seq1 = pF1KE5405.tfa, 996 bp
seq2 = pF1KE5405/gi568815592r_39199430.tfa (gi568815592r:39199430_39414320), 214891 bp

>pF1KE5405 996
>gi568815592r:39199430_39414320 (Chr6)

(complement)

1-237  (100001-100237)   99% ->
238-352  (103314-103428)   100% ->
353-513  (109666-109826)   100% ->
514-688  (110190-110364)   100% ->
689-996  (114584-114891)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACCGACCGCGGGCCCGGGCGGCTCCCGAGGGCAGGGTCCGGGGCTG
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACCGACCGCGAGCCCGGGCGGCTCCCGAGGGCAGGGTCCGGGGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCGGTGCCCGGCACCGTGCTCCTGCTGCTCGCCTACCTGGCTTACCTGG
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCGGTGCCCAGCACCGTGCTCCTGCTGCTCGCCTACCTGGCTTACCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCTGGGCACCGGCGTGTTCTGGACGCTGGAGGGCCGCGCGGCGCAGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCTGGGCACCGGCGTGTTCTGGACGCTGGAGGGCCGCGCGGCGCAGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCAGCCGCAGCTTCCAGCGCGACAAGTGGGAGCTGTTGCAGAACTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCAGCCGCAGCTTCCAGCGCGACAAGTGGGAGCTGTTGCAGAACTTCAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGTCTGGACCGCCCGGCGCTGGACTCGCTGATCCGG         GATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 100201 GTGTCTGGACCGCCCGGCGCTGGACTCGCTGATCCGGGTC...CAGGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCGTCCAAGCATACAAAAACGGAGCCAGCCTCCTCAGCAACACCACCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103318 TCGTCCAAGCATACAAAAACGGAGCCAGCCTCCTCAGCAACACCACCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGGGGCGCTGGGAGCTCGTGGGCTCCTTCTTCTTTTCTGTGTCCACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103368 ATGGGGCGCTGGGAGCTCGTGGGCTCCTTCTTCTTTTCTGTGTCCACCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CACCACCATTG         GCTATGGCAACCTGAGCCCCAACACGATGG
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 103418 CACCACCATTGGTA...CAGGCTATGGCAACCTGAGCCCCAACACGATGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGCCCGCCTCTTCTGCATCTTCTTTGCCCTTGTGGGGATCCCACTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109696 CTGCCCGCCTCTTCTGCATCTTCTTTGCCCTTGTGGGGATCCCACTCAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCGTGGTGCTCAACCGACTGGGGCATCTCATGCAGCAGGGAGTAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109746 CTCGTGGTGCTCAACCGACTGGGGCATCTCATGCAGCAGGGAGTAAACCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTGGGCCAGCAGGCTGGGGGGCACCTGGCAG         GATCCTGACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 109796 CTGGGCCAGCAGGCTGGGGGGCACCTGGCAGGTG...CAGGATCCTGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGGCGCGGTGGCTGGCGGGCTCTGGCGCCCTCCTCTCGGGCCTCCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110200 AGGCGCGGTGGCTGGCGGGCTCTGGCGCCCTCCTCTCGGGCCTCCTGCTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TTCCTGCTGCTGCCACCGCTGCTCTTCTCCCACATGGAGGGCTGGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110250 TTCCTGCTGCTGCCACCGCTGCTCTTCTCCCACATGGAGGGCTGGAGCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CACAGAGGGCTTCTACTTCGCCTTCATCACCCTCAGCACCGTGGGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110300 CACAGAGGGCTTCTACTTCGCCTTCATCACCCTCAGCACCGTGGGCTTCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GCGACTACGTGATTG         GAATGAACCCCTCCCAGAGGTACCCA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 110350 GCGACTACGTGATTGGTG...CAGGAATGAACCCCTCCCAGAGGTACCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGTGGTACAAGAACATGGTGTCCCTGTGGATCCTCTTTGGGATGGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114610 CTGTGGTACAAGAACATGGTGTCCCTGTGGATCCTCTTTGGGATGGCATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 GCTGGCCTTGATCATCAAACTCATCCTCTCCCAGCTGGAGACGCCAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114660 GCTGGCCTTGATCATCAAACTCATCCTCTCCCAGCTGGAGACGCCAGGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGGTATGTTCCTGCTGCCACCACAGCTCTAAGGAAGACTTCAAGTCCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114710 GGGTATGTTCCTGCTGCCACCACAGCTCTAAGGAAGACTTCAAGTCCCAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCTGGAGACAGGGACCTGACCGGGAGCCAGAGTCCCACTCCCCACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114760 AGCTGGAGACAGGGACCTGACCGGGAGCCAGAGTCCCACTCCCCACAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGGATGCTATCCAGAGGGACCCATGGGAATCATACAGCATCTGGAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114810 AGGATGCTATCCAGAGGGACCCATGGGAATCATACAGCATCTGGAACCTT

   1000     .    :    .    :    .    :
    965 CTGCTCACGCTGCAGGCTGTGGCAAGGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 114860 CTGCTCACGCTGCAGGCTGTGGCAAGGACAGC