seq1 = pF1KE5357.tfa, 927 bp
seq2 = pF1KE5357/gi568815586r_10896949.tfa (gi568815586r:10896949_11097875), 200927 bp

>pF1KE5357 927
>gi568815586r:10896949_11097875 (Chr12)

(complement)

1-927  (100001-100927)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGAGTTTTCTACACATTGTTTTTTCCATTCTAGTAGTGGTTGCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGAGTTTTCTACACATTGTTTTTTCCATTCTAGTAGTGGTTGCATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATTCTTGGAAATTTTGCCAATGGCTTTATAGCACTGATAAATTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATTCTTGGAAATTTTGCCAATGGCTTTATAGCACTGATAAATTTCATTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTCAGCTGATCAAATTATTGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGGTCAAGAGACAAAAGATCTCCTCAGCTGATCAAATTATTGCTGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGGCAGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTAATATTATTACATTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGGCAGTCTCCAGAGTTGGTTTGCTCTGGGTAATATTATTACATTGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TTCAACTGTGTTGAATCCAACTTCATCTAATTTAAAAGTAATAATTTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TTCAACTGTGTTGAATCCAACTTCATCTAATTTAAAAGTAATAATTTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTCTAATGCCTGGGCAGTAACCAATCATTTCAGCATCTGGCTTGCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTCTAATGCCTGGGCAGTAACCAATCATTTCAGCATCTGGCTTGCTACT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATCGTCAATTTCTCCAGACTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCCTCAGCATATTTTATTTGCTCAAGATCGTCAATTTCTCCAGACTTAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTTTCATCACTTAAAAAGGAAGGCTAAGAGTGTAGTTCTGGTGATAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TTTTCATCACTTAAAAAGGAAGGCTAAGAGTGTAGTTCTGGTGATAGTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGGGTCTTTGTTCTTTTTGGTTTGTCACCTTGTGATGAAACACACGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGGGTCTTTGTTCTTTTTGGTTTGTCACCTTGTGATGAAACACACGTAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATAAATGTGTGGACAGAAGAATGTGAAGGAAACGTAACTTGGAAGATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATAAATGTGTGGACAGAAGAATGTGAAGGAAACGTAACTTGGAAGATCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 ACTGAGGAATGCAATGCACCTTTCCAACTTGACTGTAGCCATGCTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 ACTGAGGAATGCAATGCACCTTTCCAACTTGACTGTAGCCATGCTAGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACTTGATACCATTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACTTGATACCATTCACTCTGACCCTGATATCTTTTCTGCTGTTAATCTAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TCTCTGTGTAAACATCTGAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TCTCTGTGTAAACATCTGAAGAAGATGCAGCTCCATGGCAAAGGATCTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGATCCCAGCACCAAGATCCACATAAAAGCTCTGCAAACTGTGACCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGATCCCAGCACCAAGATCCACATAAAAGCTCTGCAAACTGTGACCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TCCTCATATTACTTGCCATTTACTTTCTGTGTCTAATCATATCGTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TCCTCATATTACTTGCCATTTACTTTCTGTGTCTAATCATATCGTTTTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 AATTTTAAGATGCGACCAAAAGAAATTGTCTTAATGCTTTGCCAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 AATTTTAAGATGCGACCAAAAGAAATTGTCTTAATGCTTTGCCAAGCTTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGAATCATATATCCATCATTCCACTCATTCATTCTGATTTGGGGGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGAATCATATATCCATCATTCCACTCATTCATTCTGATTTGGGGGAACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 AGACGCTAAAGCAGACCTTTCTTTCAGTTTTGTGGCAGGTGACTTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 AGACGCTAAAGCAGACCTTTCTTTCAGTTTTGTGGCAGGTGACTTGCTGG

    900     .    :    .    :    .
    901 GCAAAAGGACAGAACCAGTCAACTCCA
        |||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCAAAAGGACAGAACCAGTCAACTCCA