seq1 = pF1KE5387.tfa, 924 bp
seq2 = pF1KE5387/gi568815587r_6791577.tfa (gi568815587r:6791577_6992500), 200924 bp

>pF1KE5387 924
>gi568815587r:6791577_6992500 (Chr11)

(complement)

1-924  (100001-100924)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGACAGATAAATCAGACACAAGTGACAGAATTCCTCCTTCTGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGACAGATAAATCAGACACAAGTGACAGAATTCCTCCTTCTGGGACT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGATGGGCCACACACCGAGCAGCTGCTATTTATCGTATTATTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTCTGATGGGCCACACACCGAGCAGCTGCTATTTATCGTATTATTGGGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTACCTGGTCACTGTGCTTGGAAATCTGCTTCTAATCTCCCTTGTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTACCTGGTCACTGTGCTTGGAAATCTGCTTCTAATCTCCCTTGTTCAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGACTCCCAACTTCACACACCCATGTATTTTTTTCTCTGCAACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGACTCCCAACTTCACACACCCATGTATTTTTTTCTCTGCAACTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCTGGCTGACCTCTGTTTCTCTACCAACATAGTTCCTCAGGCACTAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCTGGCTGACCTCTGTTTCTCTACCAACATAGTTCCTCAGGCACTAGTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ACCTGCTTTCCAGAAAGAAGGTCATTGCATTCACACTTTGCGCAGCTCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ACCTGCTTTCCAGAAAGAAGGTCATTGCATTCACACTTTGCGCAGCTCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTTCTCTTTTTCCTCATTTTTGGGTGTACCCAGTGCGCCCTTCTTGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTTCTCTTTTTCCTCATTTTTGGGTGTACCCAGTGCGCCCTTCTTGCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GATGTCCTATGATCGCTATGTTGCAATCTGCAATCCTCTGCGTTACCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GATGTCCTATGATCGCTATGTTGCAATCTGCAATCCTCTGCGTTACCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACATCATGACCTGGAAAGTGTGTGTCCAGCTGGCAACAGGATCATGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACATCATGACCTGGAAAGTGTGTGTCCAGCTGGCAACAGGATCATGGACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGTGGCATTCTGGTGTCTGTGGTAGACACCACCTTCACACTGAGGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
 100451 AGTGGCATTCTGGTGTCTGTGGTAGACACCACCTTCATACTGAGGCTACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTACCGAGGCAGTAACAGCATTGCTCATTTCTTTTGTGAGGCCCCTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTACCGAGGCAGTAACAGCATTGCTCATTTCTTTTGTGAGGCCCCTGCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TATTGATCTTAGCATCCACAGACACCCATGCATCAGAGATGGCCATTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TATTGATCTTAGCATCCACAGACACCCATGCATCAGAGATGGCCATTTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTACGGGGGTTGTGATTCTCCTCATACCTGTTTTTCTGATTCTGGTATC
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTATGGGGGTTGTGATTCTCCTCATACCTGTTTTTCTGATTCTGGTATC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTATGGCCGTATCATAGTAACTGTGGTCAAGATGAAGTCAACTGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTATGGCCGTATCATAGTAACTGTGGTCAAGATGAAGTCAACTGTGGGGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTCTCAAGGCATTTTCTACCTGTGGCTCCCACCTCATGGTGGTCATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTCTCAAGGCATTTTCTACCTGTGGCTCCCACCTCATGGTGGTCATACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TTTTATGGATCAGCAATTATCACTTACATGACACCCAAGTCTTCCAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TTTTATGGATCAGCAATTATCACTTACATGACACCCAAGTCTTCCAAACA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCAGGAAAAATCGGTGTCTGTTTTCTATGCAATAGTGACTCCCATGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCAGGAAAAATCGGTGTCTGTTTTCTATGCAATAGTGACTCCCATGCTTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ATCCCCTCATCTATAGCCTGAGAAACAAGGATGTGAAGGCAGCTCTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCCCTCATCTATAGCCTGAGAAACAAGGATGTGAAGGCAGCTCTGAGG

    900     .    :    .    :
    901 AAAGTAGCCACAAGGAATTTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAGTAGCCACAAGGAATTTCCCA