seq1 = pF1KE5348.tfa, 855 bp
seq2 = pF1KE5348/gi568815590f_132677829.tfa (gi568815590f:132677829_132911131), 233303 bp

>pF1KE5348 855
>gi568815590f:132677829_132911131 (Chr8)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-255  (116582-116753)   100% ->
256-340  (116905-116989)   100% ->
341-429  (120944-121032)   100% ->
430-643  (125991-126204)   100% ->
644-769  (126787-126912)   100% ->
770-855  (133218-133303)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTAAAAAGCCCCCAAATCGCCCTGGAATCACTTTTGAGATTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTAAAAAGCCCCCAAATCGCCCTGGAATCACTTTTGAGATTGGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGTTTGGAGGCACTGGACTACTTACAAAAATG         GTATCCAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 TCGTTTGGAGGCACTGGACTACTTACAAAAATGGTA...GAGGTATCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CACGAATTGAAAAAATTGACTATGAGGAGGGCAAGATGTTGGTCCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116590 CACGAATTGAAAAAATTGACTATGAGGAGGGCAAGATGTTGGTCCATTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGCGCTGGAGTCATCGTTATGATGAGTGGATTTACTGGGATAGCAATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116640 GAGCGCTGGAGTCATCGTTATGATGAGTGGATTTACTGGGATAGCAATAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTGCGACCCCTTGAGAGACCAGCACTAAGAAAAGAAGGGCTAAAAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116690 ATTGCGACCCCTTGAGAGACCAGCACTAAGAAAAGAAGGGCTAAAAGATG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGAAGATTTCTTT         GATTTTAAAGCTGGAGAAGAAGTTCTG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 116740 AGGAAGATTTCTTTGTA...TAGGATTTTAAAGCTGGAGAAGAAGTTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GCTCGTTGGACAGACTGTCGCTATTACCCTGCCAAGATTGAAGCAATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116932 GCTCGTTGGACAGACTGTCGCTATTACCCTGCCAAGATTGAAGCAATTAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAAAGAAG         GAACATTTACAGTTCAGTTTTATGATGGAGTAA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 116982 CAAAGAAGGTA...CAGGAACATTTACAGTTCAGTTTTATGATGGAGTAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCGTTGTTTAAAAAGAATGCACATTAAAGCCATGCCCGAGGATGCTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120977 TTCGTTGTTTAAAAAGAATGCACATTAAAGCCATGCCCGAGGATGCTAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGGCAG         GATTGGATAGCTTTAGTCAAAGCAGCTGCTGCAGC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121027 GGGCAGGTA...GAGGATTGGATAGCTTTAGTCAAAGCAGCTGCTGCAGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGCAGCCAAGAACAAAACAGGGAGTAAACCTCGAACCAGCGCTAACAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126026 TGCAGCCAAGAACAAAACAGGGAGTAAACCTCGAACCAGCGCTAACAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ATAAAGATAAGGATAAAGATGAGAGAAAGTGGTTTAAAGTACCTTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126076 ATAAAGATAAGGATAAAGATGAGAGAAAGTGGTTTAAAGTACCTTCAAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAGGAGGAAACTTCAACTTGTATAGCCACACCAGACGTAGAGAAGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126126 AAGGAGGAAACTTCAACTTGTATAGCCACACCAGACGTAGAGAAGAAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 AGATCTGCCTACATCTAGTGAAACATTTG         GACTTCATGTAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 126176 AGATCTGCCTACATCTAGTGAAACATTTGGTA...TAGGACTTCATGTAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 AGAACGTTCCAAAGATGGTCTTTCCACAGCCAGAGAGCACATTATCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126799 AGAACGTTCCAAAGATGGTCTTTCCACAGCCAGAGAGCACATTATCAAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGAGGAAAAATAATCAAGGCAACTCGTTTCAGGCAAAGAGAGCTCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126849 AAGAGGAAAAATAATCAAGGCAACTCGTTTCAGGCAAAGAGAGCTCGACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAACAAGATTACTG         GTTTGTTGGCATCCAAAGCTGTTGGGG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 126899 TAACAAGATTACTGGTA...AAGGTTTGTTGGCATCCAAAGCTGTTGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TTGATGGTGCTGAAAAAAAGGAAGACTACAATGAAACAGCTCCAATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133245 TTGATGGTGCTGAAAAAAAGGAAGACTACAATGAAACAGCTCCAATGCTG

    900     .
    847 GAGCAGGTA
        |||||||||
 133295 GAGCAGGTA