seq1 = pF1KE5347.tfa, 864 bp
seq2 = pF1KE5347/gi568815579r_181391.tfa (gi568815579r:181391_391336), 209946 bp

>pF1KE5347 864
>gi568815579r:181391_391336 (Chr19)

(complement)

1-52  (100001-100052)   100% ->
53-204  (103166-103317)   100% ->
205-482  (103586-103863)   100% ->
483-540  (108528-108585)   100% ->
541-717  (109027-109203)   100% ->
718-864  (109800-109946)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCGGAGGTGGGTCTTCGTGCTGCTCGACGTGCTGTGCTTACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCGGAGGTGGGTCTTCGTGCTGCTCGACGTGCTGTGCTTACTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CG         CCTCCCTGCCCTTCGCTATCCTGACGCTGGTGAACGCCC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGTA...CAGCCTCCCTGCCCTTCGCTATCCTGACGCTGGTGAACGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CGTACAAGCGAGGATTTTACTGCGGGGATGACTCCATCCGGTACCCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103205 CGTACAAGCGAGGATTTTACTGCGGGGATGACTCCATCCGGTACCCCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CGTCCAGATACCATCACCCACGGGCTCATGGCTGGGGTCACCATCACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103255 CGTCCAGATACCATCACCCACGGGCTCATGGCTGGGGTCACCATCACGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACCGTCATCCTT         GTCTCGGCCGGGGAAGCCTACCTGGTGT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103305 CACCGTCATCCTTGTA...CAGGTCTCGGCCGGGGAAGCCTACCTGGTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACACAGACCGGCTCTATTCTCGCTCGGACTTCAACAACTACGTGGCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103614 ACACAGACCGGCTCTATTCTCGCTCGGACTTCAACAACTACGTGGCTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTATACAAGGTGCTGGGGACCTTCCTGTTTGGGGCTGCCGTGAGCCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103664 GTATACAAGGTGCTGGGGACCTTCCTGTTTGGGGCTGCCGTGAGCCAGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTGACAGACCTGGCCAAGTACATGATTGGGCGTCTGAGGCCCAACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103714 TCTGACAGACCTGGCCAAGTACATGATTGGGCGTCTGAGGCCCAACTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TAGCCGTCTGCGACCCCGACTGGAGCCGGGTCAACTGCTCGGTCTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103764 TAGCCGTCTGCGACCCCGACTGGAGCCGGGTCAACTGCTCGGTCTATGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CAGCTGGAGAAGGTGTGCAGGGGAAACCCTGCTGATGTCACCGAGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103814 CAGCTGGAGAAGGTGTGCAGGGGAAACCCTGCTGATGTCACCGAGGCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483          GTTGTCTTTCTACTCGGGACACTCTTCCTTTGGGATGTACT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103864 GTG...CAGGTTGTCTTTCTACTCGGGACACTCTTCCTTTGGGATGTACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCATGGTGTTCTTGGCG         CTGTATGTGCAGGCACGACTCTGT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 108569 GCATGGTGTTCTTGGCGGTG...CAGCTGTATGTGCAGGCACGACTCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TGGAAGTGGGCACGGCTGCTGCGACCCACAGTCCAGTTCTTCCTGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109051 TGGAAGTGGGCACGGCTGCTGCGACCCACAGTCCAGTTCTTCCTGGTGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CTTTGCCCTCTACGTGGGCTACACCCGCGTGTCTGATTACAAACACCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109101 CTTTGCCCTCTACGTGGGCTACACCCGCGTGTCTGATTACAAACACCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GGAGCGATGTCCTTGTTGGCCTCCTGCAGGGGGCACTGGTGGCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109151 GGAGCGATGTCCTTGTTGGCCTCCTGCAGGGGGCACTGGTGGCTGCCCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ACT         GTCTGCTACATCTCAGACTTCTTCAAAGCCCGACCCCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109201 ACTGTG...CAGGTCTGCTACATCTCAGACTTCTTCAAAGCCCGACCCCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ACAGCACTGTCTGAAGGAGGAGGAGCTGGAACGGAAGCCCAGCCTGTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109838 ACAGCACTGTCTGAAGGAGGAGGAGCTGGAACGGAAGCCCAGCCTGTCAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TGACGTTGACCCTGGGCGAGGCTGACCACAACCACTATGGATACCCGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109888 TGACGTTGACCCTGGGCGAGGCTGACCACAACCACTATGGATACCCGCAC

    900     .
    856 TCCTCCTCC
        |||||||||
 109938 TCCTCCTCC