seq1 = pF1KE5361.tfa, 912 bp
seq2 = pF1KE5361/gi568815586r_110437040.tfa (gi568815586r:110437040_110683031), 245992 bp

>pF1KE5361 912
>gi568815586r:110437040_110683031 (Chr12)

(complement)

1-223  (100001-100223)   100% ->
224-403  (131064-131243)   100% ->
404-602  (136954-137152)   100% ->
603-726  (143087-143210)   100% ->
727-856  (144759-144888)   100% ->
857-912  (145937-145992)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCTCGGTCCTCTCGTACGGGCGGCTGGTGGCCCGCGCCGTGCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCTCGGTCCTCTCGTACGGGCGGCTGGTGGCCCGCGCCGTGCTCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCTCTCGCAGACCGACCCCAGGGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCCTCTCGCAGACCGACCCCAGGGCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGGACTGGTGACGGCCGGCTGCGGCTTCGGGAAGGACTTCCGTAAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGGACTGGTGACGGCCGGCTGCGGCTTCGGGAAGGACTTCCGTAAGGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCCTCAAGAAGGGCGCGTGCTACGGGGACGACGCGTGCTTCGTGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCCTCAAGAAGGGCGCGTGCTACGGGGACGACGCGTGCTTCGTGGCCCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACCGTTCCGCGGACGTGCTCG         GGGTTGCAGATGGTGTAG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100201 GCACCGTTCCGCGGACGTGCTCGGTG...CAGGGGTTGCAGATGGTGTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GAGGCTGGAGAGACTATGGAGTTGATCCATCTCAATTCTCAGGGACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131082 GAGGCTGGAGAGACTATGGAGTTGATCCATCTCAATTCTCAGGGACTTTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 ATGCGGACGTGTGAACGTTTAGTAAAAGAAGGACGGTTCGTACCTAGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131132 ATGCGGACGTGTGAACGTTTAGTAAAAGAAGGACGGTTCGTACCTAGTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TCCCATTGGAATTCTCACCACAAGCTACTGTGAGTTGCTGCAAAATAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131182 TCCCATTGGAATTCTCACCACAAGCTACTGTGAGTTGCTGCAAAATAAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCCCTTTGCTCG         GTAGCAGCACCGCCTGCATTGTGGTGCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 131232 TCCCTTTGCTCGGTA...TAGGTAGCAGCACCGCCTGCATTGTGGTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GACAGAACCAGCCACCGCTTACACACAGCAAACCTGGGCGATTCAGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136983 GACAGAACCAGCCACCGCTTACACACAGCAAACCTGGGCGATTCAGGCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CCTGGTTGTCAGGGGTGGTGAAGTCGTGCACCGATCAGATGAGCAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137033 CCTGGTTGTCAGGGGTGGTGAAGTCGTGCACCGATCAGATGAGCAGCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 ATTACTTCAACACTCCATTCCAGCTCTCAATCGCTCCCCCTGAAGCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137083 ATTACTTCAACACTCCATTCCAGCTCTCAATCGCTCCCCCTGAAGCCGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GGAGTCGTCTTGAGCGACAG         TCCGGATGCTGCTGATAGCAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 137133 GGAGTCGTCTTGAGCGACAGGTA...CAGTCCGGATGCTGCTGATAGCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GTCTTTCGATGTCCAGCTAGGAGACATTATCCTGACGGCAACAGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143108 GTCTTTCGATGTCCAGCTAGGAGACATTATCCTGACGGCAACAGATGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 TCTTTGACAACATGCCTGATTATATGATTCTTCAGGAGCTAAAAAAGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143158 TCTTTGACAACATGCCTGATTATATGATTCTTCAGGAGCTAAAAAAGTTA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AAG         AATTCAAATTATGAGAGTATACAACAGACTGCCAGAAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143208 AAGGTA...TAGAATTCAAATTATGAGAGTATACAACAGACTGCCAGAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CATTGCTGAGCAAGCTCATGAGCTGGCCTATGACCCAAATTATATGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144797 CATTGCTGAGCAAGCTCATGAGCTGGCCTATGACCCAAATTATATGTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CTTTTGCACAGTTTGCATGTGACAATGGATTGAATGTGAGAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 144847 CTTTTGCACAGTTTGCATGTGACAATGGATTGAATGTGAGAGGTA...TA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    857  GTGGAAAGCCAGATGACATCACCGTCCTTCTTTCAATAGTGGCTGAGTA
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145936 GGTGGAAAGCCAGATGACATCACCGTCCTTCTTTCAATAGTGGCTGAGTA

    950     .
    906 TACAGAC
        |||||||
 145986 TACAGAC