seq1 = pF1KE5389.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE5389/gi568815584f_20043736.tfa (gi568815584f:20043736_20244659), 200924 bp

>pF1KE5389 924
>gi568815584f:20043736_20244659 (Chr14)

1-924  (100001-100924)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAACACAGAACCTCACAGTGGTGACAGAATTCATTCTTCTTGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAACACAGAACCTCACAGTGGTGACAGAATTCATTCTTCTTGGTCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCCAGTCTCAAGATGCTCAACTTCTGGTCTTTGTGCTAGTCTTAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCCAGTCTCAAGATGCTCAACTTCTGGTCTTTGTGCTAGTCTTAATTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTTATCATCCTCCCTGGAAATTTCCTCATCATTTTCACCATAAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCAGACCCTGGGCTCACAGCCCCCCTCTATTTCTTTCTGGGCAACTTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTACTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGTTCCCAGGATGTTGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTACTGGATGCATCCTACTCCTTCATTGTGGTTCCCAGGATGTTGGTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTATAGAAGCTGCATCACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACTTCCTCTCTGAGAAGAAGGTAATCTCCTATAGAAGCTGCATCACTCAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCTTTTTCTTGCATTTTCTTGGAGCGGGAGAGATGTTCCTCCTCGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCTTTTTCTTGCATTTTCTTGGAGCGGGAGAGATGTTCCTCCTCGTTGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTTTACACTATTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGGCCTTTGACCGCTACATCGCCATCTGCCGGCCTTTACACTATTCAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CCATCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCATTATCGTTGGTTCTGTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CCATCATGAACCCTAGAGCCTGCTATGCATTATCGTTGGTTCTGTGGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGGGGCTTTATCCATTCCATTGTACAAGTAGCCCTTATCCTGCACTTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGGGGCTTTATCCATTCCATTGTACAAGTAGCCCTTATCCTGCACTTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TTTCTGTGGCCCAAACCAGCTCGATAACTTCTTCTGTGATGTTCCACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TTTCTGTGGCCCAAACCAGCTCGATAACTTCTTCTGTGATGTTCCACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TCATCAAGCTGGCCTGCACCAATACCTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TCATCAAGCTGGCCTGCACCAATACCTTTGTGGTGGAGCTTCTGATGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCCAACAGTGGCCTGCTCAGCCTCCTGTGCTTCCTGGGCCTTCTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCCAACAGTGGCCTGCTCAGCCTCCTGTGCTTCCTGGGCCTTCTGGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGCAGTCATCCTCTGTCGTATAAGGGAGCACTCCTCTGAAGGAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGCAGTCATCCTCTGTCGTATAAGGGAGCACTCCTCTGAAGGAAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GCAAGGCTATTTCCACATGCACCACCCATATTATCATTATATTTCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GCAAGGCTATTTCCACATGCACCACCCATATTATCATTATATTTCTCATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTGGACCTGCTATTTTCATCTACACTTGCCCCTTCCAGGCTTTCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTGGACCTGCTATTTTCATCTACACTTGCCCCTTCCAGGCTTTCCCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGACAAGGTAGTTTCTCTTTTCCATACTGTCATCTTTCCTTTGATGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGACAAGGTAGTTTCTCTTTTCCATACTGTCATCTTTCCTTTGATGAACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTTATTTATACGCTTCGCAACCAGGAGGTGAAAGCTTCCATGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTTATTTATACGCTTCGCAACCAGGAGGTGAAAGCTTCCATGAGGAAG

    900     .    :    .    :
    901 TTGTTAAGTCAACATATGTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||
 100901 TTGTTAAGTCAACATATGTTTTGC