seq1 = pF1KE5380.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KE5380/gi568815597f_1.tfa (gi568815597f:1_170005), 170005 bp

>pF1KE5380 915
>gi568815597f:1_170005 (Chr1)

1-915  (69091-70005)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69091 ATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGAACTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTTCCTATTTATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69141 GACCTTCCTATTTATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAACCTTCTTATTGTCATAACAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69191 GAAACCTTCTTATTGTCATAACAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69241 CCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69291 TTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69341 TCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69391 GGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCAATATGCAAACCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCAT
        |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69441 AGCAATATGCAAGCCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGTCGGCATTATGGCTGTCGCATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTG
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
  69491 GTGTCGGCATTATGGCTGTCACATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCAGTTGGCCTTTGCCGTGCACTTACCCTTCTGTGGTCCCAATGAGGT
        ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
  69541 AGCCAGTTGGCGTTTGCCGTGCACTTACTCTTCTGTGGTCCCAATGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69591 CGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69641 ATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69691 GTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69741 CATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69791 CTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69841 TATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69891 TTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACAGCTGAGAAAATGGGATGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  69941 ACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACAGCTGAGAAAATGGGATGCACAT

    900     .    :    .
    901 TCTAGTGTAAAGTTT
        |||||||||||||||
  69991 TCTAGTGTAAAGTTT