seq1 = pF1KE5386.tfa, 921 bp
seq2 = pF1KE5386/gi568815592f_29296700.tfa (gi568815592f:29296700_29497620), 200921 bp

>pF1KE5386 921
>gi568815592f:29296700_29497620 (Chr6)

1-921  (100001-100921)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGAATACAACCTCAGTCACCGAATTTCTCCTCTTGGGAGTGACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100001 ATGCTGAATACAACCTCAGTCACCGAATTTCTCCTCTTGGGAGTGACAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTCAAGAACTGCAGCCTTTTCTCTTCGTGGTTTTCCTCACCATCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTCAAGAACTGCAGCCTTTTCTCTTCGTGGTTTTCCTCACCATCTACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCAGTGTGACTGGGAATGGAGCCGTTCTGATGATTGTCATCTCCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCAGTGTGACTGGGAATGGAGCCGTTCTGATGATTGTCATCTCCGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCTAGACTCCATTCCCTTATGTATTTCTTCCTGGGAAACCTGTCCTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCTAGACTCCATTCCCTTATGTATTTCTTCCTGGGAAACCTGTCCTACCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGATATCTGTTACTCTACGGTGACACTGCCAAAAATGCTGCAGAACTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGATATCTGTTACTCTACGGTGACACTGCCAAAAATGCTGCAGAACTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTCTACACACAAAGCAATTTCTTTCTTGGGATGCATAAGCCAGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTCTACACACAAAGCAATTTCTTTCTTGGGATGCATAAGCCAGCTTCAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTCCACTTCCTGGGCAGCACGGAGTCCATGTTGTTCGCCGTGATGGC
        |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTCCACTCCCTGGGCAGCACGGAGTCCATGTTGTTCGCCGTGATGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 ATTTGACCTCTCTGTGGCTATCTGCAAGCCACTTCGCTACACTGTCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 ATTTGACCTCTCTGTGGCTATCTGCAAGCCACTTCGCTACACTGTCATCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGAACCCTCAGCTCTGTACCCAGATGGCCATCACAATCTGGGTCATTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGAACCCTCAGCTCTGTACCCAGATGGCCATCACAATCTGGGTCATTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTTTCCATGCCCTGCTGCACTCCGTAATGACTTCTCGCTTGAACTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTTTCCATGCCCTGCTGCACTCCGTAATGACTTCTCGCTTGAACTTCTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGGTTCCAACCGTATCCATCATTTTCTCTGTGATATTAAGCCATTGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGGTTCCAACCGTATCCATCATTTTCTCTGTGATATTAAGCCATTGCTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCTGGCCTGTGGGAACACTGAGCTTAATCAGTGGCTACTCAGTACTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGCTGGCCTGTGGGAACACTGAGCTTAATCAGTGGCTACTCAGTACTGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACGGGGACAATTGCCATGGGCCCCTTCTTTCTGACACTTCTCTCCTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACGGGGACAATTGCCATGGGCCCCTTCTTTCTGACACTTCTCTCCTATTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTACATTATCACTTATCTCTTCTTCAAGACCCGTTCTTGTAGCATGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTACATTATCACTTATCTCTTCTTCAAGACCCGTTCTTGTAGCATGCTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GTAAAGCACTGTCCACTTGTGCCTCCCACTTCATGGTAGTTATTCTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GTAAAGCACTGTCCACTTGTGCCTCCCACTTCATGGTAGTTATTCTTTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGCACCTGTTCTTTTCACCTATATCCATCCTGCGTTAGAGAGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGCACCTGTTCTTTTCACCTATATCCATCCTGCGTTAGAGAGCTTCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGACCAGGACCGGATTGTTGCCATCATGTACACTGTGGTCACTCCTGTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGACCAGGACCGGATTGTTGCCATCATGTACACTGTGGTCACTCCTGTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TAAACCCACTGATCTATACTTTGAGGAACAAGGAAGTGAAGGGGGCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TAAACCCACTGATCTATACTTTGAGGAACAAGGAAGTGAAGGGGGCCTTG

    900     .    :    .    :
    901 GGTAGAGTGATCAGAAGGCTT
        |||||||||||||||||||||
 100901 GGTAGAGTGATCAGAAGGCTT