seq1 = pF1KE5358.tfa, 921 bp
seq2 = pF1KE5358/gi568815591f_143377873.tfa (gi568815591f:143377873_143578793), 200921 bp

>pF1KE5358 921
>gi568815591f:143377873_143578793 (Chr7)

1-921  (100001-100921)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAAGCAGCACTGACGGCCTTCTTCGTGTTGCTCTTTAGCCTGCTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAAGCAGCACTGACGGCCTTCTTCGTGTTGCTCTTTAGCCTGCTGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCTTCTGGGGATTGCAGCGAATGGCTTCATTGTGCTGGTGCTGGGCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCTTCTGGGGATTGCAGCGAATGGCTTCATTGTGCTGGTGCTGGGCAGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGTGGCTGCGATATGGCAGGTTGCTGCCCTTGGATATGATCCTCATTAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGTGGCTGCGATATGGCAGGTTGCTGCCCTTGGATATGATCCTCATTAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGGTGCCTCCCGCTTCTGCCTGCAGTTGGTTGGGACGGTGCACAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGGTGCCTCCCGCTTCTGCCTGCAGTTGGTTGGGACGGTGCACAACTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTACTCTGCCCAGAAGGTCGAGTACTCTGGGGGTCTCGGCCGACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTACTCTGCCCAGAAGGTCGAGTACTCTGGGGGTCTCGGCCGACAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTTCCATCTACACTGGCACTTCCTGAACTCAGCCACCTTCTGGTTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTTCCATCTACACTGGCACTTCCTGAACTCAGCCACCTTCTGGTTTTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTGGCTCAGTGTCCTGTTCTGTGTGAAGATTGCTAACATCACACACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTGGCTCAGTGTCCTGTTCTGTGTGAAGATTGCTAACATCACACACTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCTTCCTGTGGCTGAAGTGGAGGTTCCCAGGGTGGGTGCCCTGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCTTCCTGTGGCTGAAGTGGAGGTTCCCAGGGTGGGTGCCCTGGCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGTTGGGCTCTGTCCTGATCTCCTTCATCATAACCCTGCTGTTTTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGTTGGGCTCTGTCCTGATCTCCTTCATCATAACCCTGCTGTTTTTTTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTGAACTACCCTGTATATCAAGAATTTTTAATTAGAAAATTTTCTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTGAACTACCCTGTATATCAAGAATTTTTAATTAGAAAATTTTCTGGGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATGACCTACAAGTGGAATACAAGGATAGAAACATACTATTTCCCATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATGACCTACAAGTGGAATACAAGGATAGAAACATACTATTTCCCATCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAACTGGTCATCTGGTCAATTCCTTTTTCTGTTTTTCTGGTCTCAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAACTGGTCATCTGGTCAATTCCTTTTTCTGTTTTTCTGGTCTCAATT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATGCTGTTAATTAATTCTCTGAGGAGGCATACTCAGAGAATGCAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATGCTGTTAATTAATTCTCTGAGGAGGCATACTCAGAGAATGCAGCACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGGGCACAGCCTGCAGGACCCCAGCACCCAGGCTCACACCAGAGCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CGGGCACAGCCTGCAGGACCCCAGCACCCAGGCTCACACCAGAGCTCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGTCCCTCATCTCCTTCCTCATTCTTTATGCTCTGTCCTTTCTGTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGTCCCTCATCTCCTTCCTCATTCTTTATGCTCTGTCCTTTCTGTCCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCATTGATGCCGCAAAATTTATCTCCATGCAGAACGACTTTTACTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCATTGATGCCGCAAAATTTATCTCCATGCAGAACGACTTTTACTGGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 ATGGCAAATTGCAGTCTACCTGTGCATATCTGTCCATCCCTTCATCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 ATGGCAAATTGCAGTCTACCTGTGCATATCTGTCCATCCCTTCATCCTCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TCTTCAGCAACCTCAAGCTTCGAAGCGTGTTCTCGCAGCTCCTGTTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TCTTCAGCAACCTCAAGCTTCGAAGCGTGTTCTCGCAGCTCCTGTTGTTG

    900     .    :    .    :
    901 GCAAGGGGCTTCTGGGTGGCC
        |||||||||||||||||||||
 100901 GCAAGGGGCTTCTGGGTGGCC