seq1 = pF1KE5364.tfa, 897 bp
seq2 = pF1KE5364/gi568815579f_16561218.tfa (gi568815579f:16561218_16788368), 227151 bp

>pF1KE5364 897
>gi568815579f:16561218_16788368 (Chr19)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-281  (118767-118923)   100% ->
282-466  (119180-119364)   100% ->
467-554  (121204-121291)   100% ->
555-672  (125071-125188)   100% ->
673-897  (126927-127151)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTGCTCTCGGCGCTGAGCCTGGGCGAACTGGCGCTCAGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTGCTCTCGGCGCTGAGCCTGGGCGAACTGGCGCTCAGCTTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCGGGTGCCGCTCTTCCCCGTCTTCGACCTCAGTTACTTCATCGTCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCGGGTGCCGCTCTTCCCCGTCTTCGACCTCAGTTACTTCATCGTCTCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTCTACCTCAAGTATGAGCCAG         GAGCAGTCGAACTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 TCCTCTACCTCAAGTATGAGCCAGGTG...CAGGAGCAGTCGAACTGTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGGCGCCACCCCATCGCGTCCTGGCTGTGCGCCATGCTGCATTGCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118784 CGGCGCCACCCCATCGCGTCCTGGCTGTGCGCCATGCTGCATTGCTTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAGCTACATCCTGGCTGATCTGCTCCTTGGGGAGCCACTGATCGATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118834 GAGCTACATCCTGGCTGATCTGCTCCTTGGGGAGCCACTGATCGATTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCAGCAACAACTCCAGCATCCTGCTGGCCTCAGCTGTCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 118884 TCAGCAACAACTCCAGCATCCTGCTGGCCTCAGCTGTCTGGTA...AAGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TACTTGATTTTCTTCTGCCCCCTGGACCTCTTCTACAAGTGTGTCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119181 TACTTGATTTTCTTCTGCCCCCTGGACCTCTTCTACAAGTGTGTCTGCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGCCTGTGAAACTCATCTTCGTGGCCATGAAGGAGGTGGTGCGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119231 CCTGCCTGTGAAACTCATCTTCGTGGCCATGAAGGAGGTGGTGCGAGTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCAAGATCGCGGTGGGCATCCATCACGCCCATCACCACTACCACCACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119281 GCAAGATCGCGGTGGGCATCCATCACGCCCATCACCACTACCACCACGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TGGTTCGTCATGATTGCAACTGGGTGGGTCAAAG         GTTCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 119331 TGGTTCGTCATGATTGCAACTGGGTGGGTCAAAGGTA...TAGGTTCTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGTCGCCCTCATGTCCAACTTTGAGCAGCTGCTCCGAGGGGTCTGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121211 TGTCGCCCTCATGTCCAACTTTGAGCAGCTGCTCCGAGGGGTCTGGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 CAGAGACCAACGAGATCCTGCACATGTCTTT         CCCCACCAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 121261 CAGAGACCAACGAGATCCTGCACATGTCTTTGTG...CAGCCCCACCAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GCCAGCCTGTATGGAGCCATCCTCTTCACCCTCCAGCAGACCCGCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125081 GCCAGCCTGTATGGAGCCATCCTCTTCACCCTCCAGCAGACCCGCTGGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCAGTGTCCAAAGCCAGCCTCATCTTCATCTTCACCTTGTTCATGGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125131 CCCAGTGTCCAAAGCCAGCCTCATCTTCATCTTCACCTTGTTCATGGTGT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CCTGTAAG         GTGTTTCTGACAGCCACCCACTCACACAGCTCC
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 125181 CCTGTAAGGTA...CAGGTGTTTCTGACAGCCACCCACTCACACAGCTCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCCTTTGATGCCCTGGAGGGCTACATCTGCCCCGTGCTGTTTGGTTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126960 CCCTTTGATGCCCTGGAGGGCTACATCTGCCCCGTGCTGTTTGGTTCGGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTGCGGGGGTGACCATCACCACGACAACCATGGTGGGTCCCACAGCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127010 CTGCGGGGGTGACCATCACCACGACAACCATGGTGGGTCCCACAGCGGTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 GTGGGCCAGGAGCTCAGCATTCGGCCATGCCCGCCAAGTCCAAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127060 GTGGGCCAGGAGCTCAGCATTCGGCCATGCCCGCCAAGTCCAAGGAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTGAGCGAGGGCTCCAGGAAGAAGAAGGCCAAGAAGGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127110 TTGAGCGAGGGCTCCAGGAAGAAGAAGGCCAAGAAGGCGGAT