seq1 = pF1KE5326.tfa, 834 bp
seq2 = pF1KE5326/gi568815585r_27335678.tfa (gi568815585r:27335678_27540448), 204771 bp

>pF1KE5326 834
>gi568815585r:27335678_27540448 (Chr13)

(complement)

1-460  (100001-100460)   99% ->
461-618  (103176-103333)   100% ->
619-834  (104556-104771)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCTCTTTTTCTAAAGAGGTTAACACTACAAACTGTAAAGTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCTCTTTTTCTAAAGAGGTTAACACTACAAACTGTAAAGTCTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AAATAGTTGCATTAGATGTTTTGGTAAACACATCCTGCAAAAGACAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AAATAGTTGCATTAGATGTTTTGGTAAACACATCCTGCAAAAGACAGCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CAGCACAGTTGTCCCCTATTGCTTCTGCCCCAAGACTCTCCTTCCTAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CAGCACAGTTGTCCCCTATTGCTTCTGCCCCAAGACTCTCCTTCCTAATT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CATGCAAAAGCCTTTAGTACCGCTGAAGACACCCAGAATGAAGGAAAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CATGCAAAAGCCTTTAGTACCGCTGAAGACACCCAGAATGAAGGAAAAAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GATAAAAAAGAATAAAACAGCTTTTAGTAACGTTGGAAGAAAAATTAGTC
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GACAAAAAAGAATAAAACAGCTTTTAGTAACGTTGGAAGAAAAATTAGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGCGAGTTATTCACTTATTTGATGAGAAGGGCAATGATTTGGGAAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AGCGAGTTATTCACTTATTTGATGAGAAGGGCAATGATTTGGGAAACATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACCGAGCAAATGTGATTAGACTTATGGATGAGCGAGACCTGCGACTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CACCGAGCAAATGTGATTAGACTTATGGATGAGCGAGACCTGCGACTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TCAAAGGAACACCAGCACAGAACCTGCAGAGTATCAGCTCATGACAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TCAAAGGAACACCAGCACAGAACCTGCAGAGTATCAGCTCATGACAGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCAGATCCTCCAGGAGCGGCAGAGGCTGAGGGAGATGGAGAAGGCGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCAGATCCTCCAGGAGCGGCAGAGGCTGAGGGAGATGGAGAAGGCGAAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCCAAAACTG         GACCAACCCTGAGAAAGGAACTGATTTTGTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCAAAACTGGTA...CAGGACCAACCCTGAGAAAGGAACTGATTTTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 TTCAAATATTGGACAACATGATTTGGACACAAAGACTAAACAGATTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103207 TTCAAATATTGGACAACATGATTTGGACACAAAGACTAAACAGATTCAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGTGGATTAAGAAAAAACACCTAGTCCAGATTACCATAAAGAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103257 AGTGGATTAAGAAAAAACACCTAGTCCAGATTACCATAAAGAAAGGAAAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 AATGTAGACGTGTCAGAAAATGAAATG         GAGGAGATATTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 103307 AATGTAGACGTGTCAGAAAATGAAATGGTA...TAGGAGGAGATATTTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCAAATACTCCAGACTATGCCTGGAATAGCTACATTCTCATCTAGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104570 TCAAATACTCCAGACTATGCCTGGAATAGCTACATTCTCATCTAGGCCAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AAGCTGTTCAAGGAGGAAAAGCTTTAATGTGTGTTCTTCGTGCTTTGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 104620 AAGCTGTTCAAGGAGGAAAAGCTTTAATGTGTGTTCTTCGTGCTTTCAGC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AAAAATGAGGAGAAGGCATATAAAGAAACTCAAGAGACCCAGGAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104670 AAAAATGAGGAGAAGGCATATAAAGAAACTCAAGAGACCCAGGAAAGAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CACTTTGAACAAAGACCATGGAAATGATAAGGAATCAAATGTTCTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104720 CACTTTGAACAAAGACCATGGAAATGATAAGGAATCAAATGTTCTGCATC

    850 
    833 AG
        ||
 104770 AG