seq1 = pF1KE5371.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE5371/gi568815591f_141678489.tfa (gi568815591f:141678489_141879385), 200897 bp

>pF1KE5371 897
>gi568815591f:141678489_141879385 (Chr7)

1-897  (100001-100897)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTTCGGTTATTCTATTCCTCTGCTATTATTGCCTCAGTTATTTTAAA
        ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTTCGGTTATTCTATTTCTCTGCTATTATTGCCTCAGTTATTTTAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTTGTAGGAATCATTATGAATCTGTTTATTACAGTGGTCAATTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTTGTAGGAATCATTATGAATCTGTTTATTACAGTGGTCAATTGCAAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTTGGGTCAAAAGCCATAGAATCTCCTCTTCTGATAGGATTCTGTTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTTGGGTCAAAAGCCATAGAATCTCCTCTTCTGATAGGATTCTGTTCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGGCATCACCAGGTTTCTTATGCTGGGACTATTTCTGGTGAACACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGGCATCACCAGGTTTCTTATGCTGGGACTATTTCTGGTGAACACCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTTCGTCTCTTCAAATACGGAAAGGTCAGTCTACCTGTCTGCTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTTCGTCTCTTCAAATACGGAAAGGTCAGTCTACCTGTCTGCTTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTGTGTTGTGTTTCATGTTTTTGGACTCGAGCAGTCTCTGGTTTGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
 100251 TTGTGTTGTGTTTCATGTTTTTGGACTCGAGCAGTGTCTGGTTTGTGACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGCTCAATATCTTGTACTGTGTGAAGATTACTAACTTCCAACACTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGCTCAATATCTTGTACTGTGTGAAGATTACTAACTTCCAACACTCAGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTTTCTCCTGCTGAAGCGGAATATCTCCCCAAAGATCCCCAGGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTTTCTCCTGCTGAAGCGGAATATCTCCCCAAAGATCCCCAGGCTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGCCTGTGTGCTGATTTCTGCTTTCACCACTTGCCTGTACATCACGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGCCTGTGTGCTGATTTCTGCTTTCACCACTTGCCTGTACATCACGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AGCCAGGCATCACCTTTTCCTGAACTTGTGACTACGAGAAATAACACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGCCAGGCATCACCTTTTCCTGAACTTGTGACTACGAGAAATAACACATC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ATTTAATATCAATGAGGGCATCTTGTCTTTAGTGGTTTCTTTGGTCTTGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ATTTAATATCAGTGAGGGCATCTTGTCTTTAGTGGTTTCTTTGGTCTTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GCTCATCTCTCCAGTTCATCATTAATGTGACTTCTGCTTCCTTGCTAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GCTCATCTCTCCAGTTCATCATTAATGTGACTTCTGCTTCCTTGCTAATA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACTCCTTGAGGAGACATATACAGAAGATGCAGAAAAATGCCACCGGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
 100601 CACTCCTTGAGGAGACATATACAGAAGATGCAGAAAAATGCCACTGGTTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTGGAATCCCCAGACGGAAGCTCATGTAGGTGCTATGAAGCTGATGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTGGAATCCCCAGACGGAAGCTCATGTAGGTGCTATGAAGCTGATGGTCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTTCCTCATCCTCTACATTCCATATTCAGTTGCTACCCTGGTCCAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATTTCCTCATCCTCTACATTCCATATTCAGTTGCTACCCTGGTCCAGTAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTCCCCTTTTATGCAGGGATGGATATGGGGACCAAATCCATTTGTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTCCCCTTTTATGCAGGGATGGATATGGGGACCAAATCCATTTGTCTGAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TTTTGCCACCCTTTACTCTCCAGGACATTCTGTTCTCATTATTATCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TTTTGCCACCCTTTACTCTCCAGGACATTCTGTTCTCATTATTATCACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    851 ATCCTAAACTGAAAACAACAGCAAAGAAGATTCTTTGTTTCAAAAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ATCCTAAACTGAAAACAACAGCAAAGAAGATTCTTTGTTTCAAAAAA