAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCAGGGCAAAATGGTGGCTGTGTTTTACACCACAGTAATTCCTATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCAGGGCAAAATGGTGGCTGTGTTTTACACCACAGTAATTCCTATGTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCCATGATCTACAGTCTGAGAAATAAGGATGTAAAAGAAGCAGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCCATGATCTACAGTCTGAGAAATAAGGATGTAAAAGAAGCAGTCAAC

    900     .    :    .    :    .    :
    901 AAAGCAATCACCAAGACATATGTGAGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAGCAATCACCAAGACATATGTGAGGCAG