seq1 = pF1KE5373.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE5373/gi568815586r_10921675.tfa (gi568815586r:10921675_11122571), 200897 bp

>pF1KE5373 897
>gi568815586r:10921675_11122571 (Chr12)

(complement)

1-897  (100001-100897)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTGTTTTCTGCTCATCATTTCATCAATTCTGGTAGTGTTTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTGTTTTCTGCTCATCATTTCATCAATTCTGGTAGTGTTTGCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTTCTTGGAAATGTTGCCAATGGCTTCATAGCTCTAGTAAATGTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
 100051 TGTTCTTGGAAATGTTGCCAATGGCTTCATAGCCCTAGTAAATGTCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTGGGTTAACACACGAAAGATCTCCTCAGCTGAGCAAATTCTCACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTGGGTTAACACACGAAAGATCTCCTCAGCTGAGCAAATTCTCACTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGTGGTCTCCAGAATTGGTTTACTCTGGGTCATGTTATTCCTTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGTGGTCTCCAGAATTGGTTTACTCTGGGTCATGTTATTCCTTTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAACTGTGTTTAATTCTGCTTTATATGGTTTAGAAGTAAGAATTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCAACTGTGTTTAATTCTGCTTTATATGGTTTAGAAGTAAGAATTGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTTCTAATGCCTGGGCTGTAACGAACCATTTCAGCATGTGGCTTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTTCTAATGCCTGGGCTGTAACGAACCATTTCAGCATGTGGCTTGCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCTCAGCATATTTTGTTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCTCAGCATATTTTGTTTGCTCAAGATTGCCAATTTCTCCAACCTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTCTCTCCACCTAAAGAAGAGAATTAAGAGTGTTGTTCTGGTGATACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTCTCTCCACCTAAAGAAGAGAATTAAGAGTGTTGTTCTGGTGATACTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGGCCCTTGGTATTTTTGATTTGTAATCTTGCTGTGATAACCATGGAT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGGCCCTTGGTATTTCTGATTTGTAATCTTGCTGTGATAACCATGGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAGAGAGTGTGGACAAAAGAATATGAAGGAAATGTGACTTGGAAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAGAGAGTGTGGACAAAAGAATATGAAGGAAATGTGACTTGGAAGATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTGAGGAATGCAATACACCTTTCAAGCTTGACTGTAACTACTCTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTGAGGAATGCAATACACCTTTCAAGCTTGACTGTAACTACTCTAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCTCATACCCTTTACTCTGAGCCTAATATGTTTTCTGCTGTTAATCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCTCATACCCTTTACTCTGAGCCTAATATGTTTTCTGCTGTTAATCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCTTTGTAAACATCTCAAGAAGATGCGGCTCCATAGCAAAGGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCTTTGTAAACATCTCAAGAAGATGCGGCTCCATAGCAAAGGATCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCCCAGCACCAAGGTCCATATAAAAGCTTTGCAAACTGTGACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCCCAGCACCAAGGTCCATATAAAAGCTTTGCAAACTGTGACCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCATGTTATTTGCCATTTACTTTCTGTGTATAATCACATCAACTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCATGTTATTTGCCATTTACTTTCTGTGTATAATCACATCAACTTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATCTTAGGACACAGCAGAGCAAACTTGTACTCCTGCTTTGCCAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATCTTAGGACACAGCAGAGCAAACTTGTACTCCTGCTTTGCCAAACTGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGCAATCATGTATCCTTCATTCCACTCATTCATCCTGATTATGGGAAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGCAATCATGTATCCTTCATTCCACTCATTCATCCTGATTATGGGAAGTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    851 GGAAGCTAAAACAGACCTTTCTTTCAGTTTTGTGGCAGATGACACGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GGAAGCTAAAACAGACCTTTCTTTCAGTTTTGTGGCAGATGACACGC