seq1 = pF1KE5374.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE5374/gi568815586r_10885964.tfa (gi568815586r:10885964_11086860), 200897 bp

>pF1KE5374 897
>gi568815586r:10885964_11086860 (Chr12)

(complement)

1-897  (100001-100897)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATAACTTTTCTATACATTTTTTTTTCAATTCTAATAATGGTTTTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATAACTTTTCTATACATTTTTTTTTCAATTCTAATAATGGTTTTATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTCTCGGAAACTTTGCCAATGGCTTCATAGCACTGGTAAATTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTTCTCGGAAACTTTGCCAATGGCTTCATAGCACTGGTAAATTTCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGTGAAGAGAAAAAAGATCTCCTCAGCTGACCAAATTCTCACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGGTGAAGAGAAAAAAGATCTCCTCAGCTGACCAAATTCTCACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCGGTCTCCAGAATTGGTTTGCTCTGGGCATTATTATTAAATTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCGGTCTCCAGAATTGGTTTGCTCTGGGCATTATTATTAAATTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTTAACTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAATTAAGAATTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTTAACTGTGTTGAATCCAGCTTTTTATAGTGTAGAATTAAGAATTACTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTATAATGCCTGGGTTGTAACCAACCATTTCAGCATGTGGCTTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTATAATGCCTGGGTTGTAACCAACCATTTCAGCATGTGGCTTGCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTCTTCATTTAAAGAGGAGAGTTAGGAGTGTCATTCTGGTGATACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTCTTCATTTAAAGAGGAGAGTTAGGAGTGTCATTCTGGTGATACTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGGACTTTGATATTTTTGGTTTGTCATCTTCTTGTGGCAAACATGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGGACTTTGATATTTTTGGTTTGTCATCTTCTTGTGGCAAACATGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGTATGTGGGCAGAAGAATATGAAGGAAACATGACTGGGAAGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGTATGTGGGCAGAAGAATATGAAGGAAACATGACTGGGAAGATGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTGAGGAATACAGTACATCTTTCATATTTGACTGTAACTACCCTATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTGAGGAATACAGTACATCTTTCATATTTGACTGTAACTACCCTATGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTTCATACCCTTTACTCTGTCCCTGATATCTTTTCTGATGCTAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTTCATACCCTTTACTCTGTCCCTGATATCTTTTCTGATGCTAATCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGAGAAGGATCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCTGTGTAAACATCTCAAGAAGATGCAGCTCCATGGAGAAGGATCGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCTCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTCTGATCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCTCAGCACCAAGGTCCACATAAAAGCTTTGCAAACTCTGATCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCTTGTTATGTGCCATTTTCTTTCTATTCCTAATCGTTTCGGTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCTTGTTATGTGCCATTTTCTTTCTATTCCTAATCGTTTCGGTTTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AGTCCTAGGAGGCTGCGGAATGACCCGGTTGTCATGGTTAGCAAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AGTCCTAGGAGGCTGCGGAATGACCCGGTTGTCATGGTTAGCAAGGCTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGAAACATATATCTTGCATTCGACTCATTCATCCTAATTTGGAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGAAACATATATCTTGCATTCGACTCATTCATCCTAATTTGGAGAACCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    851 AGAAGCTAAAACACACCTTTCTTTTGATTTTGTGTCAGATTAGGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGAAGCTAAAACACACCTTTCTTTTGATTTTGTGTCAGATTAGGTGC