seq1 = pF1KE5380.tfa, 915 bp
seq2 = pF1KE5380/gi568815579f_10679.tfa (gi568815579f:10679_211593), 200915 bp

>pF1KE5380 915
>gi568815579f:10679_211593 (Chr19)

1-915  (100001-100915)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGAACTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100001 ATGGTGACTGAATTCATTTTTCTGGGTCTCTCTGATTCTCAGGGACTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTTCCTATTTATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTTCCTATTTATGTTGTTTTTTGTATTCTATGGAGGAATCGTGTTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAACCTTCTTATTGTCATAACAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAACCTTCTTATTGTCATAACAGTGGTATCTGACTCCCACCTTCACTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCATGTACTTCCTGCTAGCCAACCTCTCACTCATTGATCTGTCTCTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCAGTCACAGCCCCCAAGATGATTACTGACTTTTTCAGCCAGCGCAAAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCTCTTTCAAGGGCTGCCTTGTTCAGATATTTCTCCTTCACTTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGTGGGAGTGAGATGGTGATCCTCATAGCCATGGGCTTTGACAGATATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGCAATATGCAAACCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGCAATATGCAAACCCCTACACTACACTACAATTATGTGTGGCAACGCAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GTGTCGGCATTATGGCTGTCGCATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GTGTCGGCATTATGGCTGTCGCATGGGGAATTGGCTTTCTCCATTCGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCAGTTGGCCTTTGCCGTGCACTTACCCTTCTGTGGTCCCAATGAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCCAGTTGGCCTTTGCCGTGCACTTACCCTTCTGTGGTCCCAATGAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGATAGTTTTTATTGTGACCTTCCTAGGGTAATCAAACTTGCCTGTACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ATACCTACAGGCTAGATATTATGGTCATTGCTAACAGTGGTGTGCTCACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GTGTGTTCTTTTGTTCTTCTAATCATCTCATACACTATCATCCTAATGAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CATCCAGCATCGCCCTTTAGATAAGTCGTCCAAAGCTCTGTCCACTTTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CTGCTCACATTACAGTAGTTCTTTTGTTCTTTGGACCATGTGTCTTTATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGCCTGGCCATTCCCCATCAAGTCATTAGATAAATTCCTTGCTGTATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTATTCTGTGATCACCCCTCTCTTGAACCCAATTATATACACACTGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACAGCTGAGAAAATGGGATGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACAAAGACATGAAGACGGCAATAAGACAGCTGAGAAAATGGGATGCACAT

    900     .    :    .
    901 TCTAGTGTAAAGTTT
        |||||||||||||||
 100901 TCTAGTGTAAAGTTT