seq1 = pF1KE5372.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE5372/gi568815593r_9529136.tfa (gi568815593r:9529136_9730032), 200897 bp

>pF1KE5372 897
>gi568815593r:9529136_9730032 (Chr5)

(complement)

1-897  (100001-100897)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTAGAGTCTCACCTCATTATCTATTTTCTTCTTGCAGTGATACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTAGAGTCTCACCTCATTATCTATTTTCTTCTTGCAGTGATACAATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTCTTGGGATTTTCACAAATGGCATCATTGTGGTGGTGAATGGCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTCTTGGGATTTTCACAAATGGCATCATTGTGGTGGTGAATGGCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACTTGATCAAGCACAGAAAAATGGCTCCGCTGGATCTCCTTCTTTCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACTTGATCAAGCACAGAAAAATGGCTCCGCTGGATCTCCTTCTTTCTTGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCAGTTTCTAGAATTTTTCTGCAGTTGTTCATCTTCTACGTTAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCAGTTTCTAGAATTTTTCTGCAGTTGTTCATCTTCTACGTTAATGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATTGTTATCTTCTTCATAGAATTCATCATGTGTTCTGCGAATTGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GATTGTTATCTTCTTCATAGAATTCATCATGTGTTCTGCGAATTGTGCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTCTCTTATTTATAAATGAATTGGAACTTTGGCTTGCCACATGGCTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTCTCTTATTTATAAATGAATTGGAACTTTGGCTTGCCACATGGCTCGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTTTTCTATTGTGCCAAGGTTGCCAGCGTCCGTCACCCACTCTTCATCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTTTTCTATTGTGCCAAGGTTGCCAGCGTCCGTCACCCACTCTTCATCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTGAAGATGAGGATATCCAAGCTGGTCCCATGGATGATCCTGGGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTGAAGATGAGGATATCCAAGCTGGTCCCATGGATGATCCTGGGGTCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTATATGTATCTATGATTTGTGTTTTCCATAGCAAATATGCAGGGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTATATGTATCTATGATTTGTGTTTTCCATAGCAAATATGCAGGGTTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATGGTCCCATACTTCCTAAGGAAATTTTTCTCCCAAAATGCCACAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATGGTCCCATACTTCCTAAGGAAATTTTTCTCCCAAAATGCCACAATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAAAGAAGATACACTGGCTATACAGATTTTCTCTTTTGTTGCTGAGTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAAAGAAGATACACTGGCTATACAGATTTTCTCTTTTGTTGCTGAGTTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CAGTGCCATTGCTTATCTTCCTTTTTGCTGTTTTGCTCTTGATTTTCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CAGTGCCATTGCTTATCTTCCTTTTTGCTGTTTTGCTCTTGATTTTCTCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGGGAGGCACACCTGGCAAATGAGAAACACAGTGGCCGGCAGCAGGGT
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGGGAGGCACACCCGGCAAATGAGAAACACAGTGGCCGGCAGCAGGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCTGGCAGGGGTGCACCCATCAGCGCGTTGCTGTCTATCCTGTCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCTGGCAGGGGTGCACCCATCAGCGCGTTGCTGTCTATCCTGTCCTTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGATCCTCTACTTCTCCCACTGCATGATAAAAGTTTTTCTCTCTTCTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGATCCTCTACTTCTCCCACTGCATGATAAAAGTTTTTCTCTCTTCTCTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AAGTTTCACATCAGAAGGTTCATCTTTCTGTTCTTCATCCTTGTGATTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AAGTTTCACATCAGAAGGTTCATCTTTCTGTTCTTCATCCTTGTGATTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TATATACCCTTCTGGACACTCTCTCATCTTAATTTTAGGAAATCCTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TATATACCCTTCTGGACACTCTCTCATCTTAATTTTAGGAAATCCTAAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    851 TGAAACAAAATGCAAAAAAGTTCCTCCTCCACAGTAAGTGCTGTCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGAAACAAAATGCAAAAAAGTTCCTCCTCCACAGTAAGTGCTGTCAG